159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1733 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1733  iron permease FTR1  100 
 
 		 304 aa  581  1.0000000000000001e-165  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.997501  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2597  Iron permease FTR1  65.6 
 
 		 290 aa  354  1e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1811  iron permease FTR1  66.29 
 
 		 283 aa  347  2e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.668278 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3596  hypothetical protein  58.6 
 
 		 284 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3859  iron permease FTR1  61.73 
 
 		 280 aa  316  4e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.627947  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3367  Iron permease FTR1  60.45 
 
 		 284 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2872  Iron permease FTR1  61.11 
 
 		 279 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.121627  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3314  iron permease FTR1  64.47 
 
 		 281 aa  301  1e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2929  iron permease FTR1  53.79 
 
 		 281 aa  285  8e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00359497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1660  iron permease FTR1  60.98 
 
 		 278 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1954  iron permease FTR1  62.04 
 
 		 289 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.860822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0433  iron permease FTR1  59.09 
 
 		 278 aa  276  3e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287745 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3143  iron permease FTR1  53.07 
 
 		 281 aa  275  7e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2366  iron permease FTR1  54.89 
 
 		 282 aa  265  5.999999999999999e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0450502  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2040  ferrous iron permease EfeU  54.51 
 
 		 285 aa  265  7e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.19312 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2784  iron permease FTR1  52.92 
 
 		 281 aa  264  1e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2264  ferrous iron permease EfeU  54.51 
 
 		 282 aa  262  4.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1545  FTR1 family protein  52.35 
 
 		 277 aa  258  8e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.884821  normal  0.11427 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2106  iron permease FTR1 family protein  51.5 
 
 		 276 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.178558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01026  hypothetical protein  51.5 
 
 		 276 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.377125  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1258  iron permease FTR1 family protein  51.5 
 
 		 276 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.20725  normal  0.52486 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2579  FTR1 family protein  51.5 
 
 		 276 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1132  iron permease FTR1 family protein  51.5 
 
 		 276 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0198612  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1136  FTR1 family iron permease  51.5 
 
 		 276 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.161686  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01019  putative membrane protein  51.5 
 
 		 279 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.348057  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25520  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  45.49 
 
 		 294 aa  208  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0297463  normal  0.133563 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0188  iron permease FTR1  43.26 
 
 		 283 aa  201  9e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0228999 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4287  iron permease FTR1  46.18 
 
 		 290 aa  193  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486354  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1914  iron permease FTR1  40.45 
 
 		 281 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3898  iron permease FTR1  43.97 
 
 		 537 aa  175  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5686  iron permease FTR1  36.8 
 
 		 287 aa  168  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.435606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0229  iron permease FTR1  41.42 
 
 		 284 aa  167  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3352  iron permease FTR1  45.26 
 
 		 277 aa  166  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.404846  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4913  iron permease FTR1  42.7 
 
 		 579 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3388  iron permease FTR1  40.59 
 
 		 294 aa  155  6e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7009  iron permease FTR1  38.95 
 
 		 291 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  0.35089 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4773  iron permease FTR1  37.64 
 
 		 303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1568  iron permease FTR1  33.88 
 
 		 304 aa  140  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2612  iron permease FTR1  32.32 
 
 		 308 aa  139  6e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000110205  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1777  iron permease FTR1  36.88 
 
 		 691 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0839  iron permease FTR1  34.46 
 
 		 308 aa  135  8e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3403  iron permease FTR1  33.46 
 
 		 702 aa  133  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1177  iron permease FTR1  39.03 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0971353  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5173  iron permease FTR1  34.15 
 
 		 314 aa  125  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000262497 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1952  iron permease FTR1  36.1 
 
 		 304 aa  123  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495146  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2875  iron permease FTR1  37.21 
 
 		 280 aa  123  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3348  iron permease FTR1  34.67 
 
 		 677 aa  121  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1070  iron permease FTR1  31.79 
 
 		 280 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.599025  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1789  iron permease FTR1  30.36 
 
 		 315 aa  117  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1955  iron permease FTR1  30 
 
 		 281 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0621861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1763  Iron permease FTR1  30.51 
 
 		 315 aa  115  8.999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2245  iron permease FTR1  30.6 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.998183  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3323  iron permease FTR1  32.13 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2124  iron permease FTR1  30.6 
 
 		 280 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.640841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5535  Iron permease FTR1  30.82 
 
 		 280 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5870  iron permease FTR1  30.82 
 
 		 280 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.647838  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2207  iron permease FTR1  30.82 
 
 		 280 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2231  iron permease FTR1  30.82 
 
 		 280 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4257  iron permease FTR1  27.99 
 
 		 303 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1834  iron permease FTR1  34.67 
 
 		 288 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163431  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4318  iron permease FTR1  27.3 
 
 		 303 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000385507  hitchhiker  0.00248903 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3150  oxidase-dependent Fe2+ transporter, (OFeT)family, FTR1-like  30.25 
 
 		 281 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.92636  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3631  iron permease FTR1  33.58 
 
 		 279 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0110382 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2033  FTR1 family iron permease  30.04 
 
 		 280 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3473  iron permease FTR1  33.1 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0883  FTR1 family iron permease  29.28 
 
 		 280 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1923  FTR1 family iron permease  29.28 
 
 		 280 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1742  OFeT family iron transporter  29.28 
 
 		 280 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0322131  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0012  OFeT family iron transporter  29.28 
 
 		 280 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0608  OFeT family iron transporter  29.28 
 
 		 280 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.189417  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0510  OFeT family iron transporter  29.28 
 
 		 280 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0912  OFeT family iron transporter  29.28 
 
 		 280 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.29643  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1399  iron permease FTR1  29.89 
 
 		 281 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0193139  normal  0.052775 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2421  high-affinity iron transporter  32.32 
 
 		 305 aa  99  9e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.328401  normal  0.0402063 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0383  FTR1 family iron permease  32.72 
 
 		 278 aa  96.7  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.978993  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0331  FTR1 family iron permease  32.72 
 
 		 276 aa  96.3  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1870  iron permease FTR1  31.1 
 
 		 417 aa  91.3  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3198  iron permease FTR1  31.47 
 
 		 280 aa  90.5  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.521431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3306  iron permease FTR1  35.88 
 
 		 273 aa  90.1  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.223999  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3854  iron permease FTR1  36.6 
 
 		 277 aa  89  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0304  hypothetical protein  33.2 
 
 		 276 aa  86.3  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190446 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1783  iron permease FTR1  32.34 
 
 		 634 aa  85.9  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.498306  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6336  Iron permease FTR1  35.54 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3605  iron permease FTR1  32.35 
 
 		 276 aa  84.7  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80129  normal  0.423145 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2353  permease  32.55 
 
 		 653 aa  82  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4287  iron permease FTR1  30.6 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.973279  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2302  iron permease FTR1  30.67 
 
 		 652 aa  80.9  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1108  FTR1 family iron permease  35.07 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2722  FTR1 family iron permease  35.07 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112826  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1385  iron permease FTR1  32.64 
 
 		 634 aa  80.5  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0107  iron permease FTR1  31.83 
 
 		 277 aa  79.7  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0744314 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2897  iron permease FTR1  35.54 
 
 		 278 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2373  iron permease FTR1  36.65 
 
 		 278 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2987  iron permease FTR1  36.65 
 
 		 278 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2017  iron permease FTR1  32.76 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00650927  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2132  FTR1 family iron permease  31.6 
 
 		 639 aa  77.4  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0517239 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2252  iron permease FTR1  31.6 
 
 		 639 aa  77.4  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3007  iron permease FTR1  35.54 
 
 		 278 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2141  FTR1 family iron permease  31.6 
 
 		 639 aa  77.4  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0433  fumarate hydratase class II (fumarase C)  28 
 
 		 646 aa  76.6  0.0000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000013758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>