36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1799 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1799  cytochrome c family protein  100 
 
 		 99 aa  202  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000599943  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4567  cytochrome c class I  40.58 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00798656  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  29.63 
 
 		 217 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2034  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  29.49 
 
 		 98 aa  47.4  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.738809 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1162  cytochrome c, class I  28.57 
 
 		 107 aa  47.4  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.806523  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  28.7 
 
 		 216 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0237  cytochrome c, class I  35.21 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424011  normal  0.118914 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  29.63 
 
 		 216 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0288  cytochrome c class I  31.82 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0011  cytochrome c class I  30.77 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.159983  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1946  cytochrome c, class I  32.26 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0592942  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  25.25 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0082  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 238 aa  44.3  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000520703 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0524  cytochrome c, class I  29.17 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1738  cytochrome c, class I  32.84 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1588  cytochrome c, class I  37.88 
 
 		 221 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166336  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0984  cytochrome c, class I  35.44 
 
 		 242 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.336073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2995  cytochrome c, class I  27.5 
 
 		 213 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1330  cytochrome c553-like protein  24.47 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.219398  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1476  putative signal peptide protein  30.88 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.907195  normal  0.613134 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2787  cytochrome c, class I  34.33 
 
 		 188 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  28.44 
 
 		 216 aa  42  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 206 aa  41.2  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  35.48 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1131  cytochrome c class I  31.43 
 
 		 222 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0999  putative periplasmic cytochrome type-c oxidoreductase signal peptide protein  32.86 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.209116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3093  cytochrome c class I  33.85 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0085  cytochrome c553-like protein  30.67 
 
 		 246 aa  40.8  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0031  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  30.3 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214026  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2578  hypothetical protein  33.85 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.365734 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3047  cytochrome c class I  31.88 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.545307  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3461  conserved hypothetical signal peptide protein  36.49 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0241  cytochrome c-553 (cytochrome c553) (low-potential cytochromec)  29.85 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2428  putative cytochrome c  29.69 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3133  putative signal peptide protein  36.49 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02000  Cytochrome c4  36.23 
 
 		 210 aa  40  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>