158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0723 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0723  cytochrome c, class I  100 
 
 		 657 aa  1288    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694021  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  52.68 
 
 		 653 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  50.83 
 
 		 645 aa  561  1e-158  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3637  iron permease FTR1  42.66 
 
 		 664 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2302  iron permease FTR1  44.01 
 
 		 652 aa  445  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5945  Pb(II)-uptake protein PbrT  43.57 
 
 		 642 aa  436  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  45.54 
 
 		 643 aa  433  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1641  iron permease FTR1  42.13 
 
 		 642 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5350  iron permease FTR1  43.6 
 
 		 640 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.620494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2353  permease  45.05 
 
 		 653 aa  431  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  41.04 
 
 		 647 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5282  iron permease FTR1  42.13 
 
 		 642 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0180  cytochrome c family protein  41.34 
 
 		 636 aa  425  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.558942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  42.05 
 
 		 644 aa  423  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1817  iron permease FTR1  42.54 
 
 		 640 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.214502 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  41.34 
 
 		 647 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2561  iron permease FTR1  43.95 
 
 		 647 aa  414  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5470  cytochrome c, class I  41.5 
 
 		 631 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69300  hypothetical protein  40.79 
 
 		 633 aa  405  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0141  lead uptake protein, putative  39.17 
 
 		 632 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1953  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  39.12 
 
 		 637 aa  396  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.002939  normal  0.431592 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5993  hypothetical protein  41.13 
 
 		 652 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0049  cytochrome c, class I:Iron permease FTR1  39.43 
 
 		 632 aa  392  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2954  iron permease FTR1  35.65 
 
 		 652 aa  392  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0482  iron permease FTR1  42.81 
 
 		 649 aa  389  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1058  iron permease FTR1  36.51 
 
 		 683 aa  385  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0352795  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0292  iron permease FTR1  40.25 
 
 		 629 aa  378  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2252  iron permease FTR1  36.21 
 
 		 639 aa  181  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2141  FTR1 family iron permease  36.21 
 
 		 639 aa  180  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2132  FTR1 family iron permease  36.21 
 
 		 639 aa  180  7e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0517239 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1783  iron permease FTR1  36.92 
 
 		 634 aa  178  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.498306  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1385  iron permease FTR1  37.14 
 
 		 634 aa  178  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0450  FTR1 family iron permease  35.92 
 
 		 679 aa  178  3e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000168197  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2017  iron permease FTR1  34.78 
 
 		 413 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00650927  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0160  iron permease FTR1 family protein  33.79 
 
 		 572 aa  169  1e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.31653 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0433  fumarate hydratase class II (fumarase C)  32.25 
 
 		 646 aa  166  1.0000000000000001e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000013758  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1255  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  33.05 
 
 		 603 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6106  putative cytochrome protein CopT  43.06 
 
 		 254 aa  163  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.0345591 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0822  iron permease FTR1  35.78 
 
 		 396 aa  159  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2809  Iron permease FTR1  33.64 
 
 		 660 aa  158  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0524  FTR1 family iron permease  31.44 
 
 		 637 aa  157  7e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.210875  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0763  superoxide dismutase  33.76 
 
 		 647 aa  150  5e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.745778  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1830  FTR1 family iron permease  32.72 
 
 		 696 aa  148  3e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1649  FTR1 family iron permease  32.72 
 
 		 696 aa  146  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2018  FTR1 family iron permease  34.08 
 
 		 696 aa  146  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1170  iron permease, FTR1 family  31.8 
 
 		 691 aa  141  3.9999999999999997e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.900718  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2443  iron permease FTR1  35.06 
 
 		 399 aa  133  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1510  hypothetical protein  30.83 
 
 		 422 aa  124  4e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000353289  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1022  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  28.05 
 
 		 556 aa  106  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2692  iron permease FTR1  35.32 
 
 		 273 aa  106  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.37589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0393  hypothetical protein  26.65 
 
 		 570 aa  105  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0403  hypothetical protein  26.65 
 
 		 570 aa  105  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2435  iron permease FTR1  29.77 
 
 		 743 aa  104  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0468  iron permease FTR1  30.48 
 
 		 820 aa  103  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.402804  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0820  iron permease FTR1  28.33 
 
 		 782 aa  99  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.594209  hitchhiker  0.0000623566 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5728  iron permease FTR1  28.67 
 
 		 846 aa  97.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4468  iron permease FTR1  33.86 
 
 		 779 aa  93.6  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.390175  normal  0.0190609 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0188  iron permease FTR1  35.11 
 
 		 283 aa  90.5  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0228999 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4287  iron permease FTR1  34.65 
 
 		 290 aa  88.2  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486354  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1545  FTR1 family protein  35.21 
 
 		 277 aa  87.4  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.884821  normal  0.11427 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1914  iron permease FTR1  37.38 
 
 		 281 aa  87  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1936  iron permease FTR1  37.79 
 
 		 279 aa  85.5  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0480645 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2929  iron permease FTR1  34.09 
 
 		 281 aa  85.5  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00359497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01026  hypothetical protein  34.76 
 
 		 276 aa  84.7  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.377125  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1258  iron permease FTR1 family protein  34.76 
 
 		 276 aa  84.7  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.20725  normal  0.52486 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1132  iron permease FTR1 family protein  34.76 
 
 		 276 aa  84.7  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0198612  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1136  FTR1 family iron permease  34.76 
 
 		 276 aa  84.7  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.161686  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2579  FTR1 family protein  34.76 
 
 		 276 aa  84.7  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01019  putative membrane protein  34.76 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.348057  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2106  iron permease FTR1 family protein  34.76 
 
 		 276 aa  84.7  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.178558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5686  iron permease FTR1  31.63 
 
 		 287 aa  83.6  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.435606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3898  iron permease FTR1  33.96 
 
 		 537 aa  82.4  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3473  iron permease FTR1  33.85 
 
 		 308 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3143  iron permease FTR1  33.03 
 
 		 281 aa  82.4  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2612  iron permease FTR1  31.1 
 
 		 308 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000110205  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1733  iron permease FTR1  32.24 
 
 		 304 aa  79.7  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.997501  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4913  iron permease FTR1  31.43 
 
 		 579 aa  78.6  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25520  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  35.02 
 
 		 294 aa  78.6  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0297463  normal  0.133563 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4773  iron permease FTR1  37.09 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2784  iron permease FTR1  33.49 
 
 		 281 aa  76.6  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1789  iron permease FTR1  35.19 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1568  iron permease FTR1  30.47 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1952  iron permease FTR1  34.74 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495146  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2366  iron permease FTR1  31.78 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0450502  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2330  High-affinity Fe2+/Pb2+ permease-like protein  29.04 
 
 		 325 aa  73.6  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00178906  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2264  ferrous iron permease EfeU  31.78 
 
 		 282 aa  73.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2040  ferrous iron permease EfeU  31.78 
 
 		 285 aa  73.6  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.19312 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3596  hypothetical protein  32.76 
 
 		 284 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1177  iron permease FTR1  34.4 
 
 		 279 aa  72  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0971353  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0229  iron permease FTR1  34.72 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2258  iron permease FTR1  34.11 
 
 		 276 aa  72  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1981  iron permease FTR1  33.64 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2872  Iron permease FTR1  32.59 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.121627  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7009  iron permease FTR1  33.49 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  0.35089 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1660  iron permease FTR1  33.79 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3352  iron permease FTR1  36.02 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.404846  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3367  Iron permease FTR1  32.33 
 
 		 284 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1811  iron permease FTR1  29.91 
 
 		 283 aa  70.1  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.668278 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2597  Iron permease FTR1  28.96 
 
 		 290 aa  68.9  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0839  iron permease FTR1  29.58 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>