54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0335 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0335  cytochrome c, class I  100 
 
 		 96 aa  195  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.906933 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1543  cytochrome c-553  48.31 
 
 		 102 aa  72.4  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.31178  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0539  cytochrome c class I  44.33 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113512 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1821  cytochrome c-553  41.77 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000000401467  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1343  cytochrome c, class I  38.37 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.022471  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0741  cytochrome c, class I  39.24 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1817  cytochrome c class I  38.54 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1968  cytochrome c class I  37.07 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000548419  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0538  cytochrome c class I  37.14 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0164881 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0264  cytochrome c class I  38.1 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.453378  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2881  cytochrome c, class I  46.05 
 
 		 103 aa  51.2  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2409  cytochrome c-552  37.5 
 
 		 103 aa  50.8  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2702  cytochrome c, class I  36.89 
 
 		 108 aa  50.4  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  37.25 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0149  cytochrome c class I  37.93 
 
 		 287 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.481052  normal  0.118184 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0707  cytochrome c554  30.1 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  34.74 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002765  cytochrome c553  37.5 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.38085  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1873  putative cytochrome c  40.51 
 
 		 102 aa  47.8  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.490249  normal  0.677809 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1833  cytochrome c554  38.89 
 
 		 107 aa  47.4  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1460  hypothetical protein  36 
 
 		 185 aa  47  0.00008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0629  cytochrome c, class I  39.13 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2365  cytochrome c class I  34.74 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.956584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03219  hypothetical protein  36.62 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  29.09 
 
 		 217 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1032  cytochrome c family protein  28.57 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1085  cytochrome c class I  28.57 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.032196  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3416  cytochrome c family protein  28.57 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0578  cytochrome c-553  31.52 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00244376  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3091  cytochrome c class I  40 
 
 		 273 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.994793  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0123  cytochrome c class I  40.43 
 
 		 418 aa  43.9  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.266844  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1764  cytochrome c, class I  42.19 
 
 		 382 aa  43.9  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000218169  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  35.62 
 
 		 221 aa  43.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3764  cytochrome c class I  32.88 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000231636  normal  0.0830615 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0982  cytochrome c class I  31.58 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0520697  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1709  putative cytochrome c family protein  35.44 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0233417  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1464  cytochrome c, class I  39.44 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00242813  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0739  putative cytochrome c  34.33 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0751  cytochrome c, class I  35.35 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000617346  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4157  cytochrome c, class I  31.91 
 
 		 236 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5100  cytochrome c class I  31.63 
 
 		 284 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.449412  normal  0.538396 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0952  cytochrome c, class I  34.67 
 
 		 192 aa  41.6  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000198815  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3207  cytochrome c class I  33.73 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.565348  decreased coverage  0.00513342 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000045  cytochrome c553  30.3 
 
 		 106 aa  41.2  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0810  putative cytochrome c4 precursor  35.92 
 
 		 198 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1289  cytochrome c553  33.33 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1170  cytochrome c553  33.33 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2034  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  33.33 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.738809 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0398  cytochrome c family protein, putative  30.38 
 
 		 189 aa  40.4  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00326  cytochrome C4  34.44 
 
 		 91 aa  40.4  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  28.74 
 
 		 205 aa  40.4  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3049  cytochrome c, class I  32.04 
 
 		 113 aa  40  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000419911  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2099  cytochrome c class I  37.76 
 
 		 127 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.149898 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1922  cytochrome c family protein  31.51 
 
 		 104 aa  40  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>