162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2264 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2264  ferrous iron permease EfeU  100 
 
 
282 aa  562  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2366  iron permease FTR1  99.65 
 
 
282 aa  560  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0450502  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2040  ferrous iron permease EfeU  99.29 
 
 
285 aa  558  1e-158  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.19312 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2929  iron permease FTR1  86.48 
 
 
281 aa  491  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00359497  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3143  iron permease FTR1  80.52 
 
 
281 aa  442  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2784  iron permease FTR1  81.36 
 
 
281 aa  440  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1258  iron permease FTR1 family protein  75.36 
 
 
276 aa  410  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.20725  normal  0.52486 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2106  iron permease FTR1 family protein  75.82 
 
 
276 aa  410  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.178558  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01026  hypothetical protein  75.36 
 
 
276 aa  410  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.377125  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2579  FTR1 family protein  75.36 
 
 
276 aa  410  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1132  iron permease FTR1 family protein  75.36 
 
 
276 aa  410  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0198612  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1136  FTR1 family iron permease  75.36 
 
 
276 aa  410  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.161686  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01019  putative membrane protein  75.36 
 
 
279 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.348057  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1545  FTR1 family protein  74.28 
 
 
277 aa  409  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.884821  normal  0.11427 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2872  Iron permease FTR1  59.04 
 
 
279 aa  311  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.121627  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3596  hypothetical protein  59.12 
 
 
284 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2597  Iron permease FTR1  55.23 
 
 
290 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3367  Iron permease FTR1  59.49 
 
 
284 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226405  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3859  iron permease FTR1  54.55 
 
 
280 aa  291  6e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.627947  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1811  iron permease FTR1  54.55 
 
 
283 aa  291  8e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.668278 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1660  iron permease FTR1  59.7 
 
 
278 aa  290  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0433  iron permease FTR1  58.56 
 
 
278 aa  280  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00287745 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1733  iron permease FTR1  54.51 
 
 
304 aa  279  3e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.997501  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1954  iron permease FTR1  55.85 
 
 
289 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.860822  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3314  iron permease FTR1  52.52 
 
 
281 aa  258  6e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4913  iron permease FTR1  42.44 
 
 
579 aa  190  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0188  iron permease FTR1  39.34 
 
 
283 aa  187  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0228999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3898  iron permease FTR1  41.33 
 
 
537 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5686  iron permease FTR1  36.84 
 
 
287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.435606  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25520  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  36.5 
 
 
294 aa  166  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0297463  normal  0.133563 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1914  iron permease FTR1  35.93 
 
 
281 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4287  iron permease FTR1  36.8 
 
 
290 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486354  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3352  iron permease FTR1  39.49 
 
 
277 aa  156  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.404846  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0229  iron permease FTR1  35.47 
 
 
284 aa  155  6e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7009  iron permease FTR1  36.13 
 
 
291 aa  155  9e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  0.35089 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3388  iron permease FTR1  33.58 
 
 
294 aa  138  8.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3403  iron permease FTR1  33.33 
 
 
702 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1777  iron permease FTR1  35.47 
 
 
691 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2612  iron permease FTR1  30.07 
 
 
308 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000110205  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1763  Iron permease FTR1  28.66 
 
 
315 aa  125  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3348  iron permease FTR1  35.69 
 
 
677 aa  123  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5173  iron permease FTR1  28.88 
 
 
314 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000262497 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1789  iron permease FTR1  26.56 
 
 
315 aa  122  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0839  iron permease FTR1  31.97 
 
 
308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4773  iron permease FTR1  32.1 
 
 
303 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2875  iron permease FTR1  33.69 
 
 
280 aa  117  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1177  iron permease FTR1  35.58 
 
 
279 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0971353  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3473  iron permease FTR1  35 
 
 
308 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1952  iron permease FTR1  32.03 
 
 
304 aa  114  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495146  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1568  iron permease FTR1  30.55 
 
 
304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4318  iron permease FTR1  26.76 
 
 
303 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000385507  hitchhiker  0.00248903 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4257  iron permease FTR1  27.46 
 
 
303 aa  108  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3323  iron permease FTR1  33.17 
 
 
307 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3198  iron permease FTR1  26.98 
 
 
280 aa  93.2  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.521431  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1070  iron permease FTR1  25.09 
 
 
280 aa  91.3  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.599025  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5535  Iron permease FTR1  24.55 
 
 
280 aa  89  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1870  iron permease FTR1  29.81 
 
 
417 aa  89  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2245  iron permease FTR1  24.19 
 
 
280 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.998183  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2124  iron permease FTR1  24.19 
 
 
280 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.640841  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2421  high-affinity iron transporter  30.1 
 
 
305 aa  87  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.328401  normal  0.0402063 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2231  iron permease FTR1  24.19 
 
 
280 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5870  iron permease FTR1  24.19 
 
 
280 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.647838  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2207  iron permease FTR1  24.19 
 
 
280 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0304  hypothetical protein  29.39 
 
 
276 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.190446 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1955  iron permease FTR1  24.28 
 
 
281 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0621861  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3854  iron permease FTR1  31.58 
 
 
277 aa  82.4  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2033  FTR1 family iron permease  24.43 
 
 
280 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1834  iron permease FTR1  25.48 
 
 
288 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163431  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1399  iron permease FTR1  26.91 
 
 
281 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0193139  normal  0.052775 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0883  FTR1 family iron permease  23.92 
 
 
280 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1923  FTR1 family iron permease  23.92 
 
 
280 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1742  OFeT family iron transporter  23.92 
 
 
280 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0322131  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0012  OFeT family iron transporter  23.92 
 
 
280 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0608  OFeT family iron transporter  23.92 
 
 
280 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.189417  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0510  OFeT family iron transporter  23.92 
 
 
280 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0912  OFeT family iron transporter  23.92 
 
 
280 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.29643  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6336  Iron permease FTR1  28.72 
 
 
278 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2103  Iron permease FTR1  28.52 
 
 
277 aa  77.8  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0433  fumarate hydratase class II (fumarase C)  33.17 
 
 
646 aa  76.6  0.0000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000013758  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3150  oxidase-dependent Fe2+ transporter, (OFeT)family, FTR1-like  25.78 
 
 
281 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.92636  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2373  iron permease FTR1  29.18 
 
 
278 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2987  iron permease FTR1  29.18 
 
 
278 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64944  plasma membrane iron permease  25.97 
 
 
379 aa  75.5  0.0000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3631  iron permease FTR1  26.48 
 
 
279 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0110382 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1058  iron permease FTR1  32.39 
 
 
683 aa  75.1  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0352795  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1510  hypothetical protein  31.31 
 
 
422 aa  72.8  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000353289  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1783  iron permease FTR1  32.32 
 
 
634 aa  72.8  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.498306  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  34.76 
 
 
653 aa  72.8  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3007  iron permease FTR1  29.54 
 
 
278 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2954  iron permease FTR1  30.88 
 
 
652 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0822  iron permease FTR1  31.6 
 
 
396 aa  72  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3306  iron permease FTR1  30.04 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.223999  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2897  iron permease FTR1  28.11 
 
 
278 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0383  FTR1 family iron permease  27.54 
 
 
278 aa  70.5  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.978993  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1385  iron permease FTR1  32.12 
 
 
634 aa  70.5  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0331  FTR1 family iron permease  27.54 
 
 
276 aa  70.5  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2302  iron permease FTR1  27.49 
 
 
652 aa  70.5  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0450  FTR1 family iron permease  32.99 
 
 
679 aa  70.5  0.00000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000168197  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3034  iron permease FTR1  29.79 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0524  FTR1 family iron permease  30.1 
 
 
637 aa  69.7  0.00000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.210875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>