47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2431 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2431  cytochrome c family protein  100 
 
 		 209 aa  434  1e-121  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.684089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2349  cytochrome c family protein  58.54 
 
 		 203 aa  255  3e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3254  cytochrome c family protein  51.48 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00276753  normal  0.22329 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4637  cytochrome c family protein  45.5 
 
 		 205 aa  157  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1944  cytochrome c family protein  42.7 
 
 		 191 aa  156  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.731433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0012  hypothetical protein  47.85 
 
 		 259 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00152661  normal  0.126895 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0012  hypothetical protein  47.85 
 
 		 259 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.276969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0014  hypothetical protein  47.85 
 
 		 259 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0801352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4387  cytochrome c family protein  43.65 
 
 		 206 aa  149  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5183  hypothetical protein  42.93 
 
 		 260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.488725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2260  cytochrome c family protein  45.4 
 
 		 215 aa  144  7.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2216  hypothetical protein  45.68 
 
 		 280 aa  144  9e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0103388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0699  putative cytochrome c heme-binding site  39.81 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.517675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0708  hypothetical protein  42.08 
 
 		 197 aa  141  8e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295547 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5378  cytochrome c family protein  42.29 
 
 		 260 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.467714 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1593  cytochrome c heme-binding site  42.42 
 
 		 212 aa  138  4.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.275118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0572  hypothetical protein  44.25 
 
 		 257 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0070  putative cytochrome c class I protein  43.02 
 
 		 199 aa  127  9.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.327353 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1103  putative cytochrome c class I protein  43.56 
 
 		 181 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3238  cytochrome c family protein  40.12 
 
 		 174 aa  124  8.000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2582  cytochrome c family protein  36.82 
 
 		 212 aa  122  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.423812 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2733  putative cytochrome c class I protein  41.38 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1034  cytochrome c family protein  34.48 
 
 		 212 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4759  cytochrome c class I protein  39.73 
 
 		 373 aa  106  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.880991  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1995  cytochrome c class I  33.69 
 
 		 293 aa  105  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0213556  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2793  cytochrome c, class I  37.76 
 
 		 379 aa  97.8  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0531198  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1764  cytochrome c, class I  33.71 
 
 		 382 aa  87.8  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000218169  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1751  cytochrome c, class I  32.53 
 
 		 414 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.399641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0115  class I triheme cytochrome c  31.51 
 
 		 414 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4349  hypothetical protein  29.3 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00411477  normal  0.348874 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3705  hypothetical protein  35.51 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1704  cytochrome c, monohaem  30.21 
 
 		 878 aa  53.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2302  iron permease FTR1  34.74 
 
 		 652 aa  46.2  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0292  iron permease FTR1  31.62 
 
 		 629 aa  44.3  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0850  hypothetical protein  28.72 
 
 		 119 aa  44.7  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1593  hypothetical protein  30.77 
 
 		 127 aa  43.9  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0180  cytochrome c family protein  34.48 
 
 		 636 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.558942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2222  cytochrome c, class I  30 
 
 		 395 aa  43.5  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000427443  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  34.48 
 
 		 647 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 647 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1824  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  27.75 
 
 		 317 aa  42.4  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  28.74 
 
 		 546 aa  42.4  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0885  cytochrome c, class I  28.26 
 
 		 156 aa  42.4  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6106  putative cytochrome protein CopT  28.95 
 
 		 254 aa  42  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.0345591 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2561  iron permease FTR1  34.04 
 
 		 647 aa  42  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1817  iron permease FTR1  32.63 
 
 		 640 aa  41.6  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.214502 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3637  iron permease FTR1  32.65 
 
 		 664 aa  41.2  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.489611 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>