155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1981 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1981  iron permease FTR1  100 
 
 		 276 aa  533  1e-150  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2258  iron permease FTR1  98.19 
 
 		 276 aa  524  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1936  iron permease FTR1  91.04 
 
 		 279 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0480645 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2692  iron permease FTR1  52.16 
 
 		 273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.37589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0822  iron permease FTR1  43.05 
 
 		 396 aa  144  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0160  iron permease FTR1 family protein  36.12 
 
 		 572 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.31653 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0433  fumarate hydratase class II (fumarase C)  33.46 
 
 		 646 aa  132  3.9999999999999996e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000013758  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2141  FTR1 family iron permease  34.51 
 
 		 639 aa  132  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2132  FTR1 family iron permease  34.51 
 
 		 639 aa  132  6.999999999999999e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0517239 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2252  iron permease FTR1  34.51 
 
 		 639 aa  132  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1783  iron permease FTR1  33.77 
 
 		 634 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.498306  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1510  hypothetical protein  35.27 
 
 		 422 aa  124  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000353289  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1385  iron permease FTR1  33.99 
 
 		 634 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2954  iron permease FTR1  32.72 
 
 		 652 aa  118  9e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0450  FTR1 family iron permease  31.28 
 
 		 679 aa  116  3.9999999999999997e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000168197  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2017  iron permease FTR1  35.08 
 
 		 413 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00650927  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0763  superoxide dismutase  31.5 
 
 		 647 aa  113  3e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.745778  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1058  iron permease FTR1  32.02 
 
 		 683 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0352795  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2809  Iron permease FTR1  31.82 
 
 		 660 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1255  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  32.22 
 
 		 603 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0524  FTR1 family iron permease  31.58 
 
 		 637 aa  110  3e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.210875  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0393  hypothetical protein  31.45 
 
 		 570 aa  105  9e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0403  hypothetical protein  31.45 
 
 		 570 aa  105  9e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1170  iron permease, FTR1 family  32.75 
 
 		 691 aa  104  1e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.900718  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1830  FTR1 family iron permease  32.88 
 
 		 696 aa  99.8  4e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1649  FTR1 family iron permease  32.88 
 
 		 696 aa  99.4  5e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2018  FTR1 family iron permease  32.88 
 
 		 696 aa  98.6  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1022  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  30.52 
 
 		 556 aa  96.3  5e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0049  cytochrome c, class I:Iron permease FTR1  33.19 
 
 		 632 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0141  lead uptake protein, putative  32.02 
 
 		 632 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  31.65 
 
 		 653 aa  91.7  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2561  iron permease FTR1  36.53 
 
 		 647 aa  92  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2353  permease  31.97 
 
 		 653 aa  90.5  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5470  cytochrome c, class I  32.76 
 
 		 631 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1953  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  30.57 
 
 		 637 aa  89  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.002939  normal  0.431592 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69300  hypothetical protein  30.51 
 
 		 633 aa  89  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  31.75 
 
 		 647 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5350  iron permease FTR1  32.13 
 
 		 640 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.620494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2302  iron permease FTR1  33.78 
 
 		 652 aa  87.4  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5945  Pb(II)-uptake protein PbrT  31.25 
 
 		 642 aa  86.3  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1817  iron permease FTR1  30.53 
 
 		 640 aa  86.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.214502 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1641  iron permease FTR1  31.67 
 
 		 642 aa  85.5  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5282  iron permease FTR1  31.67 
 
 		 642 aa  85.5  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5993  hypothetical protein  33.33 
 
 		 652 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0180  cytochrome c family protein  32.71 
 
 		 636 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.558942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2612  iron permease FTR1  30.05 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000110205  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0839  iron permease FTR1  31.92 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  30.95 
 
 		 647 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5728  iron permease FTR1  32.55 
 
 		 846 aa  83.6  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  30.23 
 
 		 645 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0292  iron permease FTR1  32.96 
 
 		 629 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0723  cytochrome c, class I  37.26 
 
 		 657 aa  82.4  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694021  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  32.06 
 
 		 643 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2435  iron permease FTR1  31.08 
 
 		 743 aa  80.5  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0820  iron permease FTR1  31.38 
 
 		 782 aa  80.1  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.594209  hitchhiker  0.0000623566 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1870  iron permease FTR1  29.86 
 
 		 417 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5686  iron permease FTR1  29.3 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.435606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4468  iron permease FTR1  31.28 
 
 		 779 aa  75.5  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.390175  normal  0.0190609 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  30.52 
 
 		 644 aa  75.5  0.0000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0468  iron permease FTR1  30.89 
 
 		 820 aa  74.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.402804  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2929  iron permease FTR1  30.19 
 
 		 281 aa  73.6  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00359497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0482  iron permease FTR1  30.62 
 
 		 649 aa  73.9  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3637  iron permease FTR1  29.77 
 
 		 664 aa  72.8  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1955  iron permease FTR1  26.82 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0621861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2784  iron permease FTR1  30.33 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2033  FTR1 family iron permease  27.91 
 
 		 280 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1733  iron permease FTR1  30.48 
 
 		 304 aa  67  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.997501  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1070  iron permease FTR1  27.78 
 
 		 280 aa  67  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.599025  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0883  FTR1 family iron permease  27.65 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1923  FTR1 family iron permease  27.65 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1742  OFeT family iron transporter  27.65 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0322131  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0012  OFeT family iron transporter  27.65 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0608  OFeT family iron transporter  27.65 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.189417  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0510  OFeT family iron transporter  27.65 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0912  OFeT family iron transporter  27.65 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.29643  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1177  iron permease FTR1  34.27 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0971353  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3150  oxidase-dependent Fe2+ transporter, (OFeT)family, FTR1-like  27.6 
 
 		 281 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.92636  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1399  iron permease FTR1  28.05 
 
 		 281 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0193139  normal  0.052775 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1811  iron permease FTR1  28.57 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.668278 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2245  iron permease FTR1  28.31 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.998183  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0188  iron permease FTR1  34.59 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0228999 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2124  iron permease FTR1  28.31 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.640841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5173  iron permease FTR1  30.33 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000262497 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2597  Iron permease FTR1  29.95 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3403  iron permease FTR1  33.18 
 
 		 702 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2366  iron permease FTR1  30.14 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0450502  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2264  ferrous iron permease EfeU  30.14 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2040  ferrous iron permease EfeU  30.23 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.19312 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5535  Iron permease FTR1  26.85 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1660  iron permease FTR1  29.95 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5870  iron permease FTR1  26.39 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.647838  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2231  iron permease FTR1  26.39 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2207  iron permease FTR1  26.39 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4913  iron permease FTR1  34.33 
 
 		 579 aa  63.5  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3198  iron permease FTR1  30.16 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.521431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3143  iron permease FTR1  28.43 
 
 		 281 aa  62.4  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4287  iron permease FTR1  32.69 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486354  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3352  iron permease FTR1  35.07 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.404846  normal  0.257454 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01019  putative membrane protein  30.56 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.348057  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3306  iron permease FTR1  31.9 
 
 		 273 aa  58.9  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.223999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>