88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0127 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0127  cytochrome c class I  100 
 
 		 104 aa  219  9.999999999999999e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0741  cytochrome c, class I  35.56 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0539  cytochrome c class I  35.42 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113512 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1343  cytochrome c, class I  31.65 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.022471  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1821  cytochrome c-553  34.62 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000000401467  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0538  cytochrome c class I  34.67 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0164881 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00326  cytochrome C4  35.37 
 
 		 91 aa  52  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0288  cytochrome c class I  41.67 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1635  putative cytochrome  34.15 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.240566  normal  0.477632 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0739  putative cytochrome c  32.43 
 
 		 97 aa  47.8  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2881  cytochrome c, class I  36.71 
 
 		 103 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0149  cytochrome c class I  36.71 
 
 		 287 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.481052  normal  0.118184 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1095  cytochrome c553-like protein  38.57 
 
 		 220 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3764  hypothetical protein  30.95 
 
 		 359 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0186816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0523  cytochrome c, class I  29.58 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05467  cytochrome c  36.62 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  36.62 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2005  sulfide dehydrogenase, cytochrome subunit  39.76 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0152993  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0751  cytochrome c, class I  27.62 
 
 		 112 aa  46.2  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000617346  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0629  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 102 aa  45.1  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1543  cytochrome c-553  29.03 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.31178  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1418  cytochrome c553  27.71 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.785663  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0578  cytochrome c-553  33.67 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00244376  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1223  cytochrome c, class I  30.19 
 
 		 221 aa  44.7  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.153054  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0287  cytochrome c, class I  31.25 
 
 		 222 aa  44.7  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5760  cytochrome c class I  32.1 
 
 		 266 aa  44.3  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0261  cytochrome C, c4  31.25 
 
 		 222 aa  44.7  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3050  cytochrome c, class I  31.91 
 
 		 106 aa  43.5  0.0009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002765  cytochrome c553  36.62 
 
 		 104 aa  43.5  0.0009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.38085  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0474  cytochrome c family protein  27.37 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1833  cytochrome c554  36.62 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1817  cytochrome c class I  29.55 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0572  cytochrome c, class I  31.94 
 
 		 227 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2878  cytochrome c class I  36.99 
 
 		 219 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  29.82 
 
 		 216 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0123  cytochrome c class I  28.95 
 
 		 418 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.266844  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  30.36 
 
 		 216 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1873  putative cytochrome c  35.9 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.490249  normal  0.677809 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0954  hypothetical protein  35.21 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  29.81 
 
 		 318 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  29.82 
 
 		 216 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2027  cytochrome c, class IC  31.17 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  34.78 
 
 		 221 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1922  cytochrome c family protein  38.03 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  26.97 
 
 		 205 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1588  cytochrome c, class I  30.3 
 
 		 221 aa  42  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166336  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2873  cytochrome c family protein  31.25 
 
 		 262 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0011  cytochrome c class I  32.56 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.159983  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3049  cytochrome c, class I  30.48 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000419911  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4567  cytochrome c class I  31.51 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00798656  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4466  cytochrome c class I  30.56 
 
 		 230 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657614  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2787  cytochrome c, class I  29.7 
 
 		 188 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1634  cytochrome c class I  28.57 
 
 		 153 aa  41.2  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.18479  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3555  cytochrome c, class I  35.62 
 
 		 219 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.411936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1360  cytochrome c family protein  31.25 
 
 		 262 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.264003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1354  cytochrome c family protein  31.25 
 
 		 262 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1493  putative cytochrome c related protein  31.25 
 
 		 262 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.164831  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0769  putative cytochrome c  34.72 
 
 		 199 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8118  cytochrome c class I  30.68 
 
 		 270 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1266  cytochrome c, class I  29.11 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.14391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  31.4 
 
 		 220 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0952  cytochrome c, class I  33.77 
 
 		 192 aa  41.2  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000198815  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3091  cytochrome c class I  32.43 
 
 		 273 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.994793  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1968  cytochrome c class I  31.03 
 
 		 238 aa  40.8  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000548419  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02000  Cytochrome c4  26.44 
 
 		 210 aa  40.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1170  cytochrome c553  25.81 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2034  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  24.27 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.738809 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1289  cytochrome c553  25.81 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  32.56 
 
 		 217 aa  40.8  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0934  cytochrome c class I  33.78 
 
 		 117 aa  40.8  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1460  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  40.4  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  28.95 
 
 		 217 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  29.03 
 
 		 206 aa  40.4  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  32.56 
 
 		 217 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  0.0000000311228 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1889  cytochrome c, class I  31.58 
 
 		 221 aa  40.4  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  27.59 
 
 		 201 aa  40.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0861  cytochrome c, class I  28.7 
 
 		 225 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3569  cytochrome c, class I  27.59 
 
 		 202 aa  40.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2995  cytochrome c, class I  32.43 
 
 		 213 aa  40.4  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  32.56 
 
 		 217 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  30 
 
 		 200 aa  40.4  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1108  hypothetical protein  26.13 
 
 		 248 aa  40  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0300  cytochrome c, class IC  34.72 
 
 		 119 aa  40  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.949004  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1179  cytochrome c family protein  34.72 
 
 		 119 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1171  cytochrome c family protein  34.72 
 
 		 119 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0848  cytochrome C4 family protein  34.72 
 
 		 119 aa  40  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412823  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1017  cytochrome c, class IC  34.72 
 
 		 119 aa  40  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1332  cytochrome c, class IC  34.72 
 
 		 119 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.0014287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>