31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0434 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0434  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  474  1e-133  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0433  hypothetical protein  64.35 
 
 
229 aa  286  1e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0854  hypothetical protein  53.33 
 
 
232 aa  224  6e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00309034  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0856  hypothetical protein  46.43 
 
 
233 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.097776  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1671  hypothetical protein  42.35 
 
 
210 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1595  hypothetical protein  42.35 
 
 
210 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0858  hypothetical protein  46.88 
 
 
236 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3129  hypothetical protein  36.32 
 
 
215 aa  137  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0102671  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2280  hypothetical protein  42.35 
 
 
210 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1523  hypothetical protein  43.48 
 
 
204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.547199 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0806  hypothetical protein  40.59 
 
 
212 aa  128  6e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2433  hypothetical protein  42.51 
 
 
212 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3255  hypothetical protein  43.75 
 
 
213 aa  128  8.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4373  hypothetical protein  49.19 
 
 
245 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1033  hypothetical protein  34.93 
 
 
212 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3779  hypothetical protein  41.42 
 
 
220 aa  122  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3251  hypothetical protein  42.33 
 
 
224 aa  122  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0774405  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3125  hypothetical protein  42.14 
 
 
220 aa  121  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4962  hypothetical protein  47.58 
 
 
247 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.640591  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4257  hypothetical protein  39.51 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.629836  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3453  hypothetical protein  40.88 
 
 
220 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3419  hypothetical protein  45.9 
 
 
220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2626  hypothetical protein  33.62 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112136  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2862  cytochrome c class I  39.66 
 
 
187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3450  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  35.23 
 
 
184 aa  102  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2860  hypothetical protein  37.93 
 
 
191 aa  102  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3452  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  39.24 
 
 
190 aa  93.6  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0697  putative cytochrome C  39.24 
 
 
97 aa  45.4  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0314  hypothetical protein  37.66 
 
 
169 aa  45.4  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.600566  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0146  cytochrome c class I  36.36 
 
 
115 aa  45.1  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0822  nitric oxide reductase, cytochrome c-containing subunit  30.85 
 
 
277 aa  42  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198002  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>