161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3352 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3352  iron permease FTR1  100 
 
 		 277 aa  519  1e-146  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.404846  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0188  iron permease FTR1  59.93 
 
 		 283 aa  297  1e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0228999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3898  iron permease FTR1  59.62 
 
 		 537 aa  280  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4913  iron permease FTR1  56.36 
 
 		 579 aa  273  3e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1733  iron permease FTR1  45.26 
 
 		 304 aa  202  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.997501  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3143  iron permease FTR1  42.39 
 
 		 281 aa  202  4e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1811  iron permease FTR1  44.49 
 
 		 283 aa  199  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.668278 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2929  iron permease FTR1  40.66 
 
 		 281 aa  193  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00359497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1660  iron permease FTR1  47.91 
 
 		 278 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1545  FTR1 family protein  39.93 
 
 		 277 aa  189  2.9999999999999997e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.884821  normal  0.11427 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25520  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  43.33 
 
 		 294 aa  188  7e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0297463  normal  0.133563 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2597  Iron permease FTR1  41.7 
 
 		 290 aa  188  8e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2106  iron permease FTR1 family protein  43.53 
 
 		 276 aa  186  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.178558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2784  iron permease FTR1  42.34 
 
 		 281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01019  putative membrane protein  42.96 
 
 		 279 aa  183  3e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.348057  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0433  iron permease FTR1  46.39 
 
 		 278 aa  183  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287745 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01026  hypothetical protein  42.96 
 
 		 276 aa  183  3e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.377125  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2579  FTR1 family protein  42.96 
 
 		 276 aa  183  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1258  iron permease FTR1 family protein  42.96 
 
 		 276 aa  183  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.20725  normal  0.52486 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1132  iron permease FTR1 family protein  42.96 
 
 		 276 aa  183  3e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0198612  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1136  FTR1 family iron permease  42.96 
 
 		 276 aa  183  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.161686  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3314  iron permease FTR1  44.85 
 
 		 281 aa  181  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3859  iron permease FTR1  39.43 
 
 		 280 aa  180  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.627947  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1914  iron permease FTR1  43.18 
 
 		 281 aa  179  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4287  iron permease FTR1  44.57 
 
 		 290 aa  176  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486354  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1954  iron permease FTR1  43.01 
 
 		 289 aa  175  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.860822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2040  ferrous iron permease EfeU  39.71 
 
 		 285 aa  175  9e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.19312 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2366  iron permease FTR1  39.26 
 
 		 282 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0450502  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5686  iron permease FTR1  40.15 
 
 		 287 aa  173  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.435606  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3596  hypothetical protein  40.56 
 
 		 284 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3367  Iron permease FTR1  40.51 
 
 		 284 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2264  ferrous iron permease EfeU  39.71 
 
 		 282 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2872  Iron permease FTR1  40.36 
 
 		 279 aa  170  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.121627  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7009  iron permease FTR1  42.69 
 
 		 291 aa  166  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  0.35089 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3388  iron permease FTR1  43.28 
 
 		 294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0229  iron permease FTR1  39.78 
 
 		 284 aa  161  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3348  iron permease FTR1  42.18 
 
 		 677 aa  157  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4773  iron permease FTR1  36.23 
 
 		 303 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1777  iron permease FTR1  39.16 
 
 		 691 aa  139  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3403  iron permease FTR1  39.16 
 
 		 702 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1568  iron permease FTR1  33.33 
 
 		 304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1177  iron permease FTR1  39.42 
 
 		 279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0971353  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1789  iron permease FTR1  38.14 
 
 		 315 aa  124  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1952  iron permease FTR1  33.2 
 
 		 304 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495146  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5173  iron permease FTR1  35.44 
 
 		 314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000262497 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1763  Iron permease FTR1  39.35 
 
 		 315 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5535  Iron permease FTR1  31.46 
 
 		 280 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5870  iron permease FTR1  31.84 
 
 		 280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.647838  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2207  iron permease FTR1  31.84 
 
 		 280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2231  iron permease FTR1  31.84 
 
 		 280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2875  iron permease FTR1  37.4 
 
 		 280 aa  112  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2612  iron permease FTR1  27.84 
 
 		 308 aa  112  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000110205  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0883  FTR1 family iron permease  29.84 
 
 		 280 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1923  FTR1 family iron permease  29.84 
 
 		 280 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1742  OFeT family iron transporter  29.84 
 
 		 280 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0322131  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0012  OFeT family iron transporter  29.84 
 
 		 280 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0608  OFeT family iron transporter  29.84 
 
 		 280 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.189417  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0510  OFeT family iron transporter  29.84 
 
 		 280 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0912  OFeT family iron transporter  29.84 
 
 		 280 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.29643  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0839  iron permease FTR1  29.25 
 
 		 308 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2033  FTR1 family iron permease  29.84 
 
 		 280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1070  iron permease FTR1  29.96 
 
 		 280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.599025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1870  iron permease FTR1  35.48 
 
 		 417 aa  109  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2245  iron permease FTR1  30.71 
 
 		 280 aa  109  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.998183  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3473  iron permease FTR1  40.96 
 
 		 308 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3323  iron permease FTR1  32.11 
 
 		 307 aa  108  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2124  iron permease FTR1  30.71 
 
 		 280 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.640841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4318  iron permease FTR1  38.54 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000385507  hitchhiker  0.00248903 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4257  iron permease FTR1  38.54 
 
 		 303 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2421  high-affinity iron transporter  30.46 
 
 		 305 aa  103  4e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.328401  normal  0.0402063 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1955  iron permease FTR1  26.62 
 
 		 281 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0621861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3150  oxidase-dependent Fe2+ transporter, (OFeT)family, FTR1-like  29.82 
 
 		 281 aa  93.6  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.92636  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3631  iron permease FTR1  30.94 
 
 		 279 aa  89.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0110382 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1399  iron permease FTR1  27.51 
 
 		 281 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0193139  normal  0.052775 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0383  FTR1 family iron permease  30.86 
 
 		 278 aa  86.7  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.978993  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0331  FTR1 family iron permease  30.86 
 
 		 276 aa  86.7  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0304  hypothetical protein  32.86 
 
 		 276 aa  84  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190446 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1834  iron permease FTR1  32.33 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163431  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2353  permease  35.78 
 
 		 653 aa  78.6  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  34.39 
 
 		 653 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0822  iron permease FTR1  40.29 
 
 		 396 aa  77  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3198  iron permease FTR1  25.95 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.521431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2435  iron permease FTR1  32.23 
 
 		 743 aa  70.5  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0107  iron permease FTR1  32.74 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0744314 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3605  iron permease FTR1  27.8 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80129  normal  0.423145 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1108  FTR1 family iron permease  32.35 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0160  iron permease FTR1 family protein  33.8 
 
 		 572 aa  67.4  0.0000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.31653 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2722  FTR1 family iron permease  32.35 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112826  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0524  FTR1 family iron permease  31.52 
 
 		 637 aa  66.2  0.0000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.210875  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0141  lead uptake protein, putative  32.65 
 
 		 632 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1783  iron permease FTR1  30.54 
 
 		 634 aa  65.9  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.498306  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  32.99 
 
 		 647 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0049  cytochrome c, class I:Iron permease FTR1  32.99 
 
 		 632 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1356  iron permease FTR1  33.07 
 
 		 271 aa  65.5  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.861658 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5993  hypothetical protein  31.47 
 
 		 652 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1385  iron permease FTR1  31.79 
 
 		 634 aa  65.1  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5470  cytochrome c, class I  32.14 
 
 		 631 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2103  Iron permease FTR1  24.71 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3854  iron permease FTR1  30 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2875  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  32.12 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>