153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5993 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0180  cytochrome c family protein  69.47 
 
 		 636 aa  869    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.558942  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0141  lead uptake protein, putative  70.32 
 
 		 632 aa  886    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0049  cytochrome c, class I:Iron permease FTR1  71.36 
 
 		 632 aa  860    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5470  cytochrome c, class I  68.53 
 
 		 631 aa  856    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69300  hypothetical protein  95.09 
 
 		 633 aa  1213    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0292  iron permease FTR1  66.93 
 
 		 629 aa  801    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  67.87 
 
 		 647 aa  857    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5993  hypothetical protein  100 
 
 		 652 aa  1305    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  69.79 
 
 		 647 aa  872    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  39.31 
 
 		 653 aa  419  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  41.49 
 
 		 645 aa  414  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0723  cytochrome c, class I  40.75 
 
 		 657 aa  358  2.9999999999999997e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694021  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1953  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  35.9 
 
 		 637 aa  354  2.9999999999999997e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.002939  normal  0.431592 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5945  Pb(II)-uptake protein PbrT  37.27 
 
 		 642 aa  343  5e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2302  iron permease FTR1  38.09 
 
 		 652 aa  343  5e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1817  iron permease FTR1  36.57 
 
 		 640 aa  340  5e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.214502 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3637  iron permease FTR1  38.49 
 
 		 664 aa  340  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1641  iron permease FTR1  36.61 
 
 		 642 aa  336  9e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5282  iron permease FTR1  36.61 
 
 		 642 aa  336  9e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2561  iron permease FTR1  40.7 
 
 		 647 aa  333  7.000000000000001e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5350  iron permease FTR1  35.76 
 
 		 640 aa  330  5.0000000000000004e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.620494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  38.15 
 
 		 643 aa  327  4.0000000000000003e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  37.32 
 
 		 644 aa  326  7e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1058  iron permease FTR1  33.55 
 
 		 683 aa  324  3e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0352795  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2954  iron permease FTR1  32.79 
 
 		 652 aa  324  3e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2353  permease  36.67 
 
 		 653 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0482  iron permease FTR1  37.31 
 
 		 649 aa  291  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2017  iron permease FTR1  34.94 
 
 		 413 aa  159  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00650927  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0160  iron permease FTR1 family protein  33.08 
 
 		 572 aa  153  1e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.31653 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0433  fumarate hydratase class II (fumarase C)  22.97 
 
 		 646 aa  133  9e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000013758  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0450  FTR1 family iron permease  29.21 
 
 		 679 aa  133  1.0000000000000001e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000168197  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0763  superoxide dismutase  27.67 
 
 		 647 aa  132  2.0000000000000002e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.745778  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1783  iron permease FTR1  31.15 
 
 		 634 aa  131  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.498306  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0822  iron permease FTR1  34.89 
 
 		 396 aa  131  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1510  hypothetical protein  29.35 
 
 		 422 aa  129  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000353289  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2252  iron permease FTR1  29.26 
 
 		 639 aa  127  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6106  putative cytochrome protein CopT  38.57 
 
 		 254 aa  127  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.0345591 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2141  FTR1 family iron permease  29.26 
 
 		 639 aa  127  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2132  FTR1 family iron permease  29.26 
 
 		 639 aa  127  6e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0517239 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0524  FTR1 family iron permease  27.78 
 
 		 637 aa  126  1e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.210875  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2809  Iron permease FTR1  31.34 
 
 		 660 aa  125  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1385  iron permease FTR1  30.06 
 
 		 634 aa  123  9e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1255  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  27.09 
 
 		 603 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1170  iron permease, FTR1 family  30.86 
 
 		 691 aa  107  9e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.900718  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2018  FTR1 family iron permease  30.04 
 
 		 696 aa  103  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1830  FTR1 family iron permease  28.73 
 
 		 696 aa  101  5e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2443  iron permease FTR1  32.24 
 
 		 399 aa  99.8  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1649  FTR1 family iron permease  28.73 
 
 		 696 aa  99.4  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1022  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  24.59 
 
 		 556 aa  97.8  5e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0393  hypothetical protein  25.68 
 
 		 570 aa  93.2  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0403  hypothetical protein  25.68 
 
 		 570 aa  93.2  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2692  iron permease FTR1  32.23 
 
 		 273 aa  92.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.37589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2435  iron permease FTR1  28.68 
 
 		 743 aa  92.4  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0820  iron permease FTR1  27.63 
 
 		 782 aa  90.1  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.594209  hitchhiker  0.0000623566 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5728  iron permease FTR1  27.84 
 
 		 846 aa  88.2  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0468  iron permease FTR1  28.91 
 
 		 820 aa  79.7  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.402804  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4468  iron permease FTR1  27.55 
 
 		 779 aa  74.7  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.390175  normal  0.0190609 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0161  cytochrome c class I  45 
 
 		 254 aa  72  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000207523  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0101  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  34.69 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000967148 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2320  cytochrome c, class I  32.04 
 
 		 702 aa  69.7  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2760  cytochrome c, class I  32.04 
 
 		 702 aa  69.7  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2330  High-affinity Fe2+/Pb2+ permease-like protein  29.77 
 
 		 325 aa  69.7  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00178906  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2612  iron permease FTR1  24.34 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000110205  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1870  iron permease FTR1  28.23 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0120  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  32.89 
 
 		 339 aa  67  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1914  iron permease FTR1  34.13 
 
 		 281 aa  65.5  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3323  iron permease FTR1  34.54 
 
 		 307 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4287  iron permease FTR1  30.23 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486354  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5686  iron permease FTR1  30.66 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.435606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25520  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  30.41 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0297463  normal  0.133563 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4913  iron permease FTR1  29.63 
 
 		 579 aa  63.9  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0188  iron permease FTR1  32.31 
 
 		 283 aa  63.9  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0228999 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3348  iron permease FTR1  30.67 
 
 		 677 aa  63.9  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1733  iron permease FTR1  29.77 
 
 		 304 aa  63.2  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.997501  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1936  iron permease FTR1  32.47 
 
 		 279 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0480645 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3596  hypothetical protein  30 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1954  iron permease FTR1  29.79 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.860822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7009  iron permease FTR1  34.55 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  0.35089 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3367  Iron permease FTR1  28.1 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3143  iron permease FTR1  28 
 
 		 281 aa  55.8  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1660  iron permease FTR1  30.09 
 
 		 278 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1177  iron permease FTR1  27.93 
 
 		 279 aa  55.5  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0971353  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0229  iron permease FTR1  31.92 
 
 		 284 aa  54.7  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0557  cytochrome c, class I  34.48 
 
 		 683 aa  54.3  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3898  iron permease FTR1  27.27 
 
 		 537 aa  53.9  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0839  iron permease FTR1  24.89 
 
 		 308 aa  53.9  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2773  hypothetical protein  35.06 
 
 		 151 aa  53.9  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000119865  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01019  putative membrane protein  28.91 
 
 		 279 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.348057  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1258  iron permease FTR1 family protein  28.91 
 
 		 276 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.20725  normal  0.52486 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01026  hypothetical protein  28.91 
 
 		 276 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.377125  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2258  iron permease FTR1  30.3 
 
 		 276 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1132  iron permease FTR1 family protein  28.91 
 
 		 276 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0198612  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1136  FTR1 family iron permease  28.91 
 
 		 276 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.161686  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2929  iron permease FTR1  27.68 
 
 		 281 aa  52.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00359497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1981  iron permease FTR1  30.3 
 
 		 276 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2579  FTR1 family protein  28.91 
 
 		 276 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2106  iron permease FTR1 family protein  28.91 
 
 		 276 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.178558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2597  Iron permease FTR1  27.53 
 
 		 290 aa  52.4  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0148  cytochrome c, class I  34.21 
 
 		 248 aa  52.4  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1545  FTR1 family protein  27.96 
 
 		 277 aa  52  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.884821  normal  0.11427 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>