38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4962 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4962  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.640591  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4373  hypothetical protein  74.19 
 
 		 245 aa  361  7.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4257  hypothetical protein  68.24 
 
 		 256 aa  341  7e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.629836  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1523  hypothetical protein  61.8 
 
 		 204 aa  224  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.547199 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3251  hypothetical protein  51.1 
 
 		 224 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0774405  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3129  hypothetical protein  42.39 
 
 		 215 aa  186  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0102671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3419  hypothetical protein  45.75 
 
 		 220 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3255  hypothetical protein  53.25 
 
 		 213 aa  179  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3125  hypothetical protein  46.83 
 
 		 220 aa  178  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1671  hypothetical protein  48.26 
 
 		 210 aa  175  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1595  hypothetical protein  48.26 
 
 		 210 aa  175  6e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3453  hypothetical protein  51.95 
 
 		 220 aa  172  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2280  hypothetical protein  48.26 
 
 		 210 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2626  hypothetical protein  45.12 
 
 		 218 aa  158  7e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2433  hypothetical protein  50 
 
 		 212 aa  152  5e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1033  hypothetical protein  46.54 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3779  hypothetical protein  45.78 
 
 		 220 aa  149  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0858  hypothetical protein  39.89 
 
 		 236 aa  145  8.000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0806  hypothetical protein  43.4 
 
 		 212 aa  143  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0854  hypothetical protein  42.59 
 
 		 232 aa  132  6e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00309034  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3450  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  41.18 
 
 		 184 aa  125  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2862  cytochrome c class I  42.11 
 
 		 187 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0856  hypothetical protein  39.51 
 
 		 233 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.097776  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0434  hypothetical protein  47.58 
 
 		 227 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0433  hypothetical protein  38.55 
 
 		 229 aa  112  5e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2860  hypothetical protein  32.43 
 
 		 191 aa  104  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3452  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  37.67 
 
 		 190 aa  95.5  8e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0314  hypothetical protein  32.5 
 
 		 169 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.600566  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0811  sulfur oxidation protein SoxX  32.35 
 
 		 115 aa  53.1  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000641747  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3043  cytochrome c, class I  38.46 
 
 		 114 aa  50.4  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.372249  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1922  sulfur oxidation protein SoxX  33.33 
 
 		 115 aa  47.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.113133  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0697  putative cytochrome C  38.46 
 
 		 97 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0604  cytochrome c, class I  31.65 
 
 		 124 aa  45.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.24563  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3671  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  34.48 
 
 		 135 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4156  cytochrome c class I  28.33 
 
 		 158 aa  42.7  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3676  cytochrome c, class I  32.14 
 
 		 123 aa  42.4  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848793  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0567  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  33.75 
 
 		 120 aa  42  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000813905  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0518  sulfur oxidation protein SoxX  30.58 
 
 		 183 aa  42  0.01  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00404971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>