135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2954 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1058  iron permease FTR1  64.14 
 
 		 683 aa  810    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0352795  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2954  iron permease FTR1  100 
 
 		 652 aa  1318    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1953  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  47.7 
 
 		 637 aa  553  1e-156  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.002939  normal  0.431592 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  37.16 
 
 		 645 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2302  iron permease FTR1  40.33 
 
 		 652 aa  400  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2561  iron permease FTR1  38.88 
 
 		 647 aa  397  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1641  iron permease FTR1  38.13 
 
 		 642 aa  389  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5282  iron permease FTR1  38.13 
 
 		 642 aa  389  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1817  iron permease FTR1  38.03 
 
 		 640 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.214502 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  38 
 
 		 653 aa  380  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5350  iron permease FTR1  36.61 
 
 		 640 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.620494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2353  permease  37.13 
 
 		 653 aa  379  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3637  iron permease FTR1  36.86 
 
 		 664 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  35.1 
 
 		 643 aa  366  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5945  Pb(II)-uptake protein PbrT  35.4 
 
 		 642 aa  368  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  35.68 
 
 		 644 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0723  cytochrome c, class I  35.65 
 
 		 657 aa  357  5e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694021  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  34.31 
 
 		 647 aa  340  5e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69300  hypothetical protein  34.09 
 
 		 633 aa  339  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0180  cytochrome c family protein  34.1 
 
 		 636 aa  334  3e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.558942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0482  iron permease FTR1  35.93 
 
 		 649 aa  334  3e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0141  lead uptake protein, putative  34.39 
 
 		 632 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  33.93 
 
 		 647 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0292  iron permease FTR1  35.35 
 
 		 629 aa  326  7e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0049  cytochrome c, class I:Iron permease FTR1  32.9 
 
 		 632 aa  326  8.000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5470  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 631 aa  323  8e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5993  hypothetical protein  33.33 
 
 		 652 aa  320  6e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2252  iron permease FTR1  30.6 
 
 		 639 aa  180  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2141  FTR1 family iron permease  30.6 
 
 		 639 aa  180  9e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2132  FTR1 family iron permease  30.6 
 
 		 639 aa  180  9e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0517239 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0450  FTR1 family iron permease  31.62 
 
 		 679 aa  179  1e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000168197  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1783  iron permease FTR1  32.61 
 
 		 634 aa  171  4e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.498306  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1385  iron permease FTR1  32.29 
 
 		 634 aa  169  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2809  Iron permease FTR1  31.56 
 
 		 660 aa  159  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1170  iron permease, FTR1 family  33.43 
 
 		 691 aa  157  5.0000000000000005e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.900718  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2017  iron permease FTR1  29.17 
 
 		 413 aa  156  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00650927  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0524  FTR1 family iron permease  29.86 
 
 		 637 aa  154  4e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.210875  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0822  iron permease FTR1  32.19 
 
 		 396 aa  154  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0433  fumarate hydratase class II (fumarase C)  28.92 
 
 		 646 aa  153  8e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000013758  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1649  FTR1 family iron permease  34.23 
 
 		 696 aa  153  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1830  FTR1 family iron permease  33.63 
 
 		 696 aa  150  5e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0763  superoxide dismutase  29.91 
 
 		 647 aa  150  5e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.745778  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2018  FTR1 family iron permease  34.74 
 
 		 696 aa  149  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0160  iron permease FTR1 family protein  31.7 
 
 		 572 aa  142  1.9999999999999998e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.31653 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1022  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  27.93 
 
 		 556 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6106  putative cytochrome protein CopT  37.37 
 
 		 254 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.0345591 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1510  hypothetical protein  30.75 
 
 		 422 aa  140  6e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000353289  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0393  hypothetical protein  28.05 
 
 		 570 aa  132  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0403  hypothetical protein  28.05 
 
 		 570 aa  132  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1255  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  26.63 
 
 		 603 aa  117  7.999999999999999e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2692  iron permease FTR1  34.26 
 
 		 273 aa  115  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.37589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2443  iron permease FTR1  28.62 
 
 		 399 aa  105  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2435  iron permease FTR1  26.41 
 
 		 743 aa  103  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1936  iron permease FTR1  32.53 
 
 		 279 aa  96.7  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0480645 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5728  iron permease FTR1  27.2 
 
 		 846 aa  89.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1981  iron permease FTR1  33.33 
 
 		 276 aa  87.8  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0468  iron permease FTR1  26.55 
 
 		 820 aa  87.4  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.402804  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2258  iron permease FTR1  32.22 
 
 		 276 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2612  iron permease FTR1  28.69 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000110205  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4287  iron permease FTR1  31.7 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486354  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2929  iron permease FTR1  31.34 
 
 		 281 aa  79  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00359497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2784  iron permease FTR1  29.28 
 
 		 281 aa  78.6  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3143  iron permease FTR1  30.77 
 
 		 281 aa  77  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1952  iron permease FTR1  34.88 
 
 		 304 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495146  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1914  iron permease FTR1  33.05 
 
 		 281 aa  75.5  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2040  ferrous iron permease EfeU  29.31 
 
 		 285 aa  75.1  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.19312 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0820  iron permease FTR1  26.72 
 
 		 782 aa  74.3  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.594209  hitchhiker  0.0000623566 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2366  iron permease FTR1  28.89 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0450502  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2264  ferrous iron permease EfeU  28.89 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3473  iron permease FTR1  31 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0161  cytochrome c class I  38.1 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000207523  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1660  iron permease FTR1  30.99 
 
 		 278 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1870  iron permease FTR1  28.64 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4468  iron permease FTR1  27.76 
 
 		 779 aa  70.5  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.390175  normal  0.0190609 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7009  iron permease FTR1  32.74 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  0.35089 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4773  iron permease FTR1  32.09 
 
 		 303 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1789  iron permease FTR1  30.41 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0120  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  31.55 
 
 		 339 aa  65.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1733  iron permease FTR1  28.44 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.997501  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0229  iron permease FTR1  29.05 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0188  iron permease FTR1  30.73 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0228999 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01019  putative membrane protein  28.57 
 
 		 279 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.348057  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1132  iron permease FTR1 family protein  28.57 
 
 		 276 aa  63.2  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0198612  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1136  FTR1 family iron permease  28.57 
 
 		 276 aa  63.2  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.161686  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2579  FTR1 family protein  28.57 
 
 		 276 aa  63.2  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2106  iron permease FTR1 family protein  28.57 
 
 		 276 aa  63.2  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.178558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01026  hypothetical protein  28.57 
 
 		 276 aa  63.2  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.377125  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1258  iron permease FTR1 family protein  28.57 
 
 		 276 aa  63.2  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.20725  normal  0.52486 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0839  iron permease FTR1  26.5 
 
 		 308 aa  62  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0433  iron permease FTR1  28.51 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287745 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2597  Iron permease FTR1  27.47 
 
 		 290 aa  60.5  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1777  iron permease FTR1  27.95 
 
 		 691 aa  60.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3323  iron permease FTR1  29.91 
 
 		 307 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25520  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  27 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0297463  normal  0.133563 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1568  iron permease FTR1  30.05 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0101  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  30.66 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000967148 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4136  cytochrome c class I  34.41 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3403  iron permease FTR1  29.36 
 
 		 702 aa  58.2  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5686  iron permease FTR1  25.99 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.435606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4913  iron permease FTR1  30.19 
 
 		 579 aa  57  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>