154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3367 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3367  Iron permease FTR1  100 
 
 		 284 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226405  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3596  hypothetical protein  94.72 
 
 		 284 aa  508  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2872  Iron permease FTR1  84.19 
 
 		 279 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.121627  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1811  iron permease FTR1  65.65 
 
 		 283 aa  342  2.9999999999999997e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.668278 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3859  iron permease FTR1  65.71 
 
 		 280 aa  340  2e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.627947  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2597  Iron permease FTR1  58.89 
 
 		 290 aa  335  7e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1733  iron permease FTR1  60.45 
 
 		 304 aa  331  1e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.997501  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3143  iron permease FTR1  58.42 
 
 		 281 aa  316  2e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2929  iron permease FTR1  57.14 
 
 		 281 aa  311  7.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00359497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2264  ferrous iron permease EfeU  59.49 
 
 		 282 aa  310  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2366  iron permease FTR1  59.49 
 
 		 282 aa  310  2.9999999999999997e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0450502  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2040  ferrous iron permease EfeU  59.12 
 
 		 285 aa  309  2.9999999999999997e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.19312 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1545  FTR1 family protein  58.57 
 
 		 277 aa  304  1.0000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.884821  normal  0.11427 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3314  iron permease FTR1  60.64 
 
 		 281 aa  297  2e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2784  iron permease FTR1  55.63 
 
 		 281 aa  296  3e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1954  iron permease FTR1  59.17 
 
 		 289 aa  295  4e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.860822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2106  iron permease FTR1 family protein  58.3 
 
 		 276 aa  288  6e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.178558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1258  iron permease FTR1 family protein  58.3 
 
 		 276 aa  287  1e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.20725  normal  0.52486 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2579  FTR1 family protein  58.3 
 
 		 276 aa  287  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01026  hypothetical protein  58.3 
 
 		 276 aa  287  1e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.377125  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1132  iron permease FTR1 family protein  58.3 
 
 		 276 aa  287  1e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0198612  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1136  FTR1 family iron permease  58.3 
 
 		 276 aa  287  1e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.161686  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01019  putative membrane protein  58.3 
 
 		 279 aa  286  2e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.348057  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1660  iron permease FTR1  57.79 
 
 		 278 aa  279  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0433  iron permease FTR1  57.63 
 
 		 278 aa  275  4e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287745 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25520  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  41.67 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0297463  normal  0.133563 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0188  iron permease FTR1  38.6 
 
 		 283 aa  185  9e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0228999 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4287  iron permease FTR1  41.03 
 
 		 290 aa  174  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486354  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1914  iron permease FTR1  42.11 
 
 		 281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3898  iron permease FTR1  43.46 
 
 		 537 aa  172  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5686  iron permease FTR1  37.97 
 
 		 287 aa  169  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.435606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4913  iron permease FTR1  41.97 
 
 		 579 aa  165  8e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0229  iron permease FTR1  38.35 
 
 		 284 aa  165  9e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7009  iron permease FTR1  38.99 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  0.35089 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3352  iron permease FTR1  40.22 
 
 		 277 aa  149  6e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.404846  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4773  iron permease FTR1  35.27 
 
 		 303 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3388  iron permease FTR1  36.43 
 
 		 294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3348  iron permease FTR1  36.16 
 
 		 677 aa  134  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1777  iron permease FTR1  33.97 
 
 		 691 aa  132  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3403  iron permease FTR1  35.85 
 
 		 702 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2612  iron permease FTR1  29.7 
 
 		 308 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000110205  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1789  iron permease FTR1  29.14 
 
 		 315 aa  122  9e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1952  iron permease FTR1  33.73 
 
 		 304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495146  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5173  iron permease FTR1  32.38 
 
 		 314 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000262497 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1177  iron permease FTR1  35.07 
 
 		 279 aa  119  6e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0971353  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2875  iron permease FTR1  35.82 
 
 		 280 aa  119  7e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1568  iron permease FTR1  31.79 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0839  iron permease FTR1  28.38 
 
 		 308 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1834  iron permease FTR1  33.7 
 
 		 288 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163431  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1763  Iron permease FTR1  28.24 
 
 		 315 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4257  iron permease FTR1  28.33 
 
 		 303 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3473  iron permease FTR1  31.12 
 
 		 308 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3323  iron permease FTR1  30.23 
 
 		 307 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4318  iron permease FTR1  28.57 
 
 		 303 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000385507  hitchhiker  0.00248903 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1870  iron permease FTR1  36.49 
 
 		 417 aa  99  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2421  high-affinity iron transporter  33.33 
 
 		 305 aa  98.6  9e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.328401  normal  0.0402063 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1070  iron permease FTR1  31.64 
 
 		 280 aa  97.4  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.599025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2245  iron permease FTR1  30.98 
 
 		 280 aa  95.9  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.998183  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2124  iron permease FTR1  30.98 
 
 		 280 aa  95.5  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.640841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3631  iron permease FTR1  31.14 
 
 		 279 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0110382 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2231  iron permease FTR1  31.25 
 
 		 280 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5535  Iron permease FTR1  31.25 
 
 		 280 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5870  iron permease FTR1  31.25 
 
 		 280 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.647838  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2207  iron permease FTR1  31.25 
 
 		 280 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0304  hypothetical protein  34.06 
 
 		 276 aa  90.9  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190446 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1955  iron permease FTR1  28.52 
 
 		 281 aa  89.7  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0621861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2033  FTR1 family iron permease  30.86 
 
 		 280 aa  89.4  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1399  iron permease FTR1  30.58 
 
 		 281 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0193139  normal  0.052775 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0883  FTR1 family iron permease  30.08 
 
 		 280 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1923  FTR1 family iron permease  30.08 
 
 		 280 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1742  OFeT family iron transporter  30.08 
 
 		 280 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0322131  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0012  OFeT family iron transporter  30.08 
 
 		 280 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0608  OFeT family iron transporter  30.08 
 
 		 280 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.189417  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0510  OFeT family iron transporter  30.08 
 
 		 280 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0912  OFeT family iron transporter  30.08 
 
 		 280 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.29643  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3150  oxidase-dependent Fe2+ transporter, (OFeT)family, FTR1-like  30.94 
 
 		 281 aa  87.4  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.92636  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2353  permease  32.21 
 
 		 653 aa  80.1  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  35.59 
 
 		 653 aa  79.3  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3854  iron permease FTR1  31.3 
 
 		 277 aa  79  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0383  FTR1 family iron permease  29 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.978993  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64944  plasma membrane iron permease  23.05 
 
 		 379 aa  77.4  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0331  FTR1 family iron permease  29 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0433  fumarate hydratase class II (fumarase C)  32.87 
 
 		 646 aa  76.3  0.0000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000013758  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0107  iron permease FTR1  31.8 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0744314 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3306  iron permease FTR1  29.24 
 
 		 273 aa  73.9  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.223999  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2302  iron permease FTR1  31.6 
 
 		 652 aa  73.9  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3198  iron permease FTR1  29.3 
 
 		 280 aa  72.8  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.521431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3605  iron permease FTR1  28.73 
 
 		 276 aa  72  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80129  normal  0.423145 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1170  iron permease, FTR1 family  37.41 
 
 		 691 aa  72  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.900718  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  32.54 
 
 		 647 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0160  iron permease FTR1 family protein  36 
 
 		 572 aa  70.1  0.00000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.31653 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  32.06 
 
 		 647 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0180  cytochrome c family protein  32.06 
 
 		 636 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.558942  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0141  lead uptake protein, putative  31.46 
 
 		 632 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0524  FTR1 family iron permease  29.61 
 
 		 637 aa  68.9  0.00000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.210875  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2018  FTR1 family iron permease  38.52 
 
 		 696 aa  68.9  0.00000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1783  iron permease FTR1  31.66 
 
 		 634 aa  68.2  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.498306  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0049  cytochrome c, class I:Iron permease FTR1  30.48 
 
 		 632 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1110  Iron permease FTR1  31.1 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.605403  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6336  Iron permease FTR1  30.8 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>