37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2349 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2349  cytochrome c family protein  100 
 
 		 203 aa  423  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2431  cytochrome c family protein  58.54 
 
 		 209 aa  255  3e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.684089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3254  cytochrome c family protein  47.43 
 
 		 186 aa  170  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00276753  normal  0.22329 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1944  cytochrome c family protein  42.63 
 
 		 191 aa  164  8e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.731433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5183  hypothetical protein  48.02 
 
 		 260 aa  161  6e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.488725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0012  hypothetical protein  50.32 
 
 		 259 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.276969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0012  hypothetical protein  50.32 
 
 		 259 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00152661  normal  0.126895 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0014  hypothetical protein  50.32 
 
 		 259 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0801352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2216  hypothetical protein  47.53 
 
 		 280 aa  159  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0103388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0572  hypothetical protein  53.85 
 
 		 257 aa  158  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5378  cytochrome c family protein  50.68 
 
 		 260 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.467714 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4637  cytochrome c family protein  46.75 
 
 		 205 aa  153  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4387  cytochrome c family protein  44.91 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2260  cytochrome c family protein  45.14 
 
 		 215 aa  138  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0699  putative cytochrome c heme-binding site  40 
 
 		 206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.517675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0708  hypothetical protein  37.43 
 
 		 197 aa  129  3e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295547 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1593  cytochrome c heme-binding site  40.69 
 
 		 212 aa  125  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.275118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2733  putative cytochrome c class I protein  40.54 
 
 		 170 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3238  cytochrome c family protein  42.04 
 
 		 174 aa  121  8e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1995  cytochrome c class I  35.29 
 
 		 293 aa  118  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0213556  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1034  cytochrome c family protein  33.15 
 
 		 212 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2582  cytochrome c family protein  32.32 
 
 		 212 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.423812 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1103  putative cytochrome c class I protein  39.13 
 
 		 181 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4759  cytochrome c class I protein  38.16 
 
 		 373 aa  108  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.880991  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0070  putative cytochrome c class I protein  38.24 
 
 		 199 aa  104  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.327353 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2793  cytochrome c, class I  35.92 
 
 		 379 aa  97.8  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0531198  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1764  cytochrome c, class I  34.95 
 
 		 382 aa  94.4  9e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000218169  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1751  cytochrome c, class I  32.93 
 
 		 414 aa  92.8  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.399641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0115  class I triheme cytochrome c  32.88 
 
 		 414 aa  88.2  8e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4349  hypothetical protein  28.57 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00411477  normal  0.348874 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3705  hypothetical protein  29.01 
 
 		 155 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1704  cytochrome c, monohaem  30 
 
 		 878 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0850  hypothetical protein  30.85 
 
 		 119 aa  47.8  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1593  hypothetical protein  31.07 
 
 		 127 aa  45.4  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6117  cytochrome c protein CopJ  29.6 
 
 		 174 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0965626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1596  hypothetical protein  27.27 
 
 		 136 aa  41.6  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0885  cytochrome c, class I  23.08 
 
 		 156 aa  41.2  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457158  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>