157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1954 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1954  iron permease FTR1  100 
 
 		 289 aa  557  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.860822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1811  iron permease FTR1  66.42 
 
 		 283 aa  329  3e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.668278 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3859  iron permease FTR1  59.79 
 
 		 280 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.627947  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3367  Iron permease FTR1  59.17 
 
 		 284 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2597  Iron permease FTR1  58.7 
 
 		 290 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3596  hypothetical protein  58.82 
 
 		 284 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1733  iron permease FTR1  62.04 
 
 		 304 aa  301  8.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.997501  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2929  iron permease FTR1  54.39 
 
 		 281 aa  296  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00359497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2872  Iron permease FTR1  59.04 
 
 		 279 aa  293  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.121627  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3143  iron permease FTR1  55.88 
 
 		 281 aa  292  5e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2784  iron permease FTR1  56.6 
 
 		 281 aa  285  8e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1660  iron permease FTR1  61.89 
 
 		 278 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2366  iron permease FTR1  56.23 
 
 		 282 aa  282  5.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0450502  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2040  ferrous iron permease EfeU  55.85 
 
 		 285 aa  282  5.000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.19312 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0433  iron permease FTR1  61.13 
 
 		 278 aa  281  7.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287745 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2264  ferrous iron permease EfeU  55.85 
 
 		 282 aa  279  4e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1545  FTR1 family protein  55.72 
 
 		 277 aa  275  8e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.884821  normal  0.11427 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2106  iron permease FTR1 family protein  53.52 
 
 		 276 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.178558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01026  hypothetical protein  55.3 
 
 		 276 aa  269  4e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.377125  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2579  FTR1 family protein  55.3 
 
 		 276 aa  269  4e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1258  iron permease FTR1 family protein  55.3 
 
 		 276 aa  269  4e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.20725  normal  0.52486 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1132  iron permease FTR1 family protein  55.3 
 
 		 276 aa  269  4e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0198612  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1136  FTR1 family iron permease  55.3 
 
 		 276 aa  269  4e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.161686  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01019  putative membrane protein  55.3 
 
 		 279 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.348057  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3314  iron permease FTR1  56.43 
 
 		 281 aa  248  8e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0188  iron permease FTR1  43.54 
 
 		 283 aa  207  1e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0228999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3898  iron permease FTR1  44.4 
 
 		 537 aa  186  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5686  iron permease FTR1  41.13 
 
 		 287 aa  183  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.435606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25520  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  42.86 
 
 		 294 aa  178  7e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0297463  normal  0.133563 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4287  iron permease FTR1  43.49 
 
 		 290 aa  176  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486354  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4913  iron permease FTR1  42.6 
 
 		 579 aa  172  5.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3352  iron permease FTR1  43.01 
 
 		 277 aa  166  5e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.404846  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0229  iron permease FTR1  41.11 
 
 		 284 aa  163  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7009  iron permease FTR1  40.74 
 
 		 291 aa  162  9e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  0.35089 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1914  iron permease FTR1  42.26 
 
 		 281 aa  160  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3388  iron permease FTR1  40 
 
 		 294 aa  154  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5173  iron permease FTR1  33.69 
 
 		 314 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000262497 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2875  iron permease FTR1  40.86 
 
 		 280 aa  136  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3348  iron permease FTR1  38.06 
 
 		 677 aa  135  8e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1789  iron permease FTR1  30 
 
 		 315 aa  130  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3403  iron permease FTR1  34.14 
 
 		 702 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1777  iron permease FTR1  38.26 
 
 		 691 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4773  iron permease FTR1  33.45 
 
 		 303 aa  125  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3473  iron permease FTR1  34.15 
 
 		 308 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1568  iron permease FTR1  32.74 
 
 		 304 aa  122  7e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3323  iron permease FTR1  32.67 
 
 		 307 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2245  iron permease FTR1  32.23 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.998183  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2124  iron permease FTR1  32.23 
 
 		 280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.640841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1070  iron permease FTR1  32.35 
 
 		 280 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.599025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2231  iron permease FTR1  31.99 
 
 		 280 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5870  iron permease FTR1  31.99 
 
 		 280 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.647838  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2207  iron permease FTR1  31.99 
 
 		 280 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2612  iron permease FTR1  27.63 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000110205  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5535  Iron permease FTR1  31.62 
 
 		 280 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1763  Iron permease FTR1  30.82 
 
 		 315 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1952  iron permease FTR1  33.86 
 
 		 304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495146  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1955  iron permease FTR1  30.82 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0621861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1177  iron permease FTR1  37.27 
 
 		 279 aa  113  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0971353  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4257  iron permease FTR1  30.85 
 
 		 303 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4318  iron permease FTR1  30.6 
 
 		 303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000385507  hitchhiker  0.00248903 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3150  oxidase-dependent Fe2+ transporter, (OFeT)family, FTR1-like  31.41 
 
 		 281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.92636  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1870  iron permease FTR1  35.71 
 
 		 417 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1399  iron permease FTR1  31.23 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0193139  normal  0.052775 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0839  iron permease FTR1  28.05 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2033  FTR1 family iron permease  30.95 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0883  FTR1 family iron permease  30.2 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1923  FTR1 family iron permease  30.2 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1742  OFeT family iron transporter  30.2 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0322131  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0012  OFeT family iron transporter  30.2 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0608  OFeT family iron transporter  30.2 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.189417  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0510  OFeT family iron transporter  30.2 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0912  OFeT family iron transporter  30.2 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.29643  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0383  FTR1 family iron permease  35.53 
 
 		 278 aa  99  8e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.978993  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0331  FTR1 family iron permease  35.53 
 
 		 276 aa  99  9e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2421  high-affinity iron transporter  33.33 
 
 		 305 aa  95.9  7e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.328401  normal  0.0402063 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3198  iron permease FTR1  31.12 
 
 		 280 aa  92.8  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.521431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3631  iron permease FTR1  33.46 
 
 		 279 aa  92.4  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0110382 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0304  hypothetical protein  33.33 
 
 		 276 aa  90.1  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190446 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1834  iron permease FTR1  32.97 
 
 		 288 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163431  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0107  iron permease FTR1  34.39 
 
 		 277 aa  86.3  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0744314 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3306  iron permease FTR1  33.84 
 
 		 273 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.223999  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0049  cytochrome c, class I:Iron permease FTR1  34.29 
 
 		 632 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5470  cytochrome c, class I  33.49 
 
 		 631 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  33.49 
 
 		 647 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  31.76 
 
 		 647 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0180  cytochrome c family protein  31.76 
 
 		 636 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.558942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3605  iron permease FTR1  31.25 
 
 		 276 aa  75.1  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80129  normal  0.423145 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0141  lead uptake protein, putative  33.33 
 
 		 632 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2809  Iron permease FTR1  30.74 
 
 		 660 aa  74.3  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69300  hypothetical protein  30.47 
 
 		 633 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5993  hypothetical protein  30.87 
 
 		 652 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0433  fumarate hydratase class II (fumarase C)  29.86 
 
 		 646 aa  70.5  0.00000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000013758  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2353  permease  31.43 
 
 		 653 aa  70.1  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4287  iron permease FTR1  28.9 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.973279  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3854  iron permease FTR1  31.91 
 
 		 277 aa  68.9  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1108  FTR1 family iron permease  32 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2897  iron permease FTR1  29.79 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2722  FTR1 family iron permease  32 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112826  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2875  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  31.99 
 
 		 278 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2103  Iron permease FTR1  29.46 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>