35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2862 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2862  cytochrome c class I  100 
 
 		 187 aa  390  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3450  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  56.76 
 
 		 184 aa  234  5.0000000000000005e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2860  hypothetical protein  55.61 
 
 		 191 aa  211  5.999999999999999e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3452  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  53.94 
 
 		 190 aa  180  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3129  hypothetical protein  42.7 
 
 		 215 aa  136  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0102671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1671  hypothetical protein  42.11 
 
 		 210 aa  128  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1595  hypothetical protein  42.11 
 
 		 210 aa  128  6e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2280  hypothetical protein  42.11 
 
 		 210 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4373  hypothetical protein  41.45 
 
 		 245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3255  hypothetical protein  41.92 
 
 		 213 aa  125  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4962  hypothetical protein  42.11 
 
 		 247 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.640591  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3251  hypothetical protein  44.59 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0774405  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3419  hypothetical protein  39.77 
 
 		 220 aa  120  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3453  hypothetical protein  40.12 
 
 		 220 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3125  hypothetical protein  39.53 
 
 		 220 aa  117  9e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0856  hypothetical protein  40 
 
 		 233 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.097776  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4257  hypothetical protein  38.16 
 
 		 256 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.629836  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3779  hypothetical protein  36.31 
 
 		 220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0434  hypothetical protein  39.66 
 
 		 227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0854  hypothetical protein  36.78 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00309034  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0858  hypothetical protein  35.52 
 
 		 236 aa  106  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1523  hypothetical protein  34.48 
 
 		 204 aa  104  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.547199 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2626  hypothetical protein  34.8 
 
 		 218 aa  102  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1033  hypothetical protein  34.42 
 
 		 212 aa  102  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0806  hypothetical protein  32.99 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0433  hypothetical protein  34.86 
 
 		 229 aa  97.8  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2433  hypothetical protein  34.02 
 
 		 212 aa  95.9  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0314  hypothetical protein  37.36 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.600566  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0811  sulfur oxidation protein SoxX  37.93 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000641747  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1922  sulfur oxidation protein SoxX  39.08 
 
 		 115 aa  52.4  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.113133  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0917  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  32.58 
 
 		 121 aa  46.6  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.613288  normal  0.828483 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0567  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  33.71 
 
 		 120 aa  46.6  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000813905  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0518  sulfur oxidation protein SoxX  31.43 
 
 		 183 aa  45.1  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00404971  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3560  di-haem cytochrome c peroxidase  33.33 
 
 		 448 aa  41.2  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0200  cytochrome c class I  27.87 
 
 		 743 aa  40.8  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>