More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4809 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4809  cytochrome c, class I  100 
 
 		 213 aa  419  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.439898 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3764  hypothetical protein  48.07 
 
 		 359 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0186816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1721  cytochrome c, class I  37.69 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1108  hypothetical protein  38.55 
 
 		 248 aa  97.4  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  34.65 
 
 		 205 aa  85.5  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  34.65 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  31.98 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1477  cytochrome c class I  35.83 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.911342  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  32.11 
 
 		 318 aa  78.2  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  37.5 
 
 		 216 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  37.5 
 
 		 217 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  31.67 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  37.01 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32530  putative cytochrome c  39.46 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.274349 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2984  pyoverdine biosynthesis protein PvcD  33.33 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003031  cytochrome c4  30.97 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  34.18 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  34.03 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  34.18 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  34.18 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  34.18 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35390  pyoverdine biosynthesis protein PvcD  33.5 
 
 		 215 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.15131  normal  0.0513213 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  34.62 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  33.33 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2756  putative cytochrome c  38.78 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170388  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2705  cytochrome c class I  34.92 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000103804  unclonable  0.0000000000307641 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  30.45 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3107  cytochrome c4  37.75 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0350454  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  32.62 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  30.18 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0053  cytochrome c, class I  35.91 
 
 		 203 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301772 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  32.46 
 
 		 237 aa  71.6  0.000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  33.16 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  33.16 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  33.16 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  31.16 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  31.75 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1569  cytochrome c, class I  35.53 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0100945  normal  0.526038 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  35.56 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0076  cytochrome c4 precursor  31.34 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0651  putative periplasmic cytochrome c  31.91 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471094  normal  0.667908 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  31.87 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4759  cytochrome c class I protein  33.16 
 
 		 373 aa  69.3  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.880991  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0572  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3308  cytochrome c class I  31.91 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0409  cytochrome c, class I  37.75 
 
 		 267 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  31.75 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0913  cytochrome c, class I  31.28 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.826925  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  31.41 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0621  cytochrome c class I  34.24 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  32.88 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0429  cytochrome c class I  30.32 
 
 		 239 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.809488 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0626  putative periplasmic cytochrome c protein  32.67 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0822145  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4079  putative cytochrome c, class I  35.33 
 
 		 269 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  30.98 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02000  Cytochrome c4  32.57 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  30.73 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2668  cytochrome c, class I  31.31 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4605  cytochrome c, class I  38.56 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0013993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4074  putative periplasmic cytochrome c protein  30.85 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84128 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2057  cytochrome c, class I  31.31 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380399  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1848  cytochrome c class I  33.7 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.298737  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6289  cytochrome c4 precursor  33.92 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  29.27 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0546  cytochrome c, class I  30.5 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72460  cytochrome c4 precursor  33.92 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  32.6 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3569  cytochrome c, class I  30.81 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  27.45 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  29.27 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1422  cytochrome c class I  34.9 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0528  cytochrome c family protein  31.22 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000129168  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0082  cytochrome c class I  31.35 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000520703 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1185  cytochrome c, class I  29.59 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3546  cytochrome c family protein  32 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  31.31 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3714  cytochrome c family protein  34.81 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2599  cytochrome c family protein  34.81 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3772  cytochrome c family protein  34.81 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0383758  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0064  putative cytochrome C precursor  33.52 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215607  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2697  cytochrome c, class I  31.12 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  27.78 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  28.1 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0687  cytochrome c class I  32.12 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1956  cytochrome c family protein  34.81 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3137  cytochrome c family protein  34.81 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3510  cytochrome c family protein  34.81 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0670  cytochrome c553  31.95 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.680454  normal  0.316567 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5760  cytochrome c class I  33.51 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0629  cytochrome c, class I  34 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2593  cytochrome c, class I  34 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.412189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2721  cytochrome c, class I  34 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  35.29 
 
 		 201 aa  62  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0126  cytochrome c4  31.79 
 
 		 205 aa  62  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.813624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0143  cytochrome c, class I  31.79 
 
 		 205 aa  62  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0141  cytochrome c class I  31.21 
 
 		 205 aa  62  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5803  cytochrome c class I  32 
 
 		 179 aa  62  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  0.316784 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1469  cytochrome c, class I  34.01 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0501042 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2356  cytochrome c, class I  29.15 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>