130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0450 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0524  FTR1 family iron permease  55.86 
 
 		 637 aa  710    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.210875  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0450  FTR1 family iron permease  100 
 
 		 679 aa  1358    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000168197  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0433  fumarate hydratase class II (fumarase C)  47.16 
 
 		 646 aa  566  1e-160  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000013758  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0763  superoxide dismutase  46.81 
 
 		 647 aa  555  1e-157  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.745778  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1649  FTR1 family iron permease  39.11 
 
 		 696 aa  399  9.999999999999999e-111  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1170  iron permease, FTR1 family  38.25 
 
 		 691 aa  401  9.999999999999999e-111  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.900718  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1830  FTR1 family iron permease  38.54 
 
 		 696 aa  397  1e-109  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2809  Iron permease FTR1  36.29 
 
 		 660 aa  396  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1385  iron permease FTR1  34.44 
 
 		 634 aa  390  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1783  iron permease FTR1  34.01 
 
 		 634 aa  389  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.498306  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2018  FTR1 family iron permease  38.81 
 
 		 696 aa  384  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2141  FTR1 family iron permease  32.76 
 
 		 639 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2132  FTR1 family iron permease  32.76 
 
 		 639 aa  367  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0517239 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2252  iron permease FTR1  32.76 
 
 		 639 aa  368  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0160  iron permease FTR1 family protein  34.47 
 
 		 572 aa  208  2e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.31653 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0822  iron permease FTR1  31.97 
 
 		 396 aa  195  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1510  hypothetical protein  34.96 
 
 		 422 aa  192  2e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000353289  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  33.51 
 
 		 653 aa  174  5e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2954  iron permease FTR1  31.62 
 
 		 652 aa  171  5e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  32.04 
 
 		 645 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2017  iron permease FTR1  29.38 
 
 		 413 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00650927  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1255  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  29.86 
 
 		 603 aa  161  4e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2353  permease  32.1 
 
 		 653 aa  159  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1058  iron permease FTR1  29.54 
 
 		 683 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0352795  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1817  iron permease FTR1  32.65 
 
 		 640 aa  153  8e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.214502 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5282  iron permease FTR1  31.5 
 
 		 642 aa  152  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  34.17 
 
 		 643 aa  152  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1641  iron permease FTR1  31.5 
 
 		 642 aa  152  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5350  iron permease FTR1  31.84 
 
 		 640 aa  152  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.620494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5945  Pb(II)-uptake protein PbrT  32.75 
 
 		 642 aa  150  9e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1953  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  31.41 
 
 		 637 aa  147  8.000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.002939  normal  0.431592 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3637  iron permease FTR1  29.17 
 
 		 664 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0482  iron permease FTR1  31.28 
 
 		 649 aa  142  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  32.11 
 
 		 644 aa  141  4.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2302  iron permease FTR1  31.83 
 
 		 652 aa  138  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0180  cytochrome c family protein  27.27 
 
 		 636 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.558942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  26.99 
 
 		 647 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0723  cytochrome c, class I  35.16 
 
 		 657 aa  134  7.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694021  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2561  iron permease FTR1  30.21 
 
 		 647 aa  134  7.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  26.99 
 
 		 647 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0049  cytochrome c, class I:Iron permease FTR1  27.75 
 
 		 632 aa  132  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0141  lead uptake protein, putative  28.34 
 
 		 632 aa  130  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2692  iron permease FTR1  34.11 
 
 		 273 aa  130  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.37589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1022  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  35.23 
 
 		 556 aa  130  7.000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5470  cytochrome c, class I  28.9 
 
 		 631 aa  127  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69300  hypothetical protein  27.39 
 
 		 633 aa  127  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0292  iron permease FTR1  28.69 
 
 		 629 aa  126  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5993  hypothetical protein  28.74 
 
 		 652 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0393  hypothetical protein  28.57 
 
 		 570 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0403  hypothetical protein  28.57 
 
 		 570 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2443  iron permease FTR1  29.07 
 
 		 399 aa  110  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2435  iron permease FTR1  24.83 
 
 		 743 aa  108  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1936  iron permease FTR1  32.74 
 
 		 279 aa  97.1  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0480645 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5728  iron permease FTR1  27.16 
 
 		 846 aa  92.4  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1870  iron permease FTR1  33.2 
 
 		 417 aa  89.7  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2612  iron permease FTR1  31.56 
 
 		 308 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000110205  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4287  iron permease FTR1  33.98 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486354  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0468  iron permease FTR1  24.18 
 
 		 820 aa  82.4  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.402804  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0839  iron permease FTR1  33.5 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2258  iron permease FTR1  30.13 
 
 		 276 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1981  iron permease FTR1  29.49 
 
 		 276 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2929  iron permease FTR1  32.84 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00359497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3143  iron permease FTR1  32.67 
 
 		 281 aa  71.6  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0820  iron permease FTR1  25 
 
 		 782 aa  71.2  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.594209  hitchhiker  0.0000623566 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4468  iron permease FTR1  26.03 
 
 		 779 aa  70.5  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.390175  normal  0.0190609 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2784  iron permease FTR1  32.84 
 
 		 281 aa  69.7  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25520  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  30.71 
 
 		 294 aa  69.7  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0297463  normal  0.133563 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3473  iron permease FTR1  31.18 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1545  FTR1 family protein  32.49 
 
 		 277 aa  68.6  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.884821  normal  0.11427 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1733  iron permease FTR1  31.34 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.997501  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1399  iron permease FTR1  28.32 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0193139  normal  0.052775 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4913  iron permease FTR1  30 
 
 		 579 aa  66.2  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3403  iron permease FTR1  37.04 
 
 		 702 aa  65.9  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1914  iron permease FTR1  29.3 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1811  iron permease FTR1  31.63 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.668278 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5173  iron permease FTR1  33.16 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000262497 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5686  iron permease FTR1  29.7 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.435606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2597  Iron permease FTR1  30.85 
 
 		 290 aa  63.5  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3367  Iron permease FTR1  36.88 
 
 		 284 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7009  iron permease FTR1  30.48 
 
 		 291 aa  62.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  0.35089 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1955  iron permease FTR1  29.02 
 
 		 281 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0621861  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3596  hypothetical protein  36.17 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01019  putative membrane protein  31.84 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.348057  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3150  oxidase-dependent Fe2+ transporter, (OFeT)family, FTR1-like  26.99 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.92636  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0229  iron permease FTR1  31 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1132  iron permease FTR1 family protein  31.84 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0198612  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1136  FTR1 family iron permease  31.84 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.161686  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2579  FTR1 family protein  31.84 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2106  iron permease FTR1 family protein  31.84 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.178558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01026  hypothetical protein  31.84 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.377125  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1258  iron permease FTR1 family protein  31.84 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.20725  normal  0.52486 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1177  iron permease FTR1  34.33 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0971353  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0188  iron permease FTR1  29.59 
 
 		 283 aa  59.3  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0228999 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2040  ferrous iron permease EfeU  32.49 
 
 		 285 aa  58.9  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.19312 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2366  iron permease FTR1  32.99 
 
 		 282 aa  58.9  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0450502  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2264  ferrous iron permease EfeU  32.99 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2033  FTR1 family iron permease  26.61 
 
 		 280 aa  57  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5535  Iron permease FTR1  25.23 
 
 		 280 aa  55.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3348  iron permease FTR1  25.58 
 
 		 677 aa  55.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3859  iron permease FTR1  31.43 
 
 		 280 aa  55.8  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.627947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>