206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1777 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3403  iron permease FTR1  52 
 
 		 702 aa  656    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1777  iron permease FTR1  100 
 
 		 691 aa  1378    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3348  iron permease FTR1  39.97 
 
 		 677 aa  431  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7481  iron permease FTR1  44.26 
 
 		 438 aa  287  5e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6260  iron permease FTR1  44.35 
 
 		 400 aa  268  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787835  normal  0.324266 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7009  iron permease FTR1  51.33 
 
 		 291 aa  244  5e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  0.35089 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4287  iron permease FTR1  46.89 
 
 		 290 aa  229  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486354  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25520  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  47.13 
 
 		 294 aa  228  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0297463  normal  0.133563 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1914  iron permease FTR1  46.39 
 
 		 281 aa  221  3.9999999999999997e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0229  iron permease FTR1  46.54 
 
 		 284 aa  209  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4773  iron permease FTR1  44.03 
 
 		 303 aa  208  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5686  iron permease FTR1  40.3 
 
 		 287 aa  204  5e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.435606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3388  iron permease FTR1  44.53 
 
 		 294 aa  200  7e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1952  iron permease FTR1  43.31 
 
 		 304 aa  194  6e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495146  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1568  iron permease FTR1  41.24 
 
 		 304 aa  178  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0188  iron permease FTR1  39.92 
 
 		 283 aa  165  3e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0228999 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2929  iron permease FTR1  37.55 
 
 		 281 aa  160  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00359497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3143  iron permease FTR1  38.99 
 
 		 281 aa  157  6e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1733  iron permease FTR1  37.26 
 
 		 304 aa  156  9e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.997501  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3859  iron permease FTR1  36.5 
 
 		 280 aa  156  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.627947  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3898  iron permease FTR1  39.77 
 
 		 537 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1811  iron permease FTR1  39.38 
 
 		 283 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.668278 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3597  hypothetical protein  30.28 
 
 		 402 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3368  hypothetical protein  30.37 
 
 		 403 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0438739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1660  iron permease FTR1  39.15 
 
 		 278 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4913  iron permease FTR1  37.16 
 
 		 579 aa  147  8.000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0433  iron permease FTR1  38.76 
 
 		 278 aa  144  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287745 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3596  hypothetical protein  35.37 
 
 		 284 aa  143  9e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2597  Iron permease FTR1  34.64 
 
 		 290 aa  143  9e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2872  Iron permease FTR1  37 
 
 		 279 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.121627  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3367  Iron permease FTR1  34.47 
 
 		 284 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1545  FTR1 family protein  35.25 
 
 		 277 aa  138  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.884821  normal  0.11427 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1661  hypothetical protein  28.49 
 
 		 375 aa  135  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3352  iron permease FTR1  38.54 
 
 		 277 aa  134  5e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.404846  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2784  iron permease FTR1  35.58 
 
 		 281 aa  133  9e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1132  iron permease FTR1 family protein  36.71 
 
 		 276 aa  130  6e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0198612  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1136  FTR1 family iron permease  36.71 
 
 		 276 aa  130  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.161686  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1258  iron permease FTR1 family protein  36.71 
 
 		 276 aa  130  6e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.20725  normal  0.52486 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01026  hypothetical protein  36.71 
 
 		 276 aa  130  6e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.377125  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2579  FTR1 family protein  36.71 
 
 		 276 aa  130  6e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01019  putative membrane protein  36.21 
 
 		 279 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.348057  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1954  iron permease FTR1  37 
 
 		 289 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.860822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2106  iron permease FTR1 family protein  37.05 
 
 		 276 aa  130  8.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.178558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2366  iron permease FTR1  35.47 
 
 		 282 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0450502  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2040  ferrous iron permease EfeU  35.32 
 
 		 285 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.19312 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2264  ferrous iron permease EfeU  35.47 
 
 		 282 aa  130  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1915  hypothetical protein  28.12 
 
 		 375 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.395386 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1810  protein of unknown function DUF451  30.06 
 
 		 386 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.742224 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0432  hypothetical protein  27.75 
 
 		 371 aa  127  8.000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00842747 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5685  hypothetical protein  27.99 
 
 		 376 aa  126  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.421727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4288  hypothetical protein  29.69 
 
 		 373 aa  123  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3144  hypothetical protein  29.4 
 
 		 374 aa  123  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3313  hypothetical protein  29.41 
 
 		 375 aa  122  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3314  iron permease FTR1  37.73 
 
 		 281 aa  120  9e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1546  hypothetical protein  28 
 
 		 375 aa  120  9e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.391559  normal  0.123429 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2105  hypothetical protein  28.49 
 
 		 375 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1177  iron permease FTR1  41.06 
 
 		 279 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0971353  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2873  hypothetical protein  29.05 
 
 		 399 aa  118  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.107096  normal  0.129995 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1259  hypothetical protein  28.49 
 
 		 375 aa  119  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.564709 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2783  hypothetical protein  28.23 
 
 		 373 aa  118  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1137  hypothetical protein  28.2 
 
 		 375 aa  117  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.108261  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01020  hypothetical protein  28.2 
 
 		 375 aa  117  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.154697  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2625  conserved hypothetical protein  28.2 
 
 		 375 aa  117  7.999999999999999e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0630269  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1133  hypothetical protein  28.2 
 
 		 375 aa  117  7.999999999999999e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0150694  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2578  hypothetical protein  28.2 
 
 		 375 aa  117  7.999999999999999e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0453581 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01027  hypothetical protein  28.2 
 
 		 375 aa  117  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.210857  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2263  hypothetical protein  30.46 
 
 		 376 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1808  protein of unknown function DUF451  31.38 
 
 		 281 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.69294 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2041  hypothetical protein  29.57 
 
 		 376 aa  115  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.117906 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1957  hypothetical protein  29.54 
 
 		 275 aa  115  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.551724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2365  hypothetical protein  29.57 
 
 		 376 aa  115  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0102412  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2928  hypothetical protein  28.49 
 
 		 378 aa  114  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000108571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0230  hypothetical protein  28.85 
 
 		 409 aa  114  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2600  hypothetical protein  29.71 
 
 		 272 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2612  iron permease FTR1  34.38 
 
 		 308 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000110205  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0189  hypothetical protein  30.84 
 
 		 385 aa  108  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0428055 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7008  hypothetical protein  26.59 
 
 		 393 aa  109  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.926109  normal  0.546103 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1736  hypothetical protein  30.96 
 
 		 275 aa  108  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.387479  normal  0.0591392 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4774  hypothetical protein  28.25 
 
 		 387 aa  108  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3311  hypothetical protein  28.87 
 
 		 278 aa  108  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2875  hypothetical protein  30.54 
 
 		 274 aa  106  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.485418  normal  0.113701 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1951  hypothetical protein  28.01 
 
 		 378 aa  105  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.406258 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3370  hypothetical protein  30.13 
 
 		 285 aa  103  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0182189  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3599  hypothetical protein  30.13 
 
 		 274 aa  103  9e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1734  hypothetical protein  27 
 
 		 385 aa  103  9e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0725409  normal  0.221375 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2421  high-affinity iron transporter  31.51 
 
 		 305 aa  103  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.328401  normal  0.0402063 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3856  hypothetical protein  28.97 
 
 		 275 aa  103  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.344115  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1789  iron permease FTR1  34.25 
 
 		 315 aa  102  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2875  iron permease FTR1  33.73 
 
 		 280 aa  99.8  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5173  iron permease FTR1  30.36 
 
 		 314 aa  99  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000262497 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3858  hypothetical protein  27.78 
 
 		 396 aa  99  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4328  hypothetical protein  29.48 
 
 		 309 aa  98.6  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.924044  normal  0.20283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4621  hypothetical protein  29.48 
 
 		 309 aa  98.6  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3323  iron permease FTR1  33.33 
 
 		 307 aa  98.6  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3473  iron permease FTR1  35.26 
 
 		 308 aa  97.1  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1567  Peptidase M75, Imelysin  24.73 
 
 		 404 aa  94  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2598  hypothetical protein  28.2 
 
 		 395 aa  93.6  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1870  iron permease FTR1  31.55 
 
 		 417 aa  93.2  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2353  hypothetical protein  25.07 
 
 		 396 aa  92.8  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2245  iron permease FTR1  31.25 
 
 		 280 aa  91.7  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.998183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>