35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_38850 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3311  cytochrome c550  100 
 
 		 145 aa  300  6.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38850  cytochrome c550  100 
 
 		 145 aa  300  6.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1958  hypothetical protein  77.87 
 
 		 139 aa  201  4e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.054097  normal  0.381624 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3128  cytochrome c class I  66.67 
 
 		 153 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242172  normal  0.346384 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2675  cytochrome c-type protein  66.67 
 
 		 153 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3088  cytochrome c, class I  66.67 
 
 		 161 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1857  cytochrome c550  56.34 
 
 		 146 aa  163  6.9999999999999995e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1001  cytochrome c550  60.45 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2257  cytochrome c550  57.35 
 
 		 161 aa  159  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1890  cytochrome c550  58.09 
 
 		 146 aa  158  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506837  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1538  cytochrome c550  56.03 
 
 		 140 aa  154  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.866024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1337  cytochrome c550  56.03 
 
 		 140 aa  154  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.807392 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4871  cytochrome c550  56.03 
 
 		 140 aa  154  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.15236 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3622  cytochrome c550  61.48 
 
 		 144 aa  151  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.257  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2411  cytochrome c550  62.71 
 
 		 142 aa  148  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.67158 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0691  hypothetical protein  55.83 
 
 		 165 aa  142  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0439304  normal  0.48902 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2485  cytochrome c-type protein  52.82 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0900687 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2091  cytochrome c550 protein; ethanol oxydation system  52.82 
 
 		 175 aa  141  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.397265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2814  cytochrome c class I  58.47 
 
 		 149 aa  140  6e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.482319  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1789  cytochrome c550  51.09 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000264045 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1777  cytochrome c-type protein  50.33 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.948754  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2663  hypothetical protein  52.27 
 
 		 224 aa  137  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.198171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0480  cytochrome c550  50 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.594777  normal  0.0444818 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6249  cytochrome c550  48.59 
 
 		 164 aa  135  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0736  cytochrome c-type protein  49.66 
 
 		 173 aa  124  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0797624  normal  0.0836631 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2730  cytochrome c550, putative  41.43 
 
 		 148 aa  99.4  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0787829  normal  0.668449 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0474  hypothetical protein  32.26 
 
 		 169 aa  80.9  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2696  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  41.56 
 
 		 726 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3041  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  29.35 
 
 		 286 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1236  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  28.26 
 
 		 286 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.385578  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1306  Pyrrolo-quinoline quinone  33.33 
 
 		 738 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0575142 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0910  cytochrome c class I  32.91 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.58157e-33 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0936  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.14 
 
 		 321 aa  41.6  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1809  cytochrome c class I  30.68 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11331  cytochrome cM  27.37 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.969799 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>