35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2280 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2280  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  428  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1671  hypothetical protein  96.19 
 
 
210 aa  387  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1595  hypothetical protein  96.19 
 
 
210 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3125  hypothetical protein  56.68 
 
 
220 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3255  hypothetical protein  60.12 
 
 
213 aa  220  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3251  hypothetical protein  55.31 
 
 
224 aa  219  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0774405  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3453  hypothetical protein  58.96 
 
 
220 aa  217  7.999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3419  hypothetical protein  50.93 
 
 
220 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2626  hypothetical protein  47.87 
 
 
218 aa  200  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112136  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3779  hypothetical protein  49.47 
 
 
220 aa  199  3.9999999999999996e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0806  hypothetical protein  43.78 
 
 
212 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2433  hypothetical protein  49.46 
 
 
212 aa  185  5e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1033  hypothetical protein  44.88 
 
 
212 aa  182  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3129  hypothetical protein  46.31 
 
 
215 aa  179  4e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0102671  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4962  hypothetical protein  48.26 
 
 
247 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.640591  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4257  hypothetical protein  47.67 
 
 
256 aa  174  9e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.629836  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1523  hypothetical protein  48.24 
 
 
204 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.547199 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4373  hypothetical protein  46.51 
 
 
245 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0434  hypothetical protein  42.35 
 
 
227 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0854  hypothetical protein  41.18 
 
 
232 aa  140  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00309034  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0856  hypothetical protein  36.84 
 
 
233 aa  140  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.097776  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3450  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  41.09 
 
 
184 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0858  hypothetical protein  42.93 
 
 
236 aa  137  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0433  hypothetical protein  37.65 
 
 
229 aa  129  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2862  cytochrome c class I  42.11 
 
 
187 aa  129  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2860  hypothetical protein  42.95 
 
 
191 aa  121  8e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3452  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  46.45 
 
 
190 aa  118  7e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0811  sulfur oxidation protein SoxX  36.29 
 
 
115 aa  55.8  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000641747  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0314  hypothetical protein  33.65 
 
 
169 aa  55.1  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.600566  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1922  sulfur oxidation protein SoxX  36.63 
 
 
115 aa  53.5  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.113133  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1907  cytochrome c, class I  33.08 
 
 
126 aa  51.6  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000266985  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1948  hypothetical protein  32.94 
 
 
484 aa  48.1  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3043  cytochrome c, class I  37.18 
 
 
114 aa  45.4  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.372249  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3717  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  28.21 
 
 
144 aa  41.6  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000435088  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1909  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  27.5 
 
 
150 aa  41.6  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00277827  normal  0.155687 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>