More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2787 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2787  cytochrome c, class I  100 
 
 		 188 aa  375  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5446  putative cytochrome c4 precursor  73.62 
 
 		 196 aa  220  9e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.712541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6834  cytochrome c, class I  38.85 
 
 		 218 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2741  cytochrome c, class I  38.85 
 
 		 218 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0698392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  38.22 
 
 		 196 aa  108  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0629  cytochrome c, class I  37.14 
 
 		 236 aa  105  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2668  cytochrome c, class I  36.16 
 
 		 254 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2697  cytochrome c, class I  36.57 
 
 		 236 aa  104  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2057  cytochrome c, class I  36.16 
 
 		 254 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380399  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0312  putative cytochrome c4 precursor  37.84 
 
 		 193 aa  104  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717329 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5996  cytochrome c, class I  36.57 
 
 		 236 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.203421 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2721  cytochrome c, class I  36 
 
 		 229 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2593  cytochrome c, class I  36 
 
 		 229 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.412189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0810  putative cytochrome c4 precursor  39.25 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0250  cytochrome c4, putative  35.03 
 
 		 253 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603849  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2381  putative cytochrome c4  35.03 
 
 		 249 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336933  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0750  putative cytochrome  35.03 
 
 		 249 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0916  cytochrome c  35.03 
 
 		 253 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2462  putative cytochrome c4  35.03 
 
 		 249 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6830  cytochrome c, class I  36.94 
 
 		 292 aa  102  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0812003  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0737  putative cytochrome  35.03 
 
 		 253 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2696  putative cytochrome c4  35.03 
 
 		 234 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  35.75 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5803  cytochrome c class I  34.39 
 
 		 179 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  0.316784 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5418  cytochrome c, class I  33.76 
 
 		 200 aa  99.8  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  38.29 
 
 		 205 aa  99  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0618  cytochrome c, class I  40.25 
 
 		 212 aa  98.2  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5824  cytochrome c, class I  38.75 
 
 		 223 aa  97.8  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.311103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5036  cytochrome c, class I  38.75 
 
 		 223 aa  97.8  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0769  putative cytochrome c  32.93 
 
 		 199 aa  97.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4355  cytochrome c, class I  38.75 
 
 		 223 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  34.07 
 
 		 206 aa  97.1  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5813  cytochrome c, class I  35.03 
 
 		 219 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5047  cytochrome c, class I  35.03 
 
 		 219 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6402  cytochrome c, class I  34.39 
 
 		 218 aa  95.9  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0429  cytochrome c class I  34.13 
 
 		 239 aa  95.5  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.809488 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4366  cytochrome c class I  34.39 
 
 		 219 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0064  putative cytochrome C precursor  39.39 
 
 		 222 aa  93.2  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215607  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2739  cytochrome c, class I  35.4 
 
 		 218 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3308  cytochrome c class I  34.07 
 
 		 243 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0609  cytochrome c4, putative  36.16 
 
 		 253 aa  93.2  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4453  cytochrome c class I  36.08 
 
 		 226 aa  92  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12029  normal  0.150095 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0651  putative periplasmic cytochrome c  35.26 
 
 		 243 aa  92.4  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471094  normal  0.667908 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2878  cytochrome c4, putative  36.99 
 
 		 238 aa  91.7  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3139  di-heme cytochrome c, class IC  30.91 
 
 		 200 aa  90.9  9e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0754  putative cytochrome c  35.8 
 
 		 240 aa  90.1  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.161807  normal  0.0258714 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0626  putative periplasmic cytochrome c protein  31 
 
 		 237 aa  89.4  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0822145  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4074  putative periplasmic cytochrome c protein  30.21 
 
 		 257 aa  88.6  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84128 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2985  cytochrome c553-like protein  33.52 
 
 		 281 aa  88.2  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1223  cytochrome c, class I  30.88 
 
 		 221 aa  87.8  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.153054  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0594  cytochrome c class I  32.6 
 
 		 218 aa  87  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1488  cytochrome c  35.26 
 
 		 238 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.308857  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0615  cytochrome c, class I  32.6 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0197  putative cytochrome C signal peptide protein  34.69 
 
 		 206 aa  86.3  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.283033 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1355  putative cytochrome c  35.26 
 
 		 236 aa  86.3  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003031  cytochrome c4  29.8 
 
 		 203 aa  85.9  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1349  putative cytochrome c  35.26 
 
 		 236 aa  86.3  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.708882  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1588  cytochrome c, class I  31.86 
 
 		 221 aa  85.5  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166336  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0913  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 212 aa  85.1  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.826925  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0861  cytochrome c, class I  29.91 
 
 		 225 aa  84.7  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1779  cytochrome c family protein  36 
 
 		 205 aa  84.3  9e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  31.53 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  30.05 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0546  cytochrome c, class I  31.91 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4451  cytochrome c class I  34.67 
 
 		 168 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.676804  normal  0.145709 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1469  cytochrome c, class I  35.5 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0501042 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  30.88 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1673  cytochrome c, class I  32.57 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  29.41 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8113  putative cytochrome c4  34.09 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1429  cytochrome c552, putative  31.41 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  32.29 
 
 		 202 aa  82.4  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1146  cytochrome c family protein  31.41 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5765  cytochrome c4, putative  34.1 
 
 		 235 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2392  cytochrome c, class I  33.15 
 
 		 214 aa  81.3  0.000000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  30.39 
 
 		 207 aa  81.3  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  30.88 
 
 		 207 aa  80.9  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  30.29 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  30.88 
 
 		 207 aa  80.9  0.000000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  30.88 
 
 		 207 aa  80.9  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  30.88 
 
 		 207 aa  80.9  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4653  putative cytochrome c  33.9 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  33.93 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  30.39 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4466  cytochrome c class I  30.43 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657614  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  30.39 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  29.21 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  33.67 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2566  putative cytochrome c  33.53 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458345 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1399  cytochrome c553-like  35.84 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3388  cytochrome c553-like protein  32.39 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485669  normal  0.152505 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  30 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  31.73 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  32.16 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0351  putative periplasmic cytochrome c protein  28.57 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1242  putative cytochrome c  32.95 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.291072  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1322  putative cytochrome c  33.33 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1283  putative cytochrome c  33.33 
 
 		 261 aa  78.6  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.558146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2865  cytochrome c, class I  32.54 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.240799  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  29.27 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>