123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003775 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003775  cytochrome c553  100 
 
 		 115 aa  234  3e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1946  cytochrome c553  38.26 
 
 		 191 aa  85.9  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.871766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1673  cytochrome c, class I  33.06 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0029  cytochrome c553  32.76 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1589  class I diheme cytochrome c4  32.14 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0615  cytochrome c, class I  31.58 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0594  cytochrome c class I  31.58 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3894  cytochrome c553-like protein  27.56 
 
 		 271 aa  54.3  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1185  cytochrome c family protein  30.09 
 
 		 214 aa  53.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0769  putative cytochrome c  30.09 
 
 		 199 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2894  cytochrome c, class I  37.33 
 
 		 226 aa  52.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2995  cytochrome c, class I  29.55 
 
 		 213 aa  52.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0432  cytochrome c  41.33 
 
 		 205 aa  52.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660944  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4451  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 168 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.676804  normal  0.145709 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6830  cytochrome c, class I  34.48 
 
 		 292 aa  51.2  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0812003  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1185  cytochrome c, class I  28 
 
 		 215 aa  51.6  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  39.19 
 
 		 206 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2739  cytochrome c, class I  33.05 
 
 		 218 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437808  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0313  cytochrome c552  38.24 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.577665  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2702  cytochrome c, class I  36.84 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  30.58 
 
 		 200 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2741  class I diheme cytochrome c4  32.48 
 
 		 198 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.236816  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5036  cytochrome c, class I  34.19 
 
 		 223 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5824  cytochrome c, class I  34.19 
 
 		 223 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.311103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  35.71 
 
 		 196 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1770  cytochrome c553-like protein  30.43 
 
 		 195 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.290935 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  40.58 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1400  class I diheme cytochrome c4  31.62 
 
 		 198 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.49014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0621  cytochrome c class I  26.56 
 
 		 269 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  29.75 
 
 		 200 aa  48.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0618  cytochrome c, class I  32.48 
 
 		 212 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2984  pyoverdine biosynthesis protein PvcD  36.78 
 
 		 218 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  29.27 
 
 		 216 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  28.23 
 
 		 213 aa  47.8  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0312  putative cytochrome c4 precursor  32.17 
 
 		 193 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717329 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3093  cytochrome c class I  37.68 
 
 		 105 aa  47  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  29.91 
 
 		 206 aa  47  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0810  putative cytochrome c4 precursor  32.77 
 
 		 198 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3107  cytochrome c4  28.57 
 
 		 234 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0350454  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2705  cytochrome c class I  28.57 
 
 		 260 aa  46.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000103804  unclonable  0.0000000000307641 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2787  cytochrome c, class I  38.1 
 
 		 188 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4355  cytochrome c, class I  32.77 
 
 		 223 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0394  cytochrome c class I  36 
 
 		 209 aa  46.2  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.091013 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4079  putative cytochrome c, class I  28.91 
 
 		 269 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  38.81 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0299  cytochrome c, class I  35 
 
 		 217 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35390  pyoverdine biosynthesis protein PvcD  37.93 
 
 		 215 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.15131  normal  0.0513213 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0984  cytochrome c, class I  28.8 
 
 		 242 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.336073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2985  cytochrome c553-like protein  24.6 
 
 		 281 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  28.46 
 
 		 216 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0687  cytochrome c class I  27.97 
 
 		 225 aa  45.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0308  cytochrome c class I  35 
 
 		 217 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618372  normal  0.165447 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0346  putative cytochrome c, class I  24 
 
 		 269 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1476  putative signal peptide protein  36.62 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.907195  normal  0.613134 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2756  putative cytochrome c  27.42 
 
 		 217 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170388  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0982  cytochrome c class I  36.36 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0520697  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  28 
 
 		 208 aa  44.7  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3479  cytochrome c, class I  35 
 
 		 217 aa  45.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1146  cytochrome c family protein  33.73 
 
 		 213 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1429  cytochrome c552, putative  33.73 
 
 		 213 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6469  cytochrome c class I  36.23 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5803  cytochrome c class I  35.14 
 
 		 179 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  0.316784 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2793  cytochrome c, class I  28.23 
 
 		 379 aa  44.7  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0531198  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  27.64 
 
 		 217 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  41.89 
 
 		 200 aa  43.9  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  36.36 
 
 		 318 aa  43.9  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5418  cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 200 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0064  putative cytochrome C precursor  30.17 
 
 		 222 aa  43.9  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215607  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7221  cytochrome c class I  36.23 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4366  cytochrome c class I  32.5 
 
 		 219 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0754  putative cytochrome c  23.81 
 
 		 240 aa  43.9  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.161807  normal  0.0258714 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2865  cytochrome c, class I  29.37 
 
 		 207 aa  43.9  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.240799  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  28.23 
 
 		 256 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0670  cytochrome c553  38.24 
 
 		 205 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.680454  normal  0.316567 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0115  class I triheme cytochrome c  34.29 
 
 		 414 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6834  cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 218 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3448  putative cytochrome c  25.4 
 
 		 257 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.582918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2727  cytochrome c, class I  35 
 
 		 217 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5047  cytochrome c, class I  32.5 
 
 		 219 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3908  cytochrome c, class I  50 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0380  cytochrome c, class I  35 
 
 		 217 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5813  cytochrome c, class I  32.5 
 
 		 219 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1751  cytochrome c, class I  34.29 
 
 		 414 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.399641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 199 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5589  cytochrome c class I  31.88 
 
 		 255 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6296 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0359  cytochrome c class I  35 
 
 		 217 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  30.23 
 
 		 221 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1764  cytochrome c, class I  29.03 
 
 		 382 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000218169  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2392  cytochrome c, class I  29.37 
 
 		 214 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1530  cytochrome c class I  34.44 
 
 		 209 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  26.83 
 
 		 216 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2081  putative cytochrome c  33.82 
 
 		 194 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0281  cytochrome c class I  33.75 
 
 		 217 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1817  cytochrome c class I  31.71 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1176  cytochrome c class I  34.38 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000869093 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  28 
 
 		 220 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2377  cytochrome c, class I  25.6 
 
 		 224 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000176036  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32530  putative cytochrome c  25.81 
 
 		 217 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.274349 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1283  putative cytochrome c  25.4 
 
 		 261 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.558146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2095  putative cytochrome c  23.81 
 
 		 284 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737605  normal  0.709755 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>