227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1946 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1946  cytochrome c553  100 
 
 		 191 aa  395  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.871766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1673  cytochrome c, class I  30.68 
 
 		 212 aa  86.3  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003775  cytochrome c553  38.26 
 
 		 115 aa  85.9  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2995  cytochrome c, class I  28.96 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0615  cytochrome c, class I  27.33 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0594  cytochrome c class I  27.33 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0194  cytochrome c, class I  28.74 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3147  cytochrome c, class I  24.32 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2656  cytochrome c, class I  32.93 
 
 		 213 aa  72  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.964453  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3284  cytochrome c, class I  24.86 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0687  cytochrome c class I  30.36 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2987  oxidoreductase cytochrome C-type signal peptide protein  23.78 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0082  cytochrome c class I  27.27 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000520703 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0085  cytochrome c553-like protein  27.27 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  27.27 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1848  cytochrome c class I  29.09 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.298737  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0810  putative cytochrome c4 precursor  30.95 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1469  cytochrome c, class I  27.53 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0501042 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  28.64 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  27.43 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  29.31 
 
 		 223 aa  64.7  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2741  cytochrome c, class I  29.41 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0698392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3139  di-heme cytochrome c, class IC  28.81 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  27.18 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6834  cytochrome c, class I  30.77 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003031  cytochrome c4  28 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  27.88 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1589  class I diheme cytochrome c4  27.22 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3327  cytochrome c, class I  29.73 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000098516 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8118  cytochrome c class I  28.57 
 
 		 270 aa  62  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  26.92 
 
 		 208 aa  62  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0394  cytochrome c class I  27.06 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.091013 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  25.42 
 
 		 217 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  27.91 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3265  cytochrome c class I  23.24 
 
 		 219 aa  61.2  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838246  normal  0.141063 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  27.91 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2918  cytochrome c class I  23.24 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059713 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3138  cytochrome c, class I  26.74 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  24.86 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  25.94 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0618  cytochrome c, class I  29.14 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5047  cytochrome c, class I  27.68 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5813  cytochrome c, class I  27.68 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  28.99 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6830  cytochrome c, class I  29.59 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0812003  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3546  cytochrome c family protein  24.42 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  26.11 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72460  cytochrome c4 precursor  29.65 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6289  cytochrome c4 precursor  29.65 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  25.29 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  25.42 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  0.0000000311228 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0984  cytochrome c, class I  26.32 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.336073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5681  cytochrome c class I  26.14 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.670247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2739  cytochrome c, class I  27.01 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2865  cytochrome c, class I  27.68 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.240799  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0064  putative cytochrome C precursor  28.74 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215607  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2392  cytochrome c, class I  28 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0769  putative cytochrome c  26.38 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4366  cytochrome c class I  27.12 
 
 		 219 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2741  class I diheme cytochrome c4  26.06 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.236816  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  25.15 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  27.59 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1662  cytochrome c class I  27.54 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1956  cytochrome c family protein  23.7 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3137  cytochrome c family protein  23.7 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3555  cytochrome c, class I  27.84 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.411936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  27.78 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  27.78 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4839  cytochrome c, class I  25.15 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.173442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0432  cytochrome c  24.56 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660944  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0029  cytochrome c553  23.53 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  27.78 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  27.91 
 
 		 318 aa  57  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2599  cytochrome c family protein  23.7 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3510  cytochrome c family protein  23.7 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3714  cytochrome c family protein  23.7 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3772  cytochrome c family protein  23.7 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0383758  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02000  Cytochrome c4  27.22 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2878  cytochrome c class I  27.27 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3951  cytochrome c, class I  25.84 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1400  class I diheme cytochrome c4  25.45 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.49014  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  22.95 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3745  cytochrome C  23.98 
 
 		 545 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110713  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5589  cytochrome c class I  27.59 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6296 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2395  cytochrome c family protein  27.75 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.510701  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  27.22 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2377  cytochrome c, class I  22.4 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000176036  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0141  cytochrome c class I  27.59 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2787  cytochrome c, class I  26.67 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4451  cytochrome c class I  26.92 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.676804  normal  0.145709 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  29.61 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0312  putative cytochrome c4 precursor  26.63 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717329 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5418  cytochrome c, class I  27.44 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  26.67 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  26.67 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  26.67 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  26.67 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0126  cytochrome c4  27.59 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.813624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0143  cytochrome c, class I  27.59 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286683  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1185  cytochrome c family protein  24.85 
 
 		 214 aa  54.3  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>