More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3764 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3764  hypothetical protein  100 
 
 		 359 aa  728    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0186816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4809  cytochrome c, class I  47.65 
 
 		 213 aa  136  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.439898 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3755  ketosteroid isomerase-like protein  42.86 
 
 		 137 aa  109  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1108  hypothetical protein  36.99 
 
 		 248 aa  103  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1721  cytochrome c, class I  35.12 
 
 		 204 aa  93.2  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3231  ketosteroid isomerase-like protein  32.81 
 
 		 134 aa  85.1  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.274911 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1111  hypothetical protein  36.67 
 
 		 128 aa  82.4  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4622  hypothetical protein  36.36 
 
 		 136 aa  79.3  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0572  cytochrome c, class I  30.93 
 
 		 227 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4808  limonene-1,2-epoxide hydrolase  40.57 
 
 		 130 aa  75.1  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.63698 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  36.59 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3334  hypothetical protein  38.52 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3364  protein of unknown function DUF1486  31.25 
 
 		 137 aa  72  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5171  hypothetical protein  38.52 
 
 		 134 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.182508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  31.77 
 
 		 205 aa  72  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3137  cytochrome c family protein  36.02 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1956  cytochrome c family protein  36.02 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7525  hypothetical protein  39.82 
 
 		 130 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321809  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3772  cytochrome c family protein  36.02 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0383758  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3510  cytochrome c family protein  36.02 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3714  cytochrome c family protein  36.02 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2599  cytochrome c family protein  36.02 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  32.46 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0594  cytochrome c class I  32.78 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1848  cytochrome c class I  30.48 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.298737  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0615  cytochrome c, class I  32.78 
 
 		 218 aa  69.3  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3745  cytochrome C  36.13 
 
 		 545 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0380  cytochrome c, class I  32.98 
 
 		 217 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0359  cytochrome c class I  32.98 
 
 		 217 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2727  cytochrome c, class I  32.98 
 
 		 217 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1569  cytochrome c, class I  30.67 
 
 		 241 aa  68.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0100945  normal  0.526038 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0308  cytochrome c class I  32.46 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618372  normal  0.165447 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  28.64 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0299  cytochrome c, class I  32.46 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3479  cytochrome c, class I  32.46 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2954  hypothetical protein  33.05 
 
 		 130 aa  67.4  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  31.69 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0281  cytochrome c class I  31.44 
 
 		 217 aa  67  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  33.16 
 
 		 207 aa  67  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  31.94 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  31.25 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  0.0000000311228 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  32.8 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4839  cytochrome c, class I  32.47 
 
 		 212 aa  65.5  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.173442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1204  ketosteroid isomerase-related protein  37.04 
 
 		 156 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0307443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  31.35 
 
 		 217 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  29.14 
 
 		 221 aa  65.9  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  30.77 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  31.25 
 
 		 217 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3310  hypothetical protein  36.11 
 
 		 156 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0294644 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  31.77 
 
 		 223 aa  65.1  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3166  hypothetical protein  36.11 
 
 		 156 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.55884  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  30.98 
 
 		 205 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  29.19 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3167  hypothetical protein  35.19 
 
 		 156 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.169208  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3975  hypothetical protein  29.17 
 
 		 137 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  30.05 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4449  hypothetical protein  36.29 
 
 		 129 aa  63.5  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.904253  normal  0.0764315 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0687  cytochrome c class I  31.94 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0012  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.47 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  29.35 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1645  limonene-1,2-epoxide hydrolase catalytic domain-contain protein  29.6 
 
 		 1420 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2705  cytochrome c class I  32.94 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000103804  unclonable  0.0000000000307641 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  28.5 
 
 		 206 aa  62.4  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  33.52 
 
 		 256 aa  62  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5869  protein of unknown function DUF1486  27.87 
 
 		 138 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  31.69 
 
 		 207 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  28.32 
 
 		 207 aa  62.4  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0754  putative cytochrome c  30.9 
 
 		 240 aa  62.4  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.161807  normal  0.0258714 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3107  cytochrome c4  32.94 
 
 		 234 aa  62  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0350454  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2785  ketosteroid isomerase-like protein  29.63 
 
 		 165 aa  61.6  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00716853  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3327  cytochrome c, class I  29.86 
 
 		 206 aa  62  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000098516 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003031  cytochrome c4  30.46 
 
 		 203 aa  62  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  31.69 
 
 		 207 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  31.69 
 
 		 207 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  30.6 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1310  diheme-containing protein c4  28.66 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  30.6 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4453  cytochrome c class I  30.37 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12029  normal  0.150095 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0984  cytochrome c, class I  33.17 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.336073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  28.65 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  30.6 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  30.6 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  29.89 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  29.73 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2377  cytochrome c, class I  30.68 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000176036  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2985  cytochrome c553-like protein  28.02 
 
 		 281 aa  60.1  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  26.82 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1185  cytochrome c family protein  29.32 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  27.96 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  31.41 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1146  cytochrome c family protein  28.72 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1429  cytochrome c552, putative  28.72 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3139  di-heme cytochrome c, class IC  29.41 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3498  hypothetical protein  29.84 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718505 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  30.1 
 
 		 217 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0197  putative cytochrome C signal peptide protein  31.55 
 
 		 206 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.283033 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  27.96 
 
 		 200 aa  59.3  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5589  cytochrome c class I  33.12 
 
 		 255 aa  58.9  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6296 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1634  hypothetical protein  32.77 
 
 		 127 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.347419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>