51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1019 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1019  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  591  1e-168  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0773  cytochrome c, class I  44.92 
 
 		 326 aa  153  4e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3450  cytochrome c, class I  43.64 
 
 		 326 aa  149  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.60831  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0328  cytochrome c, class I  36.47 
 
 		 262 aa  145  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000605449  hitchhiker  0.0000000937241 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0202  cytochrome c class I  37.23 
 
 		 264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4298  electron transport protein SCO1/SenC  43.81 
 
 		 356 aa  102  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576554  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  39.64 
 
 		 363 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  41.67 
 
 		 327 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  40.74 
 
 		 327 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0650  electron transport protein SCO1/SenC  40.2 
 
 		 340 aa  91.3  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  41.49 
 
 		 327 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3594  hypothetical protein  37.6 
 
 		 172 aa  85.5  9e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516633 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0251  cytochrome c class I  38.46 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2651  cytochrome c, class I  37.8 
 
 		 158 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.583086  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1634  cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 444 aa  68.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3477  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 425 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333881  normal  0.501976 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2061  multicopper oxidase domain-containing protein  36.9 
 
 		 535 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429703  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1966  multicopper oxidase domain-containing protein  35.71 
 
 		 535 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328521  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0477  mulitcopper oxidase domain-containing protein  32.98 
 
 		 487 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1709  hypothetical protein  35.21 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0053762  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0944  mulitcopper oxidase domain-containing protein  32.67 
 
 		 487 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0798  mulitcopper oxidase domain-containing protein  35.71 
 
 		 535 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0548  mulitcopper oxidase domain-containing protein  32.98 
 
 		 487 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181487  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0659  mulitcopper oxidase domain-containing protein  35.71 
 
 		 535 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870882  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1613  multicopper oxidase domain-containing protein  35.71 
 
 		 535 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0529  cytochrome c class I  35.58 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0692  cytochrome c class I  32.97 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.189823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5664  cytochrome c class I  40.54 
 
 		 443 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1780  hypothetical protein  33.1 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.882538  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2169  hypothetical protein  34.04 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2297  hypothetical protein  34.12 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2213  cytochrome c, mono- and diheme variant  28.45 
 
 		 435 aa  59.3  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01315  Cytochrome c3  33.33 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1274  cytochrome c class I  35.71 
 
 		 166 aa  54.3  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0408  hypothetical protein  26.26 
 
 		 149 aa  55.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0357243  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2573  hypothetical protein  35.94 
 
 		 593 aa  50.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.122591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  31.4 
 
 		 382 aa  50.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2676  hypothetical protein  29.19 
 
 		 269 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.543217 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  31.4 
 
 		 382 aa  50.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0446  cytochrome c class I  32.97 
 
 		 169 aa  49.7  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000163065  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0963  cytochrome c, class I  29.19 
 
 		 268 aa  49.3  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0745087 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3334  cytochrome c family protein, putative  32.22 
 
 		 104 aa  46.2  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.115462  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1891  cytochrome c class I  27.5 
 
 		 259 aa  45.8  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.527374  hitchhiker  0.000337472 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3251  cytochrome c class I  25.82 
 
 		 277 aa  45.8  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0775555 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15700  cytochrome c, mono- and diheme variants family  26.94 
 
 		 259 aa  45.8  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.871134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7362  cytochrome c oxidase, subunit II  30.97 
 
 		 394 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2076  cytochrome c class I  27.14 
 
 		 261 aa  43.9  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0910  cytochrome c class I  34.09 
 
 		 117 aa  43.5  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.58157e-33 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1295  cytochrome c class I  24.58 
 
 		 276 aa  43.5  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.669902 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1447  cytochrome c class I  28.79 
 
 		 284 aa  42.7  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0356963  normal  0.171198 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3336  cytochrome c class I  34.12 
 
 		 117 aa  42.7  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0198059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>