189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0029 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0029  cytochrome c553  100 
 
 		 183 aa  384  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2995  cytochrome c, class I  25.27 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0769  putative cytochrome c  28.93 
 
 		 199 aa  64.3  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  37.5 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6830  cytochrome c, class I  32.53 
 
 		 292 aa  62  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0812003  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2739  cytochrome c, class I  30.77 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003775  cytochrome c553  32.76 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  34.09 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4759  cytochrome c class I protein  28.16 
 
 		 373 aa  58.9  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.880991  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1673  cytochrome c, class I  29.73 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2395  cytochrome c family protein  25 
 
 		 209 aa  57.8  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.510701  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2793  cytochrome c, class I  27.06 
 
 		 379 aa  57.8  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0531198  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1770  cytochrome c553-like protein  25.88 
 
 		 195 aa  57  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.290935 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4451  cytochrome c class I  31.76 
 
 		 168 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.676804  normal  0.145709 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1946  cytochrome c553  23.53 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.871766  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  29.09 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3894  cytochrome c553-like protein  26.23 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  31.82 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4605  cytochrome c, class I  28.66 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0013993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4453  cytochrome c class I  31.71 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12029  normal  0.150095 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1889  cytochrome c, class I  28.81 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3416  cytochrome c family protein  29.89 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1032  cytochrome c family protein  29.89 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5418  cytochrome c, class I  29.38 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1085  cytochrome c class I  29.89 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.032196  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  31.4 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2741  class I diheme cytochrome c4  26.19 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.236816  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  29.89 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  29.89 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  29.89 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  25.41 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  29.89 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  27.4 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4355  cytochrome c, class I  28.92 
 
 		 223 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  31.03 
 
 		 207 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  31.03 
 
 		 207 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  29.34 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0615  cytochrome c, class I  28.66 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0594  cytochrome c class I  28.66 
 
 		 218 aa  53.9  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1400  class I diheme cytochrome c4  25.6 
 
 		 198 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.49014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  25.79 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  31.82 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  29.89 
 
 		 207 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  22.89 
 
 		 256 aa  52  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  36.78 
 
 		 207 aa  52.4  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0687  cytochrome c class I  28.14 
 
 		 225 aa  52  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0194  cytochrome c, class I  23.49 
 
 		 220 aa  52  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0009  monoheme cytochrome c  33.73 
 
 		 111 aa  51.2  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00972927 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  30.68 
 
 		 206 aa  51.2  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0009  monoheme cytochrome c  33.73 
 
 		 111 aa  51.2  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  20.74 
 
 		 318 aa  51.2  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2741  cytochrome c, class I  27.11 
 
 		 218 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0698392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2656  cytochrome c, class I  27.33 
 
 		 213 aa  50.8  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.964453  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0409  cytochrome c, class I  26.67 
 
 		 267 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  27.12 
 
 		 205 aa  50.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2377  cytochrome c, class I  23.16 
 
 		 224 aa  50.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000176036  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3546  cytochrome c family protein  25.58 
 
 		 210 aa  50.4  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05667  cytochrome-c oxidase  35.06 
 
 		 108 aa  50.8  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  26.95 
 
 		 196 aa  50.4  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  26.59 
 
 		 202 aa  49.7  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0009  cytochrome c class I  32.53 
 
 		 111 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000357526 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3327  cytochrome c, class I  26.92 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000098516 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  23.17 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0053  cytochrome c, class I  30.12 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301772 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2894  cytochrome c, class I  28.78 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2705  cytochrome c class I  26.47 
 
 		 260 aa  49.7  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000103804  unclonable  0.0000000000307641 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1469  cytochrome c, class I  37.33 
 
 		 226 aa  49.7  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0501042 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3107  cytochrome c4  26.47 
 
 		 234 aa  49.3  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0350454  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003031  cytochrome c4  24.71 
 
 		 203 aa  49.3  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5036  cytochrome c, class I  27.11 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5824  cytochrome c, class I  27.11 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.311103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  24.71 
 
 		 205 aa  49.3  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  25.75 
 
 		 206 aa  48.9  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0394  cytochrome c class I  24.7 
 
 		 209 aa  48.9  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.091013 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  30.95 
 
 		 206 aa  48.5  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2987  oxidoreductase cytochrome C-type signal peptide protein  30.77 
 
 		 219 aa  48.1  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1764  cytochrome c, class I  27.43 
 
 		 382 aa  47.8  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000218169  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000045  cytochrome c553  35.06 
 
 		 106 aa  48.1  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8118  cytochrome c class I  24.56 
 
 		 270 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0717  monoheme cytochrome c  34.57 
 
 		 111 aa  47.4  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  29.11 
 
 		 229 aa  47  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3764  cytochrome c class I  30.88 
 
 		 104 aa  47.4  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000231636  normal  0.0830615 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1310  diheme-containing protein c4  22.16 
 
 		 210 aa  47.4  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  25.15 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0346  putative cytochrome c, class I  27.22 
 
 		 269 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4839  cytochrome c, class I  25.41 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.173442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1131  cytochrome c class I  23.53 
 
 		 222 aa  47.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  24.77 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3138  cytochrome c, class I  29.85 
 
 		 205 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6834  cytochrome c, class I  28.24 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  25.68 
 
 		 223 aa  46.6  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0707  cytochrome c554  29.87 
 
 		 146 aa  46.6  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0287  cytochrome c, class I  30.56 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1589  class I diheme cytochrome c4  26.11 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05467  cytochrome c  30.38 
 
 		 129 aa  46.6  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  23.95 
 
 		 217 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0261  cytochrome C, c4  28.28 
 
 		 222 aa  46.2  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  24.12 
 
 		 205 aa  45.8  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2878  cytochrome c class I  27.14 
 
 		 219 aa  45.8  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0629  cytochrome c, class I  28 
 
 		 102 aa  45.8  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>