18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1112 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1112  hypothetical protein  100 
 
 		 51 aa  103  8e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.527816 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0729  hypothetical protein  82.35 
 
 		 110 aa  88.6  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0011  cytochrome c class I  52 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.159983  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1738  cytochrome c, class I  39.58 
 
 		 103 aa  50.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3771  putative cytochrome c  61.54 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0237  cytochrome c, class I  37.78 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424011  normal  0.118914 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3262  cytochrome c, class I  42.22 
 
 		 108 aa  48.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161977  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2005  sulfide dehydrogenase, cytochrome subunit  46.94 
 
 		 127 aa  47.8  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0152993  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3461  conserved hypothetical signal peptide protein  35.29 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4438  cytochrome c553-like  44.44 
 
 		 112 aa  47  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3133  putative signal peptide protein  35.29 
 
 		 118 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0010  cytochrome c class I  44.9 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2995  cytochrome c, class I  40.82 
 
 		 213 aa  44.7  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2428  putative cytochrome c  45.24 
 
 		 110 aa  43.5  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0031  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  45.1 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214026  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2034  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  33.33 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.738809 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3427  cytochrome c, class I  62.96 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3047  cytochrome c class I  38.64 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.545307  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>