192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2561 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2302  iron permease FTR1  59.6 
 
 		 652 aa  722    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3637  iron permease FTR1  58.15 
 
 		 664 aa  690    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2561  iron permease FTR1  100 
 
 		 647 aa  1271    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2353  permease  53.57 
 
 		 653 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5282  iron permease FTR1  50.49 
 
 		 642 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1817  iron permease FTR1  50.58 
 
 		 640 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.214502 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1641  iron permease FTR1  50.49 
 
 		 642 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5945  Pb(II)-uptake protein PbrT  48.37 
 
 		 642 aa  578  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  53.27 
 
 		 643 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5350  iron permease FTR1  50.66 
 
 		 640 aa  571  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.620494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  52.13 
 
 		 644 aa  566  1e-160  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0482  iron permease FTR1  52.96 
 
 		 649 aa  541  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  41.8 
 
 		 653 aa  435  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  41.63 
 
 		 645 aa  431  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2954  iron permease FTR1  38.32 
 
 		 652 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1058  iron permease FTR1  38.46 
 
 		 683 aa  398  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0352795  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1953  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  37.58 
 
 		 637 aa  394  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.002939  normal  0.431592 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0723  cytochrome c, class I  43.97 
 
 		 657 aa  387  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694021  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0180  cytochrome c family protein  39.51 
 
 		 636 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.558942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  40.29 
 
 		 647 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  39.8 
 
 		 647 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69300  hypothetical protein  41.12 
 
 		 633 aa  360  6e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5470  cytochrome c, class I  39.54 
 
 		 631 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0141  lead uptake protein, putative  37.82 
 
 		 632 aa  357  5e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0049  cytochrome c, class I:Iron permease FTR1  38.4 
 
 		 632 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5993  hypothetical protein  41.3 
 
 		 652 aa  353  5e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0292  iron permease FTR1  40.59 
 
 		 629 aa  345  2e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6106  putative cytochrome protein CopT  44.35 
 
 		 254 aa  193  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.0345591 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2252  iron permease FTR1  32.48 
 
 		 639 aa  166  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2132  FTR1 family iron permease  32.48 
 
 		 639 aa  165  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0517239 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2141  FTR1 family iron permease  32.48 
 
 		 639 aa  165  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1783  iron permease FTR1  33.82 
 
 		 634 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.498306  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1385  iron permease FTR1  32.76 
 
 		 634 aa  159  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0450  FTR1 family iron permease  31.75 
 
 		 679 aa  155  2.9999999999999998e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000168197  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2017  iron permease FTR1  32.04 
 
 		 413 aa  154  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00650927  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0822  iron permease FTR1  35.37 
 
 		 396 aa  153  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0160  iron permease FTR1 family protein  31.16 
 
 		 572 aa  148  3e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.31653 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0524  FTR1 family iron permease  29.59 
 
 		 637 aa  147  6e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.210875  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0433  fumarate hydratase class II (fumarase C)  30.48 
 
 		 646 aa  141  3e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000013758  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1022  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  27.98 
 
 		 556 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2809  Iron permease FTR1  31.4 
 
 		 660 aa  134  6e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1510  hypothetical protein  32.77 
 
 		 422 aa  131  5.0000000000000004e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000353289  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1649  FTR1 family iron permease  32.13 
 
 		 696 aa  130  7.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1830  FTR1 family iron permease  31.83 
 
 		 696 aa  129  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0763  superoxide dismutase  29.59 
 
 		 647 aa  128  3e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.745778  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1255  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  28.61 
 
 		 603 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1170  iron permease, FTR1 family  31.94 
 
 		 691 aa  123  9e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.900718  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2018  FTR1 family iron permease  31.79 
 
 		 696 aa  120  9e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0393  hypothetical protein  25.76 
 
 		 570 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0403  hypothetical protein  25.76 
 
 		 570 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2443  iron permease FTR1  33.9 
 
 		 399 aa  114  7.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2692  iron permease FTR1  34.69 
 
 		 273 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.37589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0820  iron permease FTR1  28.76 
 
 		 782 aa  89.7  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.594209  hitchhiker  0.0000623566 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5728  iron permease FTR1  27.81 
 
 		 846 aa  88.6  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2435  iron permease FTR1  27.12 
 
 		 743 aa  86.7  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4468  iron permease FTR1  28.61 
 
 		 779 aa  81.3  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.390175  normal  0.0190609 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2612  iron permease FTR1  28.51 
 
 		 308 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000110205  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1870  iron permease FTR1  28.8 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1936  iron permease FTR1  36.53 
 
 		 279 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0480645 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1733  iron permease FTR1  30.6 
 
 		 304 aa  75.9  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.997501  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2597  Iron permease FTR1  30.2 
 
 		 290 aa  73.9  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1914  iron permease FTR1  35.27 
 
 		 281 aa  73.2  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2929  iron permease FTR1  30.81 
 
 		 281 aa  72  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00359497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4287  iron permease FTR1  33.33 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486354  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0161  cytochrome c class I  41.25 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000207523  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1660  iron permease FTR1  32.85 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0188  iron permease FTR1  33.66 
 
 		 283 aa  69.7  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0228999 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1789  iron permease FTR1  29.68 
 
 		 315 aa  70.1  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3596  hypothetical protein  30.33 
 
 		 284 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4773  iron permease FTR1  33.18 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3143  iron permease FTR1  30.14 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3473  iron permease FTR1  30.89 
 
 		 308 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3367  Iron permease FTR1  29.67 
 
 		 284 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226405  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2959  cytochrome c class I  36.36 
 
 		 571 aa  66.2  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0120  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  36.19 
 
 		 339 aa  65.5  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5686  iron permease FTR1  31.28 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.435606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3403  iron permease FTR1  34.78 
 
 		 702 aa  64.7  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1952  iron permease FTR1  33.49 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495146  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2784  iron permease FTR1  30 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0101  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  34.45 
 
 		 329 aa  63.9  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000967148 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2277  cytochrome c, class I  41.57 
 
 		 128 aa  63.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1763  Iron permease FTR1  30.28 
 
 		 315 aa  63.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1674  cytochrome c class I  43.21 
 
 		 128 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5173  iron permease FTR1  32.91 
 
 		 314 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000262497 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3348  iron permease FTR1  30.77 
 
 		 677 aa  63.2  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01019  putative membrane protein  30.99 
 
 		 279 aa  62  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.348057  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2872  Iron permease FTR1  29.19 
 
 		 279 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.121627  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1258  iron permease FTR1 family protein  30.99 
 
 		 276 aa  62  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.20725  normal  0.52486 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01026  hypothetical protein  30.99 
 
 		 276 aa  62  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.377125  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2579  FTR1 family protein  30.99 
 
 		 276 aa  62  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1132  iron permease FTR1 family protein  30.99 
 
 		 276 aa  62  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0198612  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1136  FTR1 family iron permease  30.99 
 
 		 276 aa  62  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.161686  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2106  iron permease FTR1 family protein  30.99 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.178558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4913  iron permease FTR1  28.57 
 
 		 579 aa  62  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0468  iron permease FTR1  26.85 
 
 		 820 aa  61.6  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.402804  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0839  iron permease FTR1  28.44 
 
 		 308 aa  62  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0433  iron permease FTR1  31.88 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287745 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2366  iron permease FTR1  29.41 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0450502  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1598  cytochrome c, class I  41.98 
 
 		 128 aa  60.8  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2040  ferrous iron permease EfeU  29.83 
 
 		 285 aa  60.5  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.19312 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>