135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3854 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3854  iron permease FTR1  100 
 
 
277 aa  531  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3306  iron permease FTR1  80.51 
 
 
273 aa  379  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.223999  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1108  FTR1 family iron permease  51.36 
 
 
278 aa  236  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2722  FTR1 family iron permease  51.36 
 
 
278 aa  236  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112826  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6336  Iron permease FTR1  49.82 
 
 
278 aa  236  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2103  Iron permease FTR1  46.01 
 
 
277 aa  224  8e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2875  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  50.58 
 
 
278 aa  221  8e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3034  iron permease FTR1  50.36 
 
 
278 aa  219  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2897  iron permease FTR1  50.36 
 
 
278 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2981  iron permease FTR1  49.46 
 
 
278 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3198  iron permease FTR1  44.57 
 
 
280 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.521431  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3007  iron permease FTR1  49.64 
 
 
278 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0304  hypothetical protein  48.15 
 
 
276 aa  209  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.190446 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2373  iron permease FTR1  50.76 
 
 
278 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2987  iron permease FTR1  50.76 
 
 
278 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0107  iron permease FTR1  47.62 
 
 
277 aa  186  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0744314 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1356  iron permease FTR1  52 
 
 
271 aa  181  9.000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.861658 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3800  iron permease FTR1  44.32 
 
 
274 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0381357  normal  0.238543 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2106  iron permease FTR1 family protein  34.72 
 
 
276 aa  109  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.178558  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01019  putative membrane protein  34.72 
 
 
279 aa  109  6e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.348057  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1258  iron permease FTR1 family protein  34.72 
 
 
276 aa  109  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.20725  normal  0.52486 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01026  hypothetical protein  34.72 
 
 
276 aa  109  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.377125  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1132  iron permease FTR1 family protein  34.72 
 
 
276 aa  109  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0198612  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1136  FTR1 family iron permease  34.72 
 
 
276 aa  109  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.161686  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2579  FTR1 family protein  34.72 
 
 
276 aa  109  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1399  iron permease FTR1  30.71 
 
 
281 aa  109  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0193139  normal  0.052775 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3150  oxidase-dependent Fe2+ transporter, (OFeT)family, FTR1-like  30.14 
 
 
281 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.92636  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3143  iron permease FTR1  32.73 
 
 
281 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1955  iron permease FTR1  31.79 
 
 
281 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0621861  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2784  iron permease FTR1  33.59 
 
 
281 aa  106  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0383  FTR1 family iron permease  34.38 
 
 
278 aa  102  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.978993  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0331  FTR1 family iron permease  34.38 
 
 
276 aa  102  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1733  iron permease FTR1  37.1 
 
 
304 aa  102  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.997501  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0883  FTR1 family iron permease  31.25 
 
 
280 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1923  FTR1 family iron permease  31.25 
 
 
280 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1742  OFeT family iron transporter  31.25 
 
 
280 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0322131  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0012  OFeT family iron transporter  31.25 
 
 
280 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0608  OFeT family iron transporter  31.25 
 
 
280 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.189417  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0510  OFeT family iron transporter  31.25 
 
 
280 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0912  OFeT family iron transporter  31.25 
 
 
280 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.29643  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1545  FTR1 family protein  32.75 
 
 
277 aa  102  9e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.884821  normal  0.11427 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2033  FTR1 family iron permease  30.86 
 
 
280 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2929  iron permease FTR1  32.42 
 
 
281 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00359497  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2124  iron permease FTR1  31.38 
 
 
280 aa  99.8  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.640841  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2245  iron permease FTR1  31.03 
 
 
280 aa  99  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.998183  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5535  Iron permease FTR1  31.94 
 
 
280 aa  98.6  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5870  iron permease FTR1  31.4 
 
 
280 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.647838  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2207  iron permease FTR1  31.4 
 
 
280 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2231  iron permease FTR1  31.4 
 
 
280 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1811  iron permease FTR1  33.46 
 
 
283 aa  97.1  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.668278 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1070  iron permease FTR1  29.84 
 
 
280 aa  96.7  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.599025  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2040  ferrous iron permease EfeU  31.82 
 
 
285 aa  95.9  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.19312 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2366  iron permease FTR1  31.44 
 
 
282 aa  96.3  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0450502  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3314  iron permease FTR1  33.7 
 
 
281 aa  95.1  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2264  ferrous iron permease EfeU  32.66 
 
 
282 aa  94.7  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1660  iron permease FTR1  33.46 
 
 
278 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0433  iron permease FTR1  35.25 
 
 
278 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00287745 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3367  Iron permease FTR1  31.3 
 
 
284 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226405  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2597  Iron permease FTR1  33.46 
 
 
290 aa  90.9  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5686  iron permease FTR1  31.15 
 
 
287 aa  90.9  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.435606  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3859  iron permease FTR1  31.66 
 
 
280 aa  90.1  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.627947  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3631  iron permease FTR1  31.87 
 
 
279 aa  90.1  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0110382 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0229  iron permease FTR1  30.99 
 
 
284 aa  89.7  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3596  hypothetical protein  31.71 
 
 
284 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2612  iron permease FTR1  28.42 
 
 
308 aa  88.2  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000110205  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1789  iron permease FTR1  28.67 
 
 
315 aa  88.6  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5173  iron permease FTR1  25.49 
 
 
314 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000262497 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2872  Iron permease FTR1  33.2 
 
 
279 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.121627  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1177  iron permease FTR1  32.72 
 
 
279 aa  87.4  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0971353  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0188  iron permease FTR1  32.03 
 
 
283 aa  87.4  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0228999 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4318  iron permease FTR1  30.3 
 
 
303 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000385507  hitchhiker  0.00248903 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3898  iron permease FTR1  31.8 
 
 
537 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4257  iron permease FTR1  29.92 
 
 
303 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1834  iron permease FTR1  33.72 
 
 
288 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163431  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3388  iron permease FTR1  30.74 
 
 
294 aa  82.4  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0839  iron permease FTR1  27.86 
 
 
308 aa  82  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1110  Iron permease FTR1  34.26 
 
 
267 aa  81.3  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.605403  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4287  iron permease FTR1  32.42 
 
 
290 aa  80.1  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486354  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3473  iron permease FTR1  27.39 
 
 
308 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25520  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  29.5 
 
 
294 aa  79  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0297463  normal  0.133563 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1763  Iron permease FTR1  28.15 
 
 
315 aa  77.8  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4287  iron permease FTR1  31.7 
 
 
283 aa  77.8  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.973279  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1952  iron permease FTR1  28.57 
 
 
304 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495146  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7009  iron permease FTR1  28.52 
 
 
291 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  0.35089 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3605  iron permease FTR1  31.6 
 
 
276 aa  71.6  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80129  normal  0.423145 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1255  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  32.64 
 
 
603 aa  72  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3403  iron permease FTR1  27.8 
 
 
702 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1914  iron permease FTR1  29.3 
 
 
281 aa  70.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4773  iron permease FTR1  27.56 
 
 
303 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1568  iron permease FTR1  28.37 
 
 
304 aa  70.5  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2421  high-affinity iron transporter  31.31 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.328401  normal  0.0402063 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1954  iron permease FTR1  32.32 
 
 
289 aa  69.7  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.860822  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3323  iron permease FTR1  30.08 
 
 
307 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3352  iron permease FTR1  30 
 
 
277 aa  62.8  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.404846  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2875  iron permease FTR1  28.83 
 
 
280 aa  62.8  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1870  iron permease FTR1  27.27 
 
 
417 aa  60.1  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1783  iron permease FTR1  29.02 
 
 
634 aa  58.2  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.498306  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2692  iron permease FTR1  32.57 
 
 
273 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.37589  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03387  iron permease, FTR1 family protein  26.94 
 
 
253 aa  56.2  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1385  iron permease FTR1  29.09 
 
 
634 aa  55.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>