154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1914 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1914  iron permease FTR1  100 
 
 		 281 aa  536  1e-151  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4287  iron permease FTR1  57.51 
 
 		 290 aa  288  8e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486354  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7009  iron permease FTR1  56.18 
 
 		 291 aa  275  8e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  0.35089 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5686  iron permease FTR1  52.27 
 
 		 287 aa  273  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.435606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25520  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  52.38 
 
 		 294 aa  263  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0297463  normal  0.133563 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0229  iron permease FTR1  49.45 
 
 		 284 aa  243  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3388  iron permease FTR1  51.28 
 
 		 294 aa  241  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4773  iron permease FTR1  48.75 
 
 		 303 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3403  iron permease FTR1  46.04 
 
 		 702 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1777  iron permease FTR1  46.39 
 
 		 691 aa  211  9e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3348  iron permease FTR1  47.1 
 
 		 677 aa  207  1e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1568  iron permease FTR1  45.42 
 
 		 304 aa  205  6e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0188  iron permease FTR1  43.82 
 
 		 283 aa  195  6e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0228999 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1952  iron permease FTR1  45.63 
 
 		 304 aa  190  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495146  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1733  iron permease FTR1  40.45 
 
 		 304 aa  187  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.997501  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3898  iron permease FTR1  41.94 
 
 		 537 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1545  FTR1 family protein  38.71 
 
 		 277 aa  178  9e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.884821  normal  0.11427 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2597  Iron permease FTR1  39.24 
 
 		 290 aa  177  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2929  iron permease FTR1  36.94 
 
 		 281 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00359497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1811  iron permease FTR1  39.02 
 
 		 283 aa  176  5e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.668278 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3596  hypothetical protein  40 
 
 		 284 aa  175  7e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4913  iron permease FTR1  43.28 
 
 		 579 aa  174  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3143  iron permease FTR1  36.84 
 
 		 281 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3859  iron permease FTR1  36.94 
 
 		 280 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.627947  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2784  iron permease FTR1  38.13 
 
 		 281 aa  171  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2106  iron permease FTR1 family protein  39.18 
 
 		 276 aa  171  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.178558  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01019  putative membrane protein  39.18 
 
 		 279 aa  169  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.348057  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2579  FTR1 family protein  39.18 
 
 		 276 aa  169  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01026  hypothetical protein  39.18 
 
 		 276 aa  169  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.377125  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1132  iron permease FTR1 family protein  39.18 
 
 		 276 aa  169  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0198612  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1136  FTR1 family iron permease  39.18 
 
 		 276 aa  169  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.161686  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1258  iron permease FTR1 family protein  39.18 
 
 		 276 aa  169  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.20725  normal  0.52486 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3367  Iron permease FTR1  41.73 
 
 		 284 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1660  iron permease FTR1  39.85 
 
 		 278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3352  iron permease FTR1  42.29 
 
 		 277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.404846  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2040  ferrous iron permease EfeU  35.93 
 
 		 285 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.19312 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2366  iron permease FTR1  36.3 
 
 		 282 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0450502  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0433  iron permease FTR1  39.08 
 
 		 278 aa  159  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287745 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2264  ferrous iron permease EfeU  35.93 
 
 		 282 aa  159  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2872  Iron permease FTR1  38.29 
 
 		 279 aa  156  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.121627  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1954  iron permease FTR1  41.05 
 
 		 289 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.860822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3314  iron permease FTR1  37.59 
 
 		 281 aa  147  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1177  iron permease FTR1  40.52 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0971353  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2875  iron permease FTR1  36.36 
 
 		 280 aa  102  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2231  iron permease FTR1  29.86 
 
 		 280 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5870  iron permease FTR1  29.86 
 
 		 280 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.647838  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2207  iron permease FTR1  29.86 
 
 		 280 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5535  Iron permease FTR1  29.5 
 
 		 280 aa  99.4  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1870  iron permease FTR1  32.08 
 
 		 417 aa  99  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3150  oxidase-dependent Fe2+ transporter, (OFeT)family, FTR1-like  30.58 
 
 		 281 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.92636  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2612  iron permease FTR1  25.09 
 
 		 308 aa  98.6  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000110205  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1789  iron permease FTR1  32.13 
 
 		 315 aa  97.8  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0839  iron permease FTR1  26.69 
 
 		 308 aa  97.4  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2245  iron permease FTR1  29.5 
 
 		 280 aa  96.3  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.998183  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2124  iron permease FTR1  29.5 
 
 		 280 aa  95.5  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.640841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2033  FTR1 family iron permease  28.57 
 
 		 280 aa  94.7  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3323  iron permease FTR1  34.86 
 
 		 307 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1783  iron permease FTR1  33.65 
 
 		 634 aa  92  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.498306  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1763  Iron permease FTR1  29.72 
 
 		 315 aa  91.3  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2302  iron permease FTR1  37.44 
 
 		 652 aa  91.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1070  iron permease FTR1  29.14 
 
 		 280 aa  92  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.599025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1399  iron permease FTR1  28.87 
 
 		 281 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0193139  normal  0.052775 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0883  FTR1 family iron permease  27.82 
 
 		 280 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1923  FTR1 family iron permease  27.82 
 
 		 280 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1742  OFeT family iron transporter  27.82 
 
 		 280 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0322131  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0012  OFeT family iron transporter  27.82 
 
 		 280 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0608  OFeT family iron transporter  27.82 
 
 		 280 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.189417  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0510  OFeT family iron transporter  27.82 
 
 		 280 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0912  OFeT family iron transporter  27.82 
 
 		 280 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.29643  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1955  iron permease FTR1  28.04 
 
 		 281 aa  89.7  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0621861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1385  iron permease FTR1  34.8 
 
 		 634 aa  89  9e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5173  iron permease FTR1  31.84 
 
 		 314 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000262497 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2353  permease  34.13 
 
 		 653 aa  84.3  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0822  iron permease FTR1  33.78 
 
 		 396 aa  83.2  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  35.58 
 
 		 647 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0180  cytochrome c family protein  35.1 
 
 		 636 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.558942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  35.24 
 
 		 644 aa  80.5  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0482  iron permease FTR1  35.38 
 
 		 649 aa  80.1  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2954  iron permease FTR1  33.05 
 
 		 652 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5993  hypothetical protein  34.6 
 
 		 652 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5470  cytochrome c, class I  33.65 
 
 		 631 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5350  iron permease FTR1  36.41 
 
 		 640 aa  79  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.620494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  35.51 
 
 		 653 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1058  iron permease FTR1  31.3 
 
 		 683 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0352795  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2252  iron permease FTR1  33.51 
 
 		 639 aa  78.2  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  34.62 
 
 		 647 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0141  lead uptake protein, putative  34.6 
 
 		 632 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0049  cytochrome c, class I:Iron permease FTR1  35.07 
 
 		 632 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2141  FTR1 family iron permease  33.51 
 
 		 639 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2132  FTR1 family iron permease  33.51 
 
 		 639 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0517239 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5945  Pb(II)-uptake protein PbrT  35.44 
 
 		 642 aa  77  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1641  iron permease FTR1  35.92 
 
 		 642 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5282  iron permease FTR1  35.92 
 
 		 642 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69300  hypothetical protein  30.95 
 
 		 633 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  36.36 
 
 		 643 aa  76.6  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3637  iron permease FTR1  32.54 
 
 		 664 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1817  iron permease FTR1  36.41 
 
 		 640 aa  75.5  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.214502 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3473  iron permease FTR1  32.43 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2421  high-affinity iron transporter  30.36 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.328401  normal  0.0402063 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  30.99 
 
 		 645 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>