32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0200 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0200  cytochrome c class I  100 
 
 
743 aa  1557    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2850  cytochrome c class I  27.54 
 
 
312 aa  117  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2122  cytochrome c, class I  27.44 
 
 
312 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.959895  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2403  hypothetical protein  24.33 
 
 
428 aa  98.6  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.102339  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0243  hypothetical protein  26.49 
 
 
409 aa  96.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1555  hypothetical protein  24.33 
 
 
428 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1460  hypothetical protein  24.33 
 
 
428 aa  95.9  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1438  hypothetical protein  21.39 
 
 
828 aa  87.8  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.45862  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2650  cytochrome c, class I  25.63 
 
 
225 aa  71.6  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1581  PA14 domain protein  25 
 
 
969 aa  60.1  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3283  cytochrome c, class I  25.75 
 
 
225 aa  59.3  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86015  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1791  hypothetical protein  21.88 
 
 
233 aa  52.8  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1236  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  26.92 
 
 
367 aa  49.3  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1455  cytochrome c class I  25.49 
 
 
278 aa  49.7  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000371587  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2093  cytochrome c oxidase cbb3-type subunit II  26.25 
 
 
243 aa  49.3  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0892141  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0697  cytochrome c oxidase, subunit II  31.18 
 
 
322 aa  48.5  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5244  cytochrome c oxidase, subunit II  29.41 
 
 
326 aa  48.9  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.868201 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2759  cytochrome c class I  24.43 
 
 
253 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  29.55 
 
 
330 aa  46.6  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0096  cytochrome c oxidase, subunit II  29.67 
 
 
334 aa  45.8  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2991  cytochrome c oxidase, subunit II  29.79 
 
 
338 aa  45.8  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336386  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2347  cytochrome c oxidase, subunit II  29.79 
 
 
334 aa  45.8  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5934  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II  25.14 
 
 
243 aa  45.4  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632943  normal  0.24446 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6267  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II  25.14 
 
 
243 aa  45.4  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0877464 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0771  cytochrome c oxidase, subunit II  27.37 
 
 
381 aa  44.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315373  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0783  cytochrome c oxidase, subunit II  27.37 
 
 
372 aa  44.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  28.28 
 
 
354 aa  44.7  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0945  cytochrome oxidase subunit II  27.37 
 
 
372 aa  45.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2072  cytochrome c oxidase, subunit II  25.69 
 
 
425 aa  44.7  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.54281 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09157  Glutaminyl-tRNA synthetase (Eurofung)  25.84 
 
 
628 aa  44.7  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0742  cytochrome c subfamily protein  24 
 
 
288 aa  44.3  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1833  cytochrome c subfamily protein  24 
 
 
288 aa  44.3  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.135185  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>