86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0468 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4468  iron permease FTR1  55.84 
 
 
779 aa  754    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.390175  normal  0.0190609 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0468  iron permease FTR1  100 
 
 
820 aa  1651    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.402804  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0820  iron permease FTR1  55.15 
 
 
782 aa  758    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.594209  hitchhiker  0.0000623566 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5728  iron permease FTR1  43.83 
 
 
846 aa  551  1e-155  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348131  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2435  iron permease FTR1  43.77 
 
 
743 aa  547  1e-154  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2330  High-affinity Fe2+/Pb2+ permease-like protein  40.94 
 
 
325 aa  197  8.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00178906  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  29.38 
 
 
653 aa  116  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1641  iron permease FTR1  28.26 
 
 
642 aa  114  9e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5282  iron permease FTR1  28.26 
 
 
642 aa  114  9e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2017  iron permease FTR1  30.58 
 
 
413 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00650927  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1817  iron permease FTR1  28.77 
 
 
640 aa  108  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.214502 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2353  permease  29.67 
 
 
653 aa  108  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5350  iron permease FTR1  27.92 
 
 
640 aa  108  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.620494  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5945  Pb(II)-uptake protein PbrT  29.62 
 
 
642 aa  108  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2809  Iron permease FTR1  29.71 
 
 
660 aa  102  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0433  fumarate hydratase class II (fumarase C)  27.91 
 
 
646 aa  100  1e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000013758  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1385  iron permease FTR1  26.44 
 
 
634 aa  99.4  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1783  iron permease FTR1  28.67 
 
 
634 aa  97.4  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.498306  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  26.71 
 
 
647 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69300  hypothetical protein  28.15 
 
 
633 aa  95.1  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0049  cytochrome c, class I:Iron permease FTR1  28.82 
 
 
632 aa  95.5  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0141  lead uptake protein, putative  30.97 
 
 
632 aa  94.4  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1022  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  27.11 
 
 
556 aa  94.4  8e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0763  superoxide dismutase  27.13 
 
 
647 aa  93.2  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.745778  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0450  FTR1 family iron permease  24.12 
 
 
679 aa  92.8  2e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000168197  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  26.48 
 
 
647 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0180  cytochrome c family protein  27 
 
 
636 aa  92.4  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.558942  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2302  iron permease FTR1  29.23 
 
 
652 aa  92  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5470  cytochrome c, class I  30.99 
 
 
631 aa  91.3  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2132  FTR1 family iron permease  29.15 
 
 
639 aa  90.9  8e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0517239 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2141  FTR1 family iron permease  29.15 
 
 
639 aa  90.9  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0723  cytochrome c, class I  30.48 
 
 
657 aa  90.5  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694021  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2252  iron permease FTR1  28.84 
 
 
639 aa  89.4  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1953  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  26.82 
 
 
637 aa  89  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.002939  normal  0.431592 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2954  iron permease FTR1  26.55 
 
 
652 aa  88.2  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1170  iron permease, FTR1 family  24.93 
 
 
691 aa  87.8  7e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.900718  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1058  iron permease FTR1  24.85 
 
 
683 aa  87.4  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0352795  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5993  hypothetical protein  28.48 
 
 
652 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0524  FTR1 family iron permease  27.48 
 
 
637 aa  84.7  0.000000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.210875  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0160  iron permease FTR1 family protein  27.78 
 
 
572 aa  84.7  0.000000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.31653 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1649  FTR1 family iron permease  25.36 
 
 
696 aa  84  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1830  FTR1 family iron permease  25.36 
 
 
696 aa  84  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2018  FTR1 family iron permease  26.32 
 
 
696 aa  82.8  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  27.61 
 
 
645 aa  83.2  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0292  iron permease FTR1  29.79 
 
 
629 aa  81.3  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0403  hypothetical protein  29.39 
 
 
570 aa  81.3  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0393  hypothetical protein  29.39 
 
 
570 aa  81.3  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  26.57 
 
 
644 aa  80.1  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  27.21 
 
 
643 aa  78.2  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0822  iron permease FTR1  31.28 
 
 
396 aa  74.7  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3637  iron permease FTR1  26.33 
 
 
664 aa  74.7  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1510  hypothetical protein  28.48 
 
 
422 aa  74.7  0.000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000353289  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2612  iron permease FTR1  29.24 
 
 
308 aa  72  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000110205  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0839  iron permease FTR1  30.51 
 
 
308 aa  70.9  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2443  iron permease FTR1  30.51 
 
 
399 aa  70.9  0.00000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1255  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  25.79 
 
 
603 aa  70.5  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0482  iron permease FTR1  26.92 
 
 
649 aa  68.9  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2692  iron permease FTR1  26.95 
 
 
273 aa  66.6  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.37589  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5686  iron permease FTR1  27.2 
 
 
287 aa  61.6  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.435606  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1936  iron permease FTR1  29.8 
 
 
279 aa  60.5  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0480645 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2561  iron permease FTR1  26.85 
 
 
647 aa  60.1  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3473  iron permease FTR1  27.23 
 
 
308 aa  58.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1733  iron permease FTR1  28.65 
 
 
304 aa  57  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.997501  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3143  iron permease FTR1  28.28 
 
 
281 aa  54.7  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4913  iron permease FTR1  34.72 
 
 
579 aa  53.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2929  iron permease FTR1  29.17 
 
 
281 aa  50.8  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00359497  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2602  iron permease FTR1  23.08 
 
 
239 aa  50.1  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000455168  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1870  iron permease FTR1  30.84 
 
 
417 aa  50.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1952  iron permease FTR1  27.16 
 
 
304 aa  50.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495146  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3859  iron permease FTR1  31.69 
 
 
280 aa  49.3  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.627947  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5173  iron permease FTR1  27.52 
 
 
314 aa  48.5  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000262497 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3323  iron permease FTR1  31.22 
 
 
307 aa  48.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2597  Iron permease FTR1  26.29 
 
 
290 aa  47.8  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3348  iron permease FTR1  31.53 
 
 
677 aa  47  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1789  iron permease FTR1  27.62 
 
 
315 aa  47.4  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3367  Iron permease FTR1  31.91 
 
 
284 aa  47.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226405  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1981  iron permease FTR1  28.11 
 
 
276 aa  47.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3596  hypothetical protein  31.21 
 
 
284 aa  47  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3314  iron permease FTR1  25.59 
 
 
281 aa  47.4  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0188  iron permease FTR1  24.54 
 
 
283 aa  47.4  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0228999 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2258  iron permease FTR1  28.63 
 
 
276 aa  47.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3898  iron permease FTR1  26.17 
 
 
537 aa  46.2  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4773  iron permease FTR1  27.05 
 
 
303 aa  46.2  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3388  iron permease FTR1  28.57 
 
 
294 aa  45.1  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25520  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  29.93 
 
 
294 aa  44.3  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0297463  normal  0.133563 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2366  iron permease FTR1  29.74 
 
 
282 aa  44.3  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0450502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>