73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1021 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1021  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c subunit  100 
 
 		 307 aa  630  1e-180  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.121328  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3134  cytochrome c class I  61.98 
 
 		 311 aa  380  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1295  cytochrome c class I  42.16 
 
 		 276 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.669902 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2676  hypothetical protein  44.12 
 
 		 269 aa  230  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.543217 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3062  cytochrome c class I  42.68 
 
 		 303 aa  219  5e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0184477  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1678  cytochrome c class I  40.86 
 
 		 289 aa  218  7e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16190  cytochrome c, mono- and diheme variants family  37.42 
 
 		 263 aa  201  9.999999999999999e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.188569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0963  cytochrome c, class I  37.21 
 
 		 268 aa  193  3e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0745087 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14180  cytochrome c, mono- and diheme variants family  38.49 
 
 		 266 aa  191  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.616928  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1447  cytochrome c class I  39.4 
 
 		 284 aa  189  4e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0356963  normal  0.171198 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15700  cytochrome c, mono- and diheme variants family  39.74 
 
 		 259 aa  185  8e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.871134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3251  cytochrome c class I  37.95 
 
 		 277 aa  181  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0775555 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1891  cytochrome c class I  37.29 
 
 		 259 aa  179  4e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.527374  hitchhiker  0.000337472 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3135  cytochrome c, class I  40.94 
 
 		 289 aa  179  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1810  cytochrome c class I  35.99 
 
 		 294 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.780394  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3107  cytochrome c, class I  35.99 
 
 		 305 aa  176  6e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510771  normal  0.352992 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2210  cytochrome c, class I  37.42 
 
 		 262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0119453  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3341  cytochrome c class I  35.44 
 
 		 295 aa  172  5.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2009  cytochrome c class I  39.74 
 
 		 259 aa  171  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12130  cytochrome c, mono- and diheme variants family  38.65 
 
 		 256 aa  169  8e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.298886  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1947  cytochrome c class I  37.42 
 
 		 262 aa  168  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000151337 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1374  cytochrome c class I  36.78 
 
 		 270 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317055  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3294  cytochrome c, class I  35.33 
 
 		 277 aa  166  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79873  normal  0.176806 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2076  cytochrome c class I  38.74 
 
 		 261 aa  166  4e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10680  cytochrome c, mono- and diheme variants family  35.03 
 
 		 275 aa  161  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0523281  normal  0.768267 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2955  cytochrome c, class I  36.26 
 
 		 278 aa  160  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3558  cytochrome c, class I  34.49 
 
 		 273 aa  160  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0912153 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3526  cytochrome c class I  38.4 
 
 		 277 aa  159  7e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2693  cytochrome c class I  35.23 
 
 		 306 aa  159  7e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3354  cytochrome c, class I  35.4 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal  0.0591201 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3292  cytochrome c, class I  35.4 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.250177  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3303  cytochrome c, class I  35.4 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4119  cytochrome c class I  34.54 
 
 		 271 aa  156  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.83541 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12222  ubiquinol-cytochrome C reductase qcrC (cytochrome C subunit)  34.83 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3249  cytochrome c class I  37.08 
 
 		 255 aa  152  5e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00726195  hitchhiker  0.0000284914 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1827  cytochrome c class I  32.26 
 
 		 280 aa  133  3e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3056  cytochrome c class I  35.2 
 
 		 295 aa  132  9e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.294486  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0824  cytochrome c class I  26.24 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000780419  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5923  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  24.9 
 
 		 293 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.123388  normal  0.389873 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0161  cytochrome c class I  22.66 
 
 		 254 aa  51.6  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000207523  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2214  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.78 
 
 		 689 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143053  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2378  cytochrome c, class I  29.14 
 
 		 282 aa  47.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000643985  hitchhiker  0.0000202689 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0016  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.95 
 
 		 420 aa  46.6  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.331141 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1184  cytochrome c, class I  32.58 
 
 		 337 aa  46.6  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3648  cytochrome c class I  27.13 
 
 		 147 aa  45.8  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00073069  normal  0.303937 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2365  cytochrome c class I  34.07 
 
 		 107 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.956584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0683  cytochrome c class I  21.88 
 
 		 381 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3623  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  33.68 
 
 		 447 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4258  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.67 
 
 		 325 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.816603 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2110  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  33.68 
 
 		 447 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  0.375253 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0456  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.85 
 
 		 312 aa  45.1  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.844005  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3576  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.67 
 
 		 326 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1599  cytochrome c, class I  31.63 
 
 		 438 aa  44.3  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050865  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4253  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.57 
 
 		 313 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1820  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  29.67 
 
 		 327 aa  43.5  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.700431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1794  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  24.65 
 
 		 325 aa  43.1  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.448855  normal  0.0580758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1610  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.57 
 
 		 325 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00269268  hitchhiker  0.0066634 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4958  cytochrome c, class I  27.19 
 
 		 424 aa  43.1  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.134188 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3823  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.67 
 
 		 325 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2778  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  33.7 
 
 		 305 aa  43.1  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.452004  normal  0.247491 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1455  cytochrome c class I  28.12 
 
 		 278 aa  42.7  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000371587  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0184  cytochrome c, class I  30.16 
 
 		 220 aa  42.7  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2593  hypothetical protein  28.57 
 
 		 269 aa  42.7  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.572119  normal  0.592044 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2835  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.36 
 
 		 448 aa  42.7  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0245579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1360  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.31 
 
 		 308 aa  42.7  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.240618 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2479  cytochrome c family protein  29.31 
 
 		 407 aa  42.7  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2565  cytochrome c, class I  30.48 
 
 		 424 aa  42.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938803  hitchhiker  0.00615552 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44360  putative cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.21 
 
 		 308 aa  42.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.922379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3819  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.68 
 
 		 313 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718495 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2353  cytochrome c class I  28.85 
 
 		 101 aa  42.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1615  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.47 
 
 		 313 aa  42.4  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0748863  normal  0.0271548 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2099  cytochrome c class I  28.06 
 
 		 127 aa  42.4  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.149898 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6799  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.02 
 
 		 454 aa  42.4  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131117  normal  0.655046 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>