54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0697 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0697  putative cytochrome C  100 
 
 		 97 aa  201  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3676  cytochrome c, class I  67.01 
 
 		 123 aa  140  6e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848793  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0146  cytochrome c class I  60.42 
 
 		 115 aa  124  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1922  sulfur oxidation protein SoxX  49.43 
 
 		 115 aa  92.8  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.113133  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0604  cytochrome c, class I  48.45 
 
 		 124 aa  92.4  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.24563  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0811  sulfur oxidation protein SoxX  43.16 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000641747  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3043  cytochrome c, class I  47.67 
 
 		 114 aa  88.6  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.372249  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0917  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  44.21 
 
 		 121 aa  85.9  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.613288  normal  0.828483 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1907  cytochrome c, class I  43.68 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000266985  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0567  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  42.7 
 
 		 120 aa  72.4  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000813905  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3671  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  32.71 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4156  cytochrome c class I  34.62 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3918  hypothetical protein  33.03 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.32539 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0314  hypothetical protein  32.18 
 
 		 169 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.600566  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1157  hypothetical protein  34.31 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4373  hypothetical protein  38.46 
 
 		 245 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4962  hypothetical protein  38.46 
 
 		 247 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.640591  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6956  cytochrome c class I  32.32 
 
 		 180 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0327018 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4760  cytochrome c oxidase subunit II  30.1 
 
 		 327 aa  47  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal  0.0836993 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1909  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  29.7 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00277827  normal  0.155687 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7668  cytochrome c class I  30.19 
 
 		 181 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0434  hypothetical protein  39.74 
 
 		 227 aa  45.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3452  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  33.75 
 
 		 190 aa  45.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4150  cytochrome c, class I  27.78 
 
 		 157 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3336  cytochrome c class I  31.94 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0198059  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0104  cytochrome c oxidase subunit II  31.71 
 
 		 359 aa  45.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  32.38 
 
 		 399 aa  44.7  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2807  cytochrome c  25.45 
 
 		 160 aa  44.7  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.294735 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3334  cytochrome c family protein, putative  32.95 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.115462  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4257  hypothetical protein  33.33 
 
 		 256 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.629836  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1229  cytochrome c class I  34.12 
 
 		 98 aa  43.9  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0910  cytochrome c class I  30.56 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.58157e-33 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2727  putative cytochrome c protein  27.38 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0260  monoheme cytochrome SoxX  30.3 
 
 		 174 aa  43.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00749516  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3017  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorB  30.53 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.526573 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2860  hypothetical protein  32.47 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0066  putative cytochrome c, putative SoxX protein  28.44 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  28.09 
 
 		 213 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3717  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  28.71 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000435088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3129  hypothetical protein  33.77 
 
 		 215 aa  41.6  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0102671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2759  cytochrome c class I  39.62 
 
 		 253 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2280  hypothetical protein  31.96 
 
 		 210 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  30.56 
 
 		 382 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  30.56 
 
 		 382 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0806  hypothetical protein  32.47 
 
 		 212 aa  41.6  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2626  hypothetical protein  34.52 
 
 		 218 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1455  cytochrome c class I  27.72 
 
 		 278 aa  41.2  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000371587  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3662  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  37.04 
 
 		 294 aa  41.2  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.839971 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0854  hypothetical protein  30.26 
 
 		 232 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00309034  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1523  hypothetical protein  32.47 
 
 		 204 aa  40.8  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.547199 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3419  hypothetical protein  32.1 
 
 		 220 aa  40.4  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3779  hypothetical protein  33.33 
 
 		 220 aa  40.4  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1595  hypothetical protein  31.63 
 
 		 210 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1671  hypothetical protein  31.63 
 
 		 210 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>