131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3306 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3306  iron permease FTR1  100 
 
 		 273 aa  529  1e-149  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.223999  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3854  iron permease FTR1  80.51 
 
 		 277 aa  385  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1108  FTR1 family iron permease  51.75 
 
 		 278 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2722  FTR1 family iron permease  51.75 
 
 		 278 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112826  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6336  Iron permease FTR1  51.36 
 
 		 278 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2103  Iron permease FTR1  46.89 
 
 		 277 aa  229  5e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2875  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  51.75 
 
 		 278 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3034  iron permease FTR1  53.31 
 
 		 278 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2897  iron permease FTR1  53.31 
 
 		 278 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3007  iron permease FTR1  51.75 
 
 		 278 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2373  iron permease FTR1  51.75 
 
 		 278 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2987  iron permease FTR1  51.75 
 
 		 278 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2981  iron permease FTR1  51.75 
 
 		 278 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3198  iron permease FTR1  42.29 
 
 		 280 aa  212  5.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.521431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0304  hypothetical protein  46.86 
 
 		 276 aa  198  9e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190446 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0107  iron permease FTR1  46.72 
 
 		 277 aa  193  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0744314 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1356  iron permease FTR1  48.8 
 
 		 271 aa  172  3.9999999999999995e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.861658 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3800  iron permease FTR1  44.69 
 
 		 274 aa  172  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0381357  normal  0.238543 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5535  Iron permease FTR1  30.47 
 
 		 280 aa  105  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1070  iron permease FTR1  30.18 
 
 		 280 aa  105  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.599025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2124  iron permease FTR1  30.69 
 
 		 280 aa  105  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.640841  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0383  FTR1 family iron permease  33.33 
 
 		 278 aa  104  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.978993  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0331  FTR1 family iron permease  33.33 
 
 		 276 aa  104  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2245  iron permease FTR1  30.32 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.998183  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3143  iron permease FTR1  32.12 
 
 		 281 aa  103  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3150  oxidase-dependent Fe2+ transporter, (OFeT)family, FTR1-like  29.43 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.92636  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5870  iron permease FTR1  30.47 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.647838  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2207  iron permease FTR1  30.47 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2231  iron permease FTR1  30.47 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1955  iron permease FTR1  28.21 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0621861  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0883  FTR1 family iron permease  30.94 
 
 		 280 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1923  FTR1 family iron permease  30.94 
 
 		 280 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1742  OFeT family iron transporter  30.94 
 
 		 280 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0322131  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0012  OFeT family iron transporter  30.94 
 
 		 280 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0608  OFeT family iron transporter  30.94 
 
 		 280 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.189417  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0510  OFeT family iron transporter  30.94 
 
 		 280 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0912  OFeT family iron transporter  30.94 
 
 		 280 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.29643  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1399  iron permease FTR1  30.92 
 
 		 281 aa  102  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0193139  normal  0.052775 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2033  FTR1 family iron permease  31.47 
 
 		 280 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1733  iron permease FTR1  35.88 
 
 		 304 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.997501  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2784  iron permease FTR1  32.69 
 
 		 281 aa  97.8  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01019  putative membrane protein  33.33 
 
 		 279 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.348057  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01026  hypothetical protein  33.33 
 
 		 276 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.377125  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1132  iron permease FTR1 family protein  33.33 
 
 		 276 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0198612  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1136  FTR1 family iron permease  33.33 
 
 		 276 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.161686  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2579  FTR1 family protein  33.33 
 
 		 276 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2106  iron permease FTR1 family protein  33.33 
 
 		 276 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.178558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1258  iron permease FTR1 family protein  33.33 
 
 		 276 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.20725  normal  0.52486 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3631  iron permease FTR1  32.97 
 
 		 279 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0110382 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1811  iron permease FTR1  31.92 
 
 		 283 aa  93.2  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.668278 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3314  iron permease FTR1  33.47 
 
 		 281 aa  92  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1545  FTR1 family protein  32.57 
 
 		 277 aa  89.4  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.884821  normal  0.11427 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0433  iron permease FTR1  33.98 
 
 		 278 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287745 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2612  iron permease FTR1  28.86 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000110205  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1660  iron permease FTR1  33.72 
 
 		 278 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2040  ferrous iron permease EfeU  30.88 
 
 		 285 aa  87  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.19312 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2366  iron permease FTR1  30.51 
 
 		 282 aa  87  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0450502  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2929  iron permease FTR1  30.38 
 
 		 281 aa  85.9  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00359497  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3596  hypothetical protein  29.24 
 
 		 284 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3367  Iron permease FTR1  29.67 
 
 		 284 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2264  ferrous iron permease EfeU  30.51 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0188  iron permease FTR1  32.25 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0228999 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0839  iron permease FTR1  26.85 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4318  iron permease FTR1  25.89 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000385507  hitchhiker  0.00248903 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1177  iron permease FTR1  33.46 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0971353  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3898  iron permease FTR1  30.74 
 
 		 537 aa  83.2  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1954  iron permease FTR1  34.22 
 
 		 289 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.860822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5173  iron permease FTR1  26.95 
 
 		 314 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000262497 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4257  iron permease FTR1  25.53 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5686  iron permease FTR1  29.43 
 
 		 287 aa  80.9  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.435606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2597  Iron permease FTR1  30.07 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0229  iron permease FTR1  30.74 
 
 		 284 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3859  iron permease FTR1  30.5 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.627947  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3473  iron permease FTR1  30.28 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1834  iron permease FTR1  31.3 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163431  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2872  Iron permease FTR1  32.71 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.121627  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25520  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  29.71 
 
 		 294 aa  79.3  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0297463  normal  0.133563 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4287  iron permease FTR1  31.41 
 
 		 283 aa  78.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.973279  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3388  iron permease FTR1  32 
 
 		 294 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3605  iron permease FTR1  32.41 
 
 		 276 aa  78.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80129  normal  0.423145 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4287  iron permease FTR1  29.43 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486354  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2875  iron permease FTR1  32.27 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3403  iron permease FTR1  28.4 
 
 		 702 aa  75.9  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2421  high-affinity iron transporter  29.57 
 
 		 305 aa  75.5  0.0000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.328401  normal  0.0402063 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1789  iron permease FTR1  29 
 
 		 315 aa  75.5  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1110  Iron permease FTR1  32.45 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.605403  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1952  iron permease FTR1  29.73 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495146  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7009  iron permease FTR1  28.52 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  0.35089 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4773  iron permease FTR1  29.43 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1255  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  32.34 
 
 		 603 aa  70.5  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1763  Iron permease FTR1  26.92 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1568  iron permease FTR1  29.12 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1914  iron permease FTR1  30.08 
 
 		 281 aa  65.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3352  iron permease FTR1  30.47 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.404846  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3323  iron permease FTR1  30.04 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1777  iron permease FTR1  27.8 
 
 		 691 aa  62  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3348  iron permease FTR1  28.57 
 
 		 677 aa  61.2  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4913  iron permease FTR1  26.43 
 
 		 579 aa  57.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1936  iron permease FTR1  32.76 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0480645 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2809  Iron permease FTR1  29.86 
 
 		 660 aa  57  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>