133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2692 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2692  iron permease FTR1  100 
 
 		 273 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.37589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1936  iron permease FTR1  51.36 
 
 		 279 aa  198  9e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0480645 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0822  iron permease FTR1  41.15 
 
 		 396 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2258  iron permease FTR1  54.43 
 
 		 276 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1981  iron permease FTR1  54.01 
 
 		 276 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0160  iron permease FTR1 family protein  35.97 
 
 		 572 aa  145  6e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.31653 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0433  fumarate hydratase class II (fumarase C)  32.84 
 
 		 646 aa  144  1e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000013758  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0450  FTR1 family iron permease  34.11 
 
 		 679 aa  136  5e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000168197  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2252  iron permease FTR1  33.59 
 
 		 639 aa  135  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2141  FTR1 family iron permease  33.59 
 
 		 639 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2132  FTR1 family iron permease  33.59 
 
 		 639 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0517239 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0524  FTR1 family iron permease  31.85 
 
 		 637 aa  132  5e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.210875  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1385  iron permease FTR1  34.82 
 
 		 634 aa  130  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2809  Iron permease FTR1  33.33 
 
 		 660 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1830  FTR1 family iron permease  33.72 
 
 		 696 aa  126  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1783  iron permease FTR1  33.48 
 
 		 634 aa  126  5e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.498306  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1649  FTR1 family iron permease  33.72 
 
 		 696 aa  125  6e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0763  superoxide dismutase  31.32 
 
 		 647 aa  124  1e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.745778  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1510  hypothetical protein  32.09 
 
 		 422 aa  123  3e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000353289  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1170  iron permease, FTR1 family  32.21 
 
 		 691 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.900718  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2018  FTR1 family iron permease  33.74 
 
 		 696 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2954  iron permease FTR1  34.26 
 
 		 652 aa  116  5e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  35.14 
 
 		 643 aa  110  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  34.81 
 
 		 644 aa  108  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1817  iron permease FTR1  33.88 
 
 		 640 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.214502 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1255  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  31.71 
 
 		 603 aa  105  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5282  iron permease FTR1  33.98 
 
 		 642 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1641  iron permease FTR1  33.98 
 
 		 642 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3637  iron permease FTR1  32.65 
 
 		 664 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5945  Pb(II)-uptake protein PbrT  33.46 
 
 		 642 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  32.83 
 
 		 645 aa  103  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0482  iron permease FTR1  32.58 
 
 		 649 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2302  iron permease FTR1  33.6 
 
 		 652 aa  102  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1022  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  30.04 
 
 		 556 aa  102  9e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2561  iron permease FTR1  34.05 
 
 		 647 aa  101  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5350  iron permease FTR1  32.65 
 
 		 640 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.620494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2017  iron permease FTR1  34.87 
 
 		 413 aa  99.4  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00650927  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69300  hypothetical protein  32.85 
 
 		 633 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  31.44 
 
 		 653 aa  97.8  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1058  iron permease FTR1  30.24 
 
 		 683 aa  97.8  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0352795  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2353  permease  32.17 
 
 		 653 aa  97.1  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  34.8 
 
 		 647 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0180  cytochrome c family protein  34.27 
 
 		 636 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.558942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  34.27 
 
 		 647 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0141  lead uptake protein, putative  31.47 
 
 		 632 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1953  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  30.62 
 
 		 637 aa  90.9  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.002939  normal  0.431592 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0393  hypothetical protein  28.35 
 
 		 570 aa  90.5  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0403  hypothetical protein  28.35 
 
 		 570 aa  90.5  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5993  hypothetical protein  34.1 
 
 		 652 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5470  cytochrome c, class I  31.98 
 
 		 631 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0049  cytochrome c, class I:Iron permease FTR1  32.14 
 
 		 632 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0292  iron permease FTR1  33.58 
 
 		 629 aa  87  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0820  iron permease FTR1  29.89 
 
 		 782 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.594209  hitchhiker  0.0000623566 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5728  iron permease FTR1  28.85 
 
 		 846 aa  83.2  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0723  cytochrome c, class I  35 
 
 		 657 aa  81.6  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694021  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4468  iron permease FTR1  27 
 
 		 779 aa  80.1  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.390175  normal  0.0190609 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1870  iron permease FTR1  31.92 
 
 		 417 aa  79  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2443  iron permease FTR1  31.53 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2435  iron permease FTR1  27.61 
 
 		 743 aa  72  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1177  iron permease FTR1  38.41 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0971353  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2612  iron permease FTR1  26.48 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000110205  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0229  iron permease FTR1  33.94 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0433  iron permease FTR1  31.1 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287745 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1660  iron permease FTR1  30.14 
 
 		 278 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0839  iron permease FTR1  26.89 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4913  iron permease FTR1  36.96 
 
 		 579 aa  64.7  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5686  iron permease FTR1  30.84 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.435606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0188  iron permease FTR1  32.65 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0228999 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0468  iron permease FTR1  27.3 
 
 		 820 aa  63.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.402804  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3596  hypothetical protein  31.08 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2597  Iron permease FTR1  32.23 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7009  iron permease FTR1  32.06 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  0.35089 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1733  iron permease FTR1  30 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.997501  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4287  iron permease FTR1  31.8 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486354  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3367  Iron permease FTR1  31.25 
 
 		 284 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5173  iron permease FTR1  30.15 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000262497 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1914  iron permease FTR1  34.43 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1789  iron permease FTR1  32.21 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2330  High-affinity Fe2+/Pb2+ permease-like protein  26.76 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00178906  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1545  FTR1 family protein  29.79 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.884821  normal  0.11427 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3352  iron permease FTR1  36.96 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.404846  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3898  iron permease FTR1  33.08 
 
 		 537 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25520  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  30.14 
 
 		 294 aa  55.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0297463  normal  0.133563 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1955  iron permease FTR1  27.8 
 
 		 281 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0621861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4318  iron permease FTR1  27.44 
 
 		 303 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000385507  hitchhiker  0.00248903 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2872  Iron permease FTR1  27.55 
 
 		 279 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.121627  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4257  iron permease FTR1  27.44 
 
 		 303 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3143  iron permease FTR1  30.87 
 
 		 281 aa  53.9  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1399  iron permease FTR1  26.94 
 
 		 281 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0193139  normal  0.052775 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3150  oxidase-dependent Fe2+ transporter, (OFeT)family, FTR1-like  26.42 
 
 		 281 aa  53.5  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.92636  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4287  iron permease FTR1  30.52 
 
 		 283 aa  53.5  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.973279  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2033  FTR1 family iron permease  26.22 
 
 		 280 aa  52.8  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1954  iron permease FTR1  34.07 
 
 		 289 aa  52.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.860822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2784  iron permease FTR1  28.04 
 
 		 281 aa  52.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01019  putative membrane protein  30.37 
 
 		 279 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.348057  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1763  Iron permease FTR1  31.13 
 
 		 315 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1923  FTR1 family iron permease  27.04 
 
 		 280 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1742  OFeT family iron transporter  27.04 
 
 		 280 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0322131  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0608  OFeT family iron transporter  27.04 
 
 		 280 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.189417  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0510  OFeT family iron transporter  27.04 
 
 		 280 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>