137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1170 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1830  FTR1 family iron permease  64.11 
 
 		 696 aa  862    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1649  FTR1 family iron permease  64.25 
 
 		 696 aa  870    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2018  FTR1 family iron permease  64.45 
 
 		 696 aa  841    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1170  iron permease, FTR1 family  100 
 
 		 691 aa  1373    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.900718  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0524  FTR1 family iron permease  39.33 
 
 		 637 aa  455  1.0000000000000001e-126  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.210875  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0763  superoxide dismutase  38.46 
 
 		 647 aa  424  1e-117  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.745778  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0450  FTR1 family iron permease  38.79 
 
 		 679 aa  411  1e-113  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000168197  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0433  fumarate hydratase class II (fumarase C)  36.4 
 
 		 646 aa  391  1e-107  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000013758  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2809  Iron permease FTR1  31.08 
 
 		 660 aa  323  5e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1783  iron permease FTR1  31.42 
 
 		 634 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.498306  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2141  FTR1 family iron permease  30.42 
 
 		 639 aa  307  5.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2132  FTR1 family iron permease  30.42 
 
 		 639 aa  307  5.0000000000000004e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0517239 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1385  iron permease FTR1  30.12 
 
 		 634 aa  301  4e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2252  iron permease FTR1  29.3 
 
 		 639 aa  290  5.0000000000000004e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1510  hypothetical protein  33.97 
 
 		 422 aa  187  7e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000353289  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0822  iron permease FTR1  30.97 
 
 		 396 aa  172  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0160  iron permease FTR1 family protein  31.02 
 
 		 572 aa  169  2e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.31653 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  33.16 
 
 		 653 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2954  iron permease FTR1  33.43 
 
 		 652 aa  162  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1058  iron permease FTR1  31.44 
 
 		 683 aa  153  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0352795  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1255  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  29.44 
 
 		 603 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  30.7 
 
 		 645 aa  145  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2302  iron permease FTR1  31.48 
 
 		 652 aa  141  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  30.23 
 
 		 644 aa  139  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2017  iron permease FTR1  31.04 
 
 		 413 aa  139  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00650927  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1022  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  32.04 
 
 		 556 aa  137  8e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2353  permease  27.49 
 
 		 653 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5945  Pb(II)-uptake protein PbrT  30.23 
 
 		 642 aa  135  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1953  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  30.18 
 
 		 637 aa  134  7.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.002939  normal  0.431592 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1817  iron permease FTR1  27.99 
 
 		 640 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.214502 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5282  iron permease FTR1  28.53 
 
 		 642 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1641  iron permease FTR1  28.53 
 
 		 642 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  31.14 
 
 		 643 aa  132  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5350  iron permease FTR1  29.36 
 
 		 640 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.620494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2692  iron permease FTR1  31.72 
 
 		 273 aa  126  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.37589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0482  iron permease FTR1  30.93 
 
 		 649 aa  126  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  28.94 
 
 		 647 aa  120  9e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69300  hypothetical protein  31.64 
 
 		 633 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3637  iron permease FTR1  27.95 
 
 		 664 aa  118  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0049  cytochrome c, class I:Iron permease FTR1  27.59 
 
 		 632 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0180  cytochrome c family protein  30.26 
 
 		 636 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.558942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5993  hypothetical protein  32.05 
 
 		 652 aa  114  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0141  lead uptake protein, putative  30.34 
 
 		 632 aa  114  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5470  cytochrome c, class I  27.47 
 
 		 631 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  30.26 
 
 		 647 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0723  cytochrome c, class I  31.8 
 
 		 657 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694021  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2561  iron permease FTR1  31.75 
 
 		 647 aa  111  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0393  hypothetical protein  29.76 
 
 		 570 aa  111  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0403  hypothetical protein  29.76 
 
 		 570 aa  111  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0292  iron permease FTR1  27.96 
 
 		 629 aa  109  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5728  iron permease FTR1  26 
 
 		 846 aa  97.8  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0820  iron permease FTR1  27.83 
 
 		 782 aa  97.4  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.594209  hitchhiker  0.0000623566 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1936  iron permease FTR1  33.19 
 
 		 279 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0480645 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2435  iron permease FTR1  26.01 
 
 		 743 aa  91.7  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4468  iron permease FTR1  25.43 
 
 		 779 aa  86.3  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.390175  normal  0.0190609 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0468  iron permease FTR1  24.93 
 
 		 820 aa  85.5  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.402804  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1733  iron permease FTR1  32.99 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.997501  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1870  iron permease FTR1  28.84 
 
 		 417 aa  76.6  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3596  hypothetical protein  36.73 
 
 		 284 aa  74.3  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2443  iron permease FTR1  25.98 
 
 		 399 aa  73.6  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3367  Iron permease FTR1  37.41 
 
 		 284 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1545  FTR1 family protein  30.61 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.884821  normal  0.11427 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4287  iron permease FTR1  28.64 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486354  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1981  iron permease FTR1  33.33 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2258  iron permease FTR1  32.72 
 
 		 276 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1914  iron permease FTR1  28.38 
 
 		 281 aa  69.3  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2612  iron permease FTR1  28.57 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000110205  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2929  iron permease FTR1  30.89 
 
 		 281 aa  67  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00359497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5686  iron permease FTR1  28.44 
 
 		 287 aa  67  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.435606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25520  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  30.77 
 
 		 294 aa  66.2  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0297463  normal  0.133563 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3143  iron permease FTR1  31.25 
 
 		 281 aa  65.1  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3348  iron permease FTR1  27.46 
 
 		 677 aa  63.9  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1777  iron permease FTR1  26.57 
 
 		 691 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1660  iron permease FTR1  27.95 
 
 		 278 aa  63.9  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0229  iron permease FTR1  31.15 
 
 		 284 aa  63.2  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5173  iron permease FTR1  29.5 
 
 		 314 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000262497 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01019  putative membrane protein  28.72 
 
 		 279 aa  62  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.348057  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2872  Iron permease FTR1  29.57 
 
 		 279 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.121627  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01026  hypothetical protein  28.72 
 
 		 276 aa  62  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.377125  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1258  iron permease FTR1 family protein  28.72 
 
 		 276 aa  62  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.20725  normal  0.52486 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2597  Iron permease FTR1  28 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0188  iron permease FTR1  27.37 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0228999 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1132  iron permease FTR1 family protein  28.72 
 
 		 276 aa  62  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0198612  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1136  FTR1 family iron permease  28.72 
 
 		 276 aa  62  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.161686  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2579  FTR1 family protein  28.72 
 
 		 276 aa  62  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2106  iron permease FTR1 family protein  28.72 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.178558  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1789  iron permease FTR1  26.67 
 
 		 315 aa  60.1  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2366  iron permease FTR1  30.77 
 
 		 282 aa  60.1  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0450502  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3403  iron permease FTR1  27.8 
 
 		 702 aa  59.7  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2264  ferrous iron permease EfeU  30.77 
 
 		 282 aa  59.7  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2040  ferrous iron permease EfeU  30.26 
 
 		 285 aa  59.7  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.19312 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0433  iron permease FTR1  26.1 
 
 		 278 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287745 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2784  iron permease FTR1  27.8 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1177  iron permease FTR1  29.67 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0971353  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3859  iron permease FTR1  31.88 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.627947  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3473  iron permease FTR1  27.57 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1811  iron permease FTR1  27.27 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.668278 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4913  iron permease FTR1  27.96 
 
 		 579 aa  57  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64944  plasma membrane iron permease  24.3 
 
 		 379 aa  57  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2875  iron permease FTR1  25.35 
 
 		 280 aa  56.6  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>