167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2302 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3637  iron permease FTR1  56.65 
 
 		 664 aa  650    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2561  iron permease FTR1  60.99 
 
 		 647 aa  717    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2302  iron permease FTR1  100 
 
 		 652 aa  1286    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5282  iron permease FTR1  51.39 
 
 		 642 aa  611  1e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1641  iron permease FTR1  51.39 
 
 		 642 aa  611  1e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1817  iron permease FTR1  50.74 
 
 		 640 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.214502 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5945  Pb(II)-uptake protein PbrT  51.58 
 
 		 642 aa  598  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2353  permease  52.72 
 
 		 653 aa  598  1e-169  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5350  iron permease FTR1  50.48 
 
 		 640 aa  594  1e-168  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.620494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  52.63 
 
 		 644 aa  580  1e-164  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  52.76 
 
 		 643 aa  558  1e-158  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0482  iron permease FTR1  53.58 
 
 		 649 aa  553  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  43.5 
 
 		 645 aa  481  1e-134  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  40.95 
 
 		 653 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2954  iron permease FTR1  40.33 
 
 		 652 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0723  cytochrome c, class I  43.85 
 
 		 657 aa  412  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694021  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1953  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  39.33 
 
 		 637 aa  395  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.002939  normal  0.431592 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1058  iron permease FTR1  38.35 
 
 		 683 aa  393  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0352795  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0180  cytochrome c family protein  39.03 
 
 		 636 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.558942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  38.87 
 
 		 647 aa  382  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  39.34 
 
 		 647 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69300  hypothetical protein  38.4 
 
 		 633 aa  365  1e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5993  hypothetical protein  38.58 
 
 		 652 aa  355  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5470  cytochrome c, class I  37.66 
 
 		 631 aa  352  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0141  lead uptake protein, putative  36.44 
 
 		 632 aa  342  1e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0049  cytochrome c, class I:Iron permease FTR1  37.01 
 
 		 632 aa  335  1e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0292  iron permease FTR1  37.82 
 
 		 629 aa  330  3e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6106  putative cytochrome protein CopT  47.74 
 
 		 254 aa  189  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.0345591 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1783  iron permease FTR1  34.29 
 
 		 634 aa  171  5e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.498306  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2252  iron permease FTR1  33.52 
 
 		 639 aa  170  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1385  iron permease FTR1  34.2 
 
 		 634 aa  169  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2141  FTR1 family iron permease  33.52 
 
 		 639 aa  170  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2132  FTR1 family iron permease  33.52 
 
 		 639 aa  170  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0517239 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2017  iron permease FTR1  34.29 
 
 		 413 aa  160  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00650927  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0450  FTR1 family iron permease  31.83 
 
 		 679 aa  151  3e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000168197  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0433  fumarate hydratase class II (fumarase C)  30.3 
 
 		 646 aa  150  6e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000013758  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0160  iron permease FTR1 family protein  30.81 
 
 		 572 aa  144  4e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.31653 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1255  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  30.21 
 
 		 603 aa  139  2e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0822  iron permease FTR1  34.86 
 
 		 396 aa  139  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1649  FTR1 family iron permease  30.53 
 
 		 696 aa  138  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1830  FTR1 family iron permease  30.53 
 
 		 696 aa  138  4e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2809  Iron permease FTR1  31.4 
 
 		 660 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1170  iron permease, FTR1 family  31.82 
 
 		 691 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.900718  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2443  iron permease FTR1  35.93 
 
 		 399 aa  132  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2018  FTR1 family iron permease  30.82 
 
 		 696 aa  128  3e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0524  FTR1 family iron permease  29.44 
 
 		 637 aa  128  4.0000000000000003e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.210875  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1510  hypothetical protein  30.47 
 
 		 422 aa  124  7e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000353289  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0763  superoxide dismutase  29.81 
 
 		 647 aa  123  9.999999999999999e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.745778  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1022  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  28.19 
 
 		 556 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2435  iron permease FTR1  31.54 
 
 		 743 aa  120  6e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0393  hypothetical protein  27.99 
 
 		 570 aa  117  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0403  hypothetical protein  27.99 
 
 		 570 aa  117  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2692  iron permease FTR1  33.6 
 
 		 273 aa  95.5  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.37589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0820  iron permease FTR1  30.47 
 
 		 782 aa  92.4  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.594209  hitchhiker  0.0000623566 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4468  iron permease FTR1  30.77 
 
 		 779 aa  89.7  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.390175  normal  0.0190609 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5728  iron permease FTR1  27.21 
 
 		 846 aa  84.3  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0468  iron permease FTR1  29.23 
 
 		 820 aa  81.6  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.402804  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1733  iron permease FTR1  30.67 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.997501  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1914  iron permease FTR1  37.44 
 
 		 281 aa  79.3  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0161  cytochrome c class I  41.46 
 
 		 254 aa  75.9  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000207523  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2929  iron permease FTR1  29.38 
 
 		 281 aa  75.1  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00359497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2597  Iron permease FTR1  30 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25520  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  32.88 
 
 		 294 aa  72.4  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0297463  normal  0.133563 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0188  iron permease FTR1  31.75 
 
 		 283 aa  72  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0228999 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3596  hypothetical protein  31.16 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1870  iron permease FTR1  27.97 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3367  Iron permease FTR1  31.6 
 
 		 284 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3143  iron permease FTR1  30.95 
 
 		 281 aa  70.5  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2330  High-affinity Fe2+/Pb2+ permease-like protein  29.93 
 
 		 325 aa  70.5  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00178906  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1789  iron permease FTR1  30.45 
 
 		 315 aa  70.1  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01019  putative membrane protein  30.73 
 
 		 279 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.348057  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1258  iron permease FTR1 family protein  30.73 
 
 		 276 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.20725  normal  0.52486 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01026  hypothetical protein  30.73 
 
 		 276 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.377125  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2579  FTR1 family protein  30.73 
 
 		 276 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1132  iron permease FTR1 family protein  30.73 
 
 		 276 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0198612  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1136  FTR1 family iron permease  30.73 
 
 		 276 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.161686  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2106  iron permease FTR1 family protein  30.73 
 
 		 276 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.178558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2872  Iron permease FTR1  29.86 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.121627  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4773  iron permease FTR1  33.79 
 
 		 303 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1545  FTR1 family protein  30.28 
 
 		 277 aa  68.6  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.884821  normal  0.11427 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3348  iron permease FTR1  33.49 
 
 		 677 aa  68.2  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5686  iron permease FTR1  30.3 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.435606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1952  iron permease FTR1  32.14 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495146  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1763  Iron permease FTR1  29.86 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3403  iron permease FTR1  32.85 
 
 		 702 aa  66.6  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0120  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  36.7 
 
 		 339 aa  66.2  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1811  iron permease FTR1  29.58 
 
 		 283 aa  65.9  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.668278 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3473  iron permease FTR1  31.05 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1660  iron permease FTR1  29.05 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5173  iron permease FTR1  29.56 
 
 		 314 aa  65.1  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000262497 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0101  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  35.29 
 
 		 329 aa  64.7  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000967148 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4287  iron permease FTR1  28.81 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486354  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2366  iron permease FTR1  27.31 
 
 		 282 aa  64.7  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0450502  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2784  iron permease FTR1  31.31 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2040  ferrous iron permease EfeU  27.31 
 
 		 285 aa  64.3  0.000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.19312 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0229  iron permease FTR1  31.94 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2264  ferrous iron permease EfeU  27.31 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0433  iron permease FTR1  29.05 
 
 		 278 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287745 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2277  cytochrome c, class I  40.45 
 
 		 128 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1674  cytochrome c class I  40.23 
 
 		 128 aa  63.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>