152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7009 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7009  iron permease FTR1  100 
 
 		 291 aa  568  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  0.35089 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25520  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  56.78 
 
 		 294 aa  296  2e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0297463  normal  0.133563 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4287  iron permease FTR1  58.74 
 
 		 290 aa  287  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486354  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3388  iron permease FTR1  58.03 
 
 		 294 aa  279  4e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1914  iron permease FTR1  56.18 
 
 		 281 aa  273  3e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0229  iron permease FTR1  52.71 
 
 		 284 aa  269  4e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3403  iron permease FTR1  46.39 
 
 		 702 aa  239  4e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5686  iron permease FTR1  48.85 
 
 		 287 aa  235  8e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.435606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1777  iron permease FTR1  51.33 
 
 		 691 aa  231  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3348  iron permease FTR1  48.46 
 
 		 677 aa  217  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4773  iron permease FTR1  42.27 
 
 		 303 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1568  iron permease FTR1  43.4 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1952  iron permease FTR1  46.46 
 
 		 304 aa  179  7e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495146  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0188  iron permease FTR1  38.36 
 
 		 283 aa  177  3e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0228999 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2929  iron permease FTR1  37.46 
 
 		 281 aa  176  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00359497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1545  FTR1 family protein  39.58 
 
 		 277 aa  175  7e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.884821  normal  0.11427 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3859  iron permease FTR1  38.66 
 
 		 280 aa  170  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.627947  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3143  iron permease FTR1  36.62 
 
 		 281 aa  169  5e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3898  iron permease FTR1  41.15 
 
 		 537 aa  169  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2784  iron permease FTR1  38.16 
 
 		 281 aa  168  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1733  iron permease FTR1  37.41 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.997501  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2106  iron permease FTR1 family protein  38.52 
 
 		 276 aa  166  5e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.178558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01026  hypothetical protein  38.52 
 
 		 276 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.377125  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1258  iron permease FTR1 family protein  38.52 
 
 		 276 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.20725  normal  0.52486 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2579  FTR1 family protein  38.52 
 
 		 276 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1132  iron permease FTR1 family protein  38.52 
 
 		 276 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0198612  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1136  FTR1 family iron permease  38.52 
 
 		 276 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.161686  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01019  putative membrane protein  38.52 
 
 		 279 aa  165  8e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.348057  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3596  hypothetical protein  36.39 
 
 		 284 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0433  iron permease FTR1  39.62 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287745 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1660  iron permease FTR1  38.87 
 
 		 278 aa  160  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1811  iron permease FTR1  37.69 
 
 		 283 aa  160  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.668278 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2040  ferrous iron permease EfeU  34.74 
 
 		 285 aa  159  4e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.19312 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2366  iron permease FTR1  35.09 
 
 		 282 aa  159  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0450502  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3367  Iron permease FTR1  36.73 
 
 		 284 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2264  ferrous iron permease EfeU  35.09 
 
 		 282 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2597  Iron permease FTR1  37.72 
 
 		 290 aa  157  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3352  iron permease FTR1  42.69 
 
 		 277 aa  154  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.404846  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1954  iron permease FTR1  39.79 
 
 		 289 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.860822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2872  Iron permease FTR1  36.43 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.121627  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4913  iron permease FTR1  40 
 
 		 579 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3314  iron permease FTR1  38.38 
 
 		 281 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2875  iron permease FTR1  36.47 
 
 		 280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2612  iron permease FTR1  29.71 
 
 		 308 aa  106  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000110205  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0839  iron permease FTR1  29.77 
 
 		 308 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5173  iron permease FTR1  29.55 
 
 		 314 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000262497 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1177  iron permease FTR1  35.85 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0971353  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1870  iron permease FTR1  32.86 
 
 		 417 aa  97.1  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1789  iron permease FTR1  27.88 
 
 		 315 aa  95.9  7e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1763  Iron permease FTR1  28.21 
 
 		 315 aa  94  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3473  iron permease FTR1  29.41 
 
 		 308 aa  92  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3323  iron permease FTR1  27.87 
 
 		 307 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1783  iron permease FTR1  34.2 
 
 		 634 aa  91.3  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.498306  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1385  iron permease FTR1  35.6 
 
 		 634 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2421  high-affinity iron transporter  29.28 
 
 		 305 aa  89.4  7e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.328401  normal  0.0402063 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2252  iron permease FTR1  34.12 
 
 		 639 aa  88.6  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2141  FTR1 family iron permease  34.12 
 
 		 639 aa  88.2  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2132  FTR1 family iron permease  34.12 
 
 		 639 aa  88.2  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0517239 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2809  Iron permease FTR1  33.33 
 
 		 660 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4318  iron permease FTR1  27.53 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000385507  hitchhiker  0.00248903 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4257  iron permease FTR1  27.53 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  32 
 
 		 644 aa  76.3  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1058  iron permease FTR1  31.08 
 
 		 683 aa  74.3  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0352795  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  32.21 
 
 		 653 aa  73.2  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0450  FTR1 family iron permease  31.25 
 
 		 679 aa  73.6  0.000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000168197  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1356  iron permease FTR1  29.03 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.861658 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2954  iron permease FTR1  33.19 
 
 		 652 aa  72  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0883  FTR1 family iron permease  28.35 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1923  FTR1 family iron permease  28.35 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5535  Iron permease FTR1  27.95 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1742  OFeT family iron transporter  28.35 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0322131  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0012  OFeT family iron transporter  28.35 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0608  OFeT family iron transporter  28.35 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.189417  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0510  OFeT family iron transporter  28.35 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0912  OFeT family iron transporter  28.35 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.29643  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0160  iron permease FTR1 family protein  30.88 
 
 		 572 aa  70.5  0.00000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.31653 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5870  iron permease FTR1  28.24 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.647838  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2231  iron permease FTR1  28.24 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2207  iron permease FTR1  28.24 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2245  iron permease FTR1  25.95 
 
 		 280 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.998183  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2033  FTR1 family iron permease  27.84 
 
 		 280 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  33.49 
 
 		 647 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2124  iron permease FTR1  25.95 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.640841  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0180  cytochrome c family protein  33.18 
 
 		 636 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.558942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  32.55 
 
 		 647 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5993  hypothetical protein  34.55 
 
 		 652 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2302  iron permease FTR1  30.73 
 
 		 652 aa  67  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5282  iron permease FTR1  34.97 
 
 		 642 aa  67  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1641  iron permease FTR1  34.97 
 
 		 642 aa  67  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1817  iron permease FTR1  34.13 
 
 		 640 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.214502 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0482  iron permease FTR1  31.6 
 
 		 649 aa  66.2  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  34.3 
 
 		 643 aa  65.9  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5350  iron permease FTR1  34.97 
 
 		 640 aa  65.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.620494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0524  FTR1 family iron permease  28.92 
 
 		 637 aa  65.5  0.0000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.210875  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69300  hypothetical protein  34.09 
 
 		 633 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0822  iron permease FTR1  31.31 
 
 		 396 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3854  iron permease FTR1  29.21 
 
 		 277 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3198  iron permease FTR1  26.86 
 
 		 280 aa  65.1  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.521431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2373  iron permease FTR1  26.32 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2987  iron permease FTR1  26.32 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>