154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_01019 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01019  putative membrane protein  100 
 
 
279 aa  550  1e-155  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.348057  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2106  iron permease FTR1 family protein  99.64 
 
 
276 aa  540  1e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.178558  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2579  FTR1 family protein  100 
 
 
276 aa  543  1e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01026  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  543  1e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.377125  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1258  iron permease FTR1 family protein  100 
 
 
276 aa  543  1e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.20725  normal  0.52486 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1132  iron permease FTR1 family protein  100 
 
 
276 aa  543  1e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0198612  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1136  FTR1 family iron permease  100 
 
 
276 aa  543  1e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.161686  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1545  FTR1 family protein  88.41 
 
 
277 aa  472  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.884821  normal  0.11427 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2929  iron permease FTR1  80.15 
 
 
281 aa  439  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00359497  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2366  iron permease FTR1  75.72 
 
 
282 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0450502  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2040  ferrous iron permease EfeU  75.63 
 
 
285 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.19312 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2264  ferrous iron permease EfeU  75.36 
 
 
282 aa  413  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2784  iron permease FTR1  76 
 
 
281 aa  404  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3143  iron permease FTR1  74.53 
 
 
281 aa  402  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3596  hypothetical protein  59.04 
 
 
284 aa  295  5e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3859  iron permease FTR1  54.55 
 
 
280 aa  294  9e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.627947  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2872  Iron permease FTR1  57.93 
 
 
279 aa  293  3e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.121627  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2597  Iron permease FTR1  53.26 
 
 
290 aa  292  4e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1811  iron permease FTR1  56.11 
 
 
283 aa  287  1e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.668278 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3367  Iron permease FTR1  58.3 
 
 
284 aa  284  9e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226405  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1660  iron permease FTR1  57.53 
 
 
278 aa  268  7e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0433  iron permease FTR1  57.14 
 
 
278 aa  265  4e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00287745 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1733  iron permease FTR1  51.5 
 
 
304 aa  265  5e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.997501  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1954  iron permease FTR1  55.3 
 
 
289 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.860822  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3314  iron permease FTR1  52.9 
 
 
281 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0188  iron permease FTR1  40.65 
 
 
283 aa  194  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0228999 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4913  iron permease FTR1  45.15 
 
 
579 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3898  iron permease FTR1  40.82 
 
 
537 aa  186  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0229  iron permease FTR1  40.22 
 
 
284 aa  177  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3352  iron permease FTR1  42.96 
 
 
277 aa  172  3.9999999999999995e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.404846  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1914  iron permease FTR1  38.81 
 
 
281 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5686  iron permease FTR1  37.22 
 
 
287 aa  172  6.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.435606  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25520  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  37.64 
 
 
294 aa  170  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0297463  normal  0.133563 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7009  iron permease FTR1  39.26 
 
 
291 aa  169  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  0.35089 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3388  iron permease FTR1  37.31 
 
 
294 aa  159  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4287  iron permease FTR1  37.31 
 
 
290 aa  157  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486354  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3348  iron permease FTR1  37.09 
 
 
677 aa  137  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1789  iron permease FTR1  29.21 
 
 
315 aa  133  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1177  iron permease FTR1  37.74 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0971353  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2612  iron permease FTR1  31.02 
 
 
308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000110205  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5173  iron permease FTR1  29.64 
 
 
314 aa  125  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000262497 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1568  iron permease FTR1  36.96 
 
 
304 aa  124  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1777  iron permease FTR1  36.53 
 
 
691 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1763  Iron permease FTR1  29.43 
 
 
315 aa  122  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3473  iron permease FTR1  30.6 
 
 
308 aa  122  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4773  iron permease FTR1  32.45 
 
 
303 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3403  iron permease FTR1  31.09 
 
 
702 aa  120  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3323  iron permease FTR1  37.68 
 
 
307 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1952  iron permease FTR1  31.25 
 
 
304 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495146  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0839  iron permease FTR1  30.8 
 
 
308 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2875  iron permease FTR1  35.04 
 
 
280 aa  108  8.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4318  iron permease FTR1  29.39 
 
 
303 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000385507  hitchhiker  0.00248903 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4257  iron permease FTR1  29.03 
 
 
303 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3198  iron permease FTR1  29.5 
 
 
280 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.521431  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2245  iron permease FTR1  28.62 
 
 
280 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.998183  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5535  Iron permease FTR1  29.25 
 
 
280 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2124  iron permease FTR1  28.62 
 
 
280 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.640841  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2033  FTR1 family iron permease  29.62 
 
 
280 aa  98.6  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5870  iron permease FTR1  28.85 
 
 
280 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.647838  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2207  iron permease FTR1  28.85 
 
 
280 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2231  iron permease FTR1  28.85 
 
 
280 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0883  FTR1 family iron permease  28.85 
 
 
280 aa  96.3  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1923  FTR1 family iron permease  28.85 
 
 
280 aa  96.3  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1742  OFeT family iron transporter  28.85 
 
 
280 aa  96.3  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0322131  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0012  OFeT family iron transporter  28.85 
 
 
280 aa  96.3  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0608  OFeT family iron transporter  28.85 
 
 
280 aa  96.3  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.189417  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0510  OFeT family iron transporter  28.85 
 
 
280 aa  96.3  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0912  OFeT family iron transporter  28.85 
 
 
280 aa  96.3  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.29643  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1070  iron permease FTR1  28.06 
 
 
280 aa  96.3  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.599025  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3854  iron permease FTR1  33.96 
 
 
277 aa  95.5  9e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1870  iron permease FTR1  30.88 
 
 
417 aa  95.1  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2421  high-affinity iron transporter  31.64 
 
 
305 aa  94  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.328401  normal  0.0402063 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1399  iron permease FTR1  28.36 
 
 
281 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0193139  normal  0.052775 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1955  iron permease FTR1  27.08 
 
 
281 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0621861  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1834  iron permease FTR1  28.52 
 
 
288 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163431  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3150  oxidase-dependent Fe2+ transporter, (OFeT)family, FTR1-like  27.6 
 
 
281 aa  86.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.92636  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0304  hypothetical protein  30.59 
 
 
276 aa  84.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.190446 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6336  Iron permease FTR1  29.33 
 
 
278 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2103  Iron permease FTR1  28.35 
 
 
277 aa  80.1  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3306  iron permease FTR1  32.69 
 
 
273 aa  79  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.223999  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3631  iron permease FTR1  29.59 
 
 
279 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0110382 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1108  FTR1 family iron permease  30.36 
 
 
278 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2722  FTR1 family iron permease  30.36 
 
 
278 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112826  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2302  iron permease FTR1  30.73 
 
 
652 aa  75.1  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0107  iron permease FTR1  32.01 
 
 
277 aa  72.4  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0744314 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1830  FTR1 family iron permease  33.16 
 
 
696 aa  71.6  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2373  iron permease FTR1  27.4 
 
 
278 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2987  iron permease FTR1  27.4 
 
 
278 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3605  iron permease FTR1  28.68 
 
 
276 aa  70.9  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80129  normal  0.423145 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1649  FTR1 family iron permease  33.16 
 
 
696 aa  71.2  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2981  iron permease FTR1  29.18 
 
 
278 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2897  iron permease FTR1  29.03 
 
 
278 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2353  permease  30.05 
 
 
653 aa  70.5  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3007  iron permease FTR1  27.4 
 
 
278 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2875  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  30.77 
 
 
278 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0383  FTR1 family iron permease  28.99 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.978993  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0331  FTR1 family iron permease  28.99 
 
 
276 aa  70.1  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3034  iron permease FTR1  29.03 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2602  iron permease FTR1  26.07 
 
 
239 aa  69.3  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000455168  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0723  cytochrome c, class I  35.21 
 
 
657 aa  68.9  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694021  normal  0.821024 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>