147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2353 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2353  permease  100 
 
 		 653 aa  1279    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2561  iron permease FTR1  53.6 
 
 		 647 aa  596  1e-169  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5282  iron permease FTR1  51.01 
 
 		 642 aa  594  1e-168  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1641  iron permease FTR1  51.01 
 
 		 642 aa  594  1e-168  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1817  iron permease FTR1  50.78 
 
 		 640 aa  590  1e-167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.214502 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5350  iron permease FTR1  51.88 
 
 		 640 aa  588  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.620494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2302  iron permease FTR1  52.72 
 
 		 652 aa  588  1e-166  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  53.65 
 
 		 644 aa  580  1e-164  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5945  Pb(II)-uptake protein PbrT  50 
 
 		 642 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3637  iron permease FTR1  53.67 
 
 		 664 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  52.84 
 
 		 643 aa  570  1e-161  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0482  iron permease FTR1  54.79 
 
 		 649 aa  542  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  41.23 
 
 		 653 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  41.45 
 
 		 645 aa  422  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0723  cytochrome c, class I  45.44 
 
 		 657 aa  392  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694021  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1953  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  38.22 
 
 		 637 aa  385  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.002939  normal  0.431592 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2954  iron permease FTR1  37.4 
 
 		 652 aa  377  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1058  iron permease FTR1  37.19 
 
 		 683 aa  373  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0352795  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0180  cytochrome c family protein  38.68 
 
 		 636 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.558942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  38.59 
 
 		 647 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  38.42 
 
 		 647 aa  363  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5470  cytochrome c, class I  37.04 
 
 		 631 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0292  iron permease FTR1  39.31 
 
 		 629 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0141  lead uptake protein, putative  36.2 
 
 		 632 aa  332  1e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69300  hypothetical protein  36.83 
 
 		 633 aa  329  9e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0049  cytochrome c, class I:Iron permease FTR1  36.03 
 
 		 632 aa  327  3e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5993  hypothetical protein  36.78 
 
 		 652 aa  319  9e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6106  putative cytochrome protein CopT  50.78 
 
 		 254 aa  189  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.0345591 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0450  FTR1 family iron permease  32.1 
 
 		 679 aa  159  1e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000168197  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1783  iron permease FTR1  32.01 
 
 		 634 aa  155  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.498306  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2252  iron permease FTR1  31.94 
 
 		 639 aa  154  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0433  fumarate hydratase class II (fumarase C)  31.68 
 
 		 646 aa  153  8e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000013758  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2141  FTR1 family iron permease  32.99 
 
 		 639 aa  152  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2132  FTR1 family iron permease  32.99 
 
 		 639 aa  152  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0517239 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2017  iron permease FTR1  31.75 
 
 		 413 aa  151  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00650927  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1022  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  33.58 
 
 		 556 aa  150  9e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1385  iron permease FTR1  31.75 
 
 		 634 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0524  FTR1 family iron permease  28.77 
 
 		 637 aa  146  9e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.210875  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0160  iron permease FTR1 family protein  37.05 
 
 		 572 aa  146  1e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.31653 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0822  iron permease FTR1  33.75 
 
 		 396 aa  140  6e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1830  FTR1 family iron permease  29.39 
 
 		 696 aa  137  7.000000000000001e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1649  FTR1 family iron permease  29.09 
 
 		 696 aa  136  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0763  superoxide dismutase  29.68 
 
 		 647 aa  134  3.9999999999999996e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.745778  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1255  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  28.57 
 
 		 603 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2809  Iron permease FTR1  30.4 
 
 		 660 aa  130  6e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1170  iron permease, FTR1 family  28.4 
 
 		 691 aa  128  4.0000000000000003e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.900718  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2018  FTR1 family iron permease  28.53 
 
 		 696 aa  128  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0393  hypothetical protein  27.35 
 
 		 570 aa  125  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0403  hypothetical protein  27.35 
 
 		 570 aa  125  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2443  iron permease FTR1  33.63 
 
 		 399 aa  123  9e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1510  hypothetical protein  32.94 
 
 		 422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000353289  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5728  iron permease FTR1  28.2 
 
 		 846 aa  107  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0468  iron permease FTR1  29.67 
 
 		 820 aa  99  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.402804  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0820  iron permease FTR1  28.17 
 
 		 782 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.594209  hitchhiker  0.0000623566 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2435  iron permease FTR1  27.53 
 
 		 743 aa  95.9  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4468  iron permease FTR1  29.37 
 
 		 779 aa  88.6  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.390175  normal  0.0190609 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2692  iron permease FTR1  30.62 
 
 		 273 aa  88.2  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.37589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1733  iron permease FTR1  32.55 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.997501  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4773  iron permease FTR1  32.57 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1870  iron permease FTR1  28.29 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1952  iron permease FTR1  31.53 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495146  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3596  hypothetical protein  34.76 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4913  iron permease FTR1  32.24 
 
 		 579 aa  74.3  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3367  Iron permease FTR1  33.49 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3898  iron permease FTR1  32.23 
 
 		 537 aa  73.9  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0188  iron permease FTR1  32.87 
 
 		 283 aa  73.6  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0228999 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2612  iron permease FTR1  26.7 
 
 		 308 aa  73.6  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000110205  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2330  High-affinity Fe2+/Pb2+ permease-like protein  27.99 
 
 		 325 aa  72.8  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00178906  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3143  iron permease FTR1  29.05 
 
 		 281 aa  72.4  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1811  iron permease FTR1  29.81 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.668278 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1660  iron permease FTR1  33.01 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4287  iron permease FTR1  30.77 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486354  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2872  Iron permease FTR1  33.97 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.121627  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5686  iron permease FTR1  29.86 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.435606  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1914  iron permease FTR1  34.13 
 
 		 281 aa  70.5  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2875  iron permease FTR1  35.85 
 
 		 280 aa  69.7  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5173  iron permease FTR1  29.67 
 
 		 314 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000262497 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2929  iron permease FTR1  28.64 
 
 		 281 aa  68.9  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00359497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1568  iron permease FTR1  32.41 
 
 		 304 aa  68.9  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1789  iron permease FTR1  31.84 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3314  iron permease FTR1  33.02 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0161  cytochrome c class I  39.76 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000207523  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0433  iron permease FTR1  33.49 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287745 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2597  Iron permease FTR1  29.55 
 
 		 290 aa  65.9  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3403  iron permease FTR1  32.09 
 
 		 702 aa  66.2  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25520  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  31.92 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0297463  normal  0.133563 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3859  iron permease FTR1  33.01 
 
 		 280 aa  65.9  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.627947  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3348  iron permease FTR1  31.94 
 
 		 677 aa  64.7  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0839  iron permease FTR1  27.19 
 
 		 308 aa  63.2  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1545  FTR1 family protein  29.11 
 
 		 277 aa  62.4  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.884821  normal  0.11427 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4257  iron permease FTR1  30.84 
 
 		 303 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4318  iron permease FTR1  30.84 
 
 		 303 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000385507  hitchhiker  0.00248903 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1674  cytochrome c class I  42.27 
 
 		 128 aa  61.6  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1763  Iron permease FTR1  30 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2320  cytochrome c, class I  31.13 
 
 		 702 aa  61.2  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2760  cytochrome c, class I  31.13 
 
 		 702 aa  61.2  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3473  iron permease FTR1  30.53 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1777  iron permease FTR1  33.8 
 
 		 691 aa  60.5  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2277  cytochrome c, class I  44.94 
 
 		 128 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1258  iron permease FTR1 family protein  30.05 
 
 		 276 aa  59.3  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.20725  normal  0.52486 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>