57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1816 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1816  hypothetical protein  100 
 
 		 349 aa  723    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000760007  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1919  cytochrome c subfamily protein  80.8 
 
 		 346 aa  590  1e-167  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1450  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  57.88 
 
 		 341 aa  415  9.999999999999999e-116  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.20363  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1318  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  47.12 
 
 		 374 aa  349  4e-95  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0545  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  46.86 
 
 		 374 aa  347  2e-94  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1833  cytochrome c subfamily protein  49.57 
 
 		 288 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.135185  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0742  cytochrome c subfamily protein  49.57 
 
 		 288 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1095  ubiquinol cytochrome c oxidoreductase, cytochrome c1 subunit  45.14 
 
 		 375 aa  335  5.999999999999999e-91  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1199  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  46.6 
 
 		 374 aa  331  1e-89  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1236  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  47.38 
 
 		 367 aa  330  2e-89  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1919  ubiquinol cytochrome c oxidoreductase, cytochrome C1 subunit  37.57 
 
 		 315 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233751  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1455  cytochrome c class I  36.96 
 
 		 278 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000371587  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0803  cytochrome c1  23.45 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000755074  hitchhiker  0.00778647 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0572  cytochrome c1  24.78 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00834423  normal  0.355949 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4164  cytochrome c1  25.22 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0116839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3534  cytochrome c1  23.94 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000922213  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3019  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c1 subunit  22.51 
 
 		 232 aa  58.5  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00018062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3199  cytochrome c1  22.22 
 
 		 231 aa  54.3  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.663491  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0610  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  21.69 
 
 		 231 aa  53.5  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0603  cytochrome c1  21.16 
 
 		 232 aa  53.1  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0224721  hitchhiker  0.00000571786 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0604  cytochrome c1  21.16 
 
 		 232 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000593  normal  0.0809473 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3426  cytochrome c1  21.16 
 
 		 232 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0003058  normal  0.104383 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0993  cytochrome c1  26.85 
 
 		 219 aa  52  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.697791  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3274  cytochrome c1  20.63 
 
 		 232 aa  51.6  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0283583  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0751  cytochrome c1  24.32 
 
 		 250 aa  50.4  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0945236  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3704  cytochrome c1  20.11 
 
 		 231 aa  49.7  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00197574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0564  cytochrome c1  20.11 
 
 		 231 aa  49.3  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000336048  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0416  putative cytochrome C1 transmembrane protein  23.11 
 
 		 251 aa  49.3  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3542  cytochrome c1  22.64 
 
 		 251 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608845  normal  0.0250819 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3887  cytochrome c1  20.11 
 
 		 232 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2741  cytochrome c1  22.64 
 
 		 251 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3761  cytochrome c1  20.11 
 
 		 232 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000196164  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2468  cytochrome c1  38.33 
 
 		 251 aa  47.8  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0366705  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3699  cytochrome c1  20.48 
 
 		 244 aa  47.4  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.201159  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2217  cytochrome c1  25.71 
 
 		 247 aa  46.6  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.123472 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2660  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome C1  19.2 
 
 		 245 aa  46.6  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0667489  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1535  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c1 subunit  25.22 
 
 		 236 aa  46.2  0.0007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000513902  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1831  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c1 subunit  23.81 
 
 		 241 aa  45.8  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.188895 
 
 
-
 
NC_002978  WD1070  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  26.23 
 
 		 252 aa  45.4  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3305  cytochrome c1  19.6 
 
 		 244 aa  45.4  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3228  cytochrome c1  21.43 
 
 		 247 aa  45.8  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0522  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  26.77 
 
 		 252 aa  45.4  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0503999  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2631  hypothetical protein  21.43 
 
 		 246 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2872  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  19.51 
 
 		 243 aa  45.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0293144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0297  cytochrome c1  21.08 
 
 		 240 aa  44.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.434279  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3161  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  19.3 
 
 		 747 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389145  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2758  hypothetical protein  21.43 
 
 		 248 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00885  ubiquinol-cytochrome c reductase  21.23 
 
 		 245 aa  44.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0137  cytochrome c1  21.27 
 
 		 257 aa  43.9  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.148946 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57540  putative cytochrome c1 precursor  19.38 
 
 		 260 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004507  ubiquinol cytochrome C oxidoreductase cytochrome C1 subunit  21.23 
 
 		 245 aa  43.9  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000302738  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5001  putative cytochrome c1 precursor  19.38 
 
 		 260 aa  43.5  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112049  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0127  cytochrome c1  21.72 
 
 		 257 aa  43.1  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0525293  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0156  cytochrome c1  19.25 
 
 		 285 aa  43.5  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.221677 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0851  cytochrome c1 precursor  28.79 
 
 		 255 aa  43.5  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.815731 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3091  cytochrome c1  21.15 
 
 		 247 aa  43.1  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3334  cytochrome c family protein, putative  30.43 
 
 		 104 aa  42.7  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.115462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>