33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3255 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3255  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  441  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3125  hypothetical protein  84.29 
 
 		 220 aa  348  4e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3453  hypothetical protein  84.74 
 
 		 220 aa  326  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3251  hypothetical protein  66.85 
 
 		 224 aa  274  8e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0774405  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3419  hypothetical protein  62.68 
 
 		 220 aa  271  7e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1595  hypothetical protein  57.75 
 
 		 210 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1671  hypothetical protein  57.22 
 
 		 210 aa  220  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2280  hypothetical protein  57.22 
 
 		 210 aa  214  7e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3779  hypothetical protein  52.88 
 
 		 220 aa  200  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2626  hypothetical protein  50.27 
 
 		 218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2433  hypothetical protein  52.31 
 
 		 212 aa  196  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4373  hypothetical protein  44.21 
 
 		 245 aa  193  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0806  hypothetical protein  50.27 
 
 		 212 aa  194  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1033  hypothetical protein  45.87 
 
 		 212 aa  193  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4962  hypothetical protein  45.71 
 
 		 247 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.640591  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3129  hypothetical protein  43.06 
 
 		 215 aa  181  6e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0102671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4257  hypothetical protein  53.9 
 
 		 256 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.629836  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1523  hypothetical protein  42.33 
 
 		 204 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.547199 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3450  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  39.9 
 
 		 184 aa  137  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0854  hypothetical protein  42.69 
 
 		 232 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00309034  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0856  hypothetical protein  44.19 
 
 		 233 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.097776  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0434  hypothetical protein  43.75 
 
 		 227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2862  cytochrome c class I  41.92 
 
 		 187 aa  125  5e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0433  hypothetical protein  41.77 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2860  hypothetical protein  43.33 
 
 		 191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0858  hypothetical protein  42.41 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3452  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  42.68 
 
 		 190 aa  102  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0314  hypothetical protein  31.75 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.600566  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0811  sulfur oxidation protein SoxX  32.69 
 
 		 115 aa  50.1  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000641747  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0604  cytochrome c, class I  28.28 
 
 		 124 aa  45.8  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.24563  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1922  sulfur oxidation protein SoxX  31.58 
 
 		 115 aa  44.3  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.113133  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1948  hypothetical protein  32.05 
 
 		 484 aa  42.7  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0567  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  32.97 
 
 		 120 aa  41.6  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000813905  normal  0.590405 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>