85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4468 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4468  iron permease FTR1  100 
 
 		 779 aa  1530    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.390175  normal  0.0190609 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0468  iron permease FTR1  55.84 
 
 		 820 aa  795    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.402804  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0820  iron permease FTR1  74.58 
 
 		 782 aa  1066    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.594209  hitchhiker  0.0000623566 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5728  iron permease FTR1  46.51 
 
 		 846 aa  605  9.999999999999999e-173  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2435  iron permease FTR1  43.57 
 
 		 743 aa  540  9.999999999999999e-153  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2330  High-affinity Fe2+/Pb2+ permease-like protein  39.57 
 
 		 325 aa  193  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00178906  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  28.16 
 
 		 653 aa  119  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2017  iron permease FTR1  30.26 
 
 		 413 aa  115  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00650927  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1641  iron permease FTR1  31.01 
 
 		 642 aa  114  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5282  iron permease FTR1  31.01 
 
 		 642 aa  114  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5350  iron permease FTR1  29.92 
 
 		 640 aa  112  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.620494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1817  iron permease FTR1  30.92 
 
 		 640 aa  105  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.214502 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1783  iron permease FTR1  28.98 
 
 		 634 aa  101  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.498306  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5945  Pb(II)-uptake protein PbrT  29.07 
 
 		 642 aa  100  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0433  fumarate hydratase class II (fumarase C)  27.65 
 
 		 646 aa  97.1  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000013758  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2353  permease  29.37 
 
 		 653 aa  97.1  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2302  iron permease FTR1  32.19 
 
 		 652 aa  96.3  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1170  iron permease, FTR1 family  26.01 
 
 		 691 aa  95.5  3e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.900718  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  29.18 
 
 		 647 aa  95.9  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0180  cytochrome c family protein  29.44 
 
 		 636 aa  94  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.558942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1385  iron permease FTR1  28.61 
 
 		 634 aa  93.6  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2809  Iron permease FTR1  29.41 
 
 		 660 aa  90.9  8e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2132  FTR1 family iron permease  27.49 
 
 		 639 aa  90.5  9e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0517239 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  28.87 
 
 		 647 aa  90.9  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2141  FTR1 family iron permease  27.49 
 
 		 639 aa  90.5  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  29.95 
 
 		 643 aa  90.1  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2252  iron permease FTR1  27.19 
 
 		 639 aa  89.4  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3637  iron permease FTR1  29.53 
 
 		 664 aa  89.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0723  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 657 aa  88.2  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694021  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0049  cytochrome c, class I:Iron permease FTR1  31.62 
 
 		 632 aa  87.8  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0141  lead uptake protein, putative  31.58 
 
 		 632 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69300  hypothetical protein  28.33 
 
 		 633 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1022  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  29.51 
 
 		 556 aa  85.5  0.000000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  28.03 
 
 		 644 aa  84.7  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0292  iron permease FTR1  28.53 
 
 		 629 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5470  cytochrome c, class I  27.27 
 
 		 631 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0763  superoxide dismutase  28.04 
 
 		 647 aa  82.8  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.745778  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5993  hypothetical protein  27.74 
 
 		 652 aa  82  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0524  FTR1 family iron permease  25.53 
 
 		 637 aa  80.5  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.210875  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2692  iron permease FTR1  27.55 
 
 		 273 aa  80.5  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.37589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0450  FTR1 family iron permease  26.03 
 
 		 679 aa  79.7  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000168197  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2018  FTR1 family iron permease  27.16 
 
 		 696 aa  78.2  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1649  FTR1 family iron permease  27.33 
 
 		 696 aa  78.2  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1830  FTR1 family iron permease  27.33 
 
 		 696 aa  78.2  0.0000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1510  hypothetical protein  27.92 
 
 		 422 aa  76.6  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000353289  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  26.32 
 
 		 645 aa  75.5  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0482  iron permease FTR1  27.34 
 
 		 649 aa  74.7  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2954  iron permease FTR1  25.86 
 
 		 652 aa  74.7  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1058  iron permease FTR1  27.49 
 
 		 683 aa  74.7  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0352795  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2561  iron permease FTR1  29.36 
 
 		 647 aa  74.3  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2443  iron permease FTR1  29.21 
 
 		 399 aa  73.6  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0822  iron permease FTR1  32.85 
 
 		 396 aa  73.2  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1255  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  25 
 
 		 603 aa  68.2  0.0000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1953  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  28.62 
 
 		 637 aa  68.2  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.002939  normal  0.431592 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0403  hypothetical protein  25 
 
 		 570 aa  67  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0393  hypothetical protein  25 
 
 		 570 aa  67  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0160  iron permease FTR1 family protein  27.06 
 
 		 572 aa  66.6  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.31653 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0839  iron permease FTR1  27.31 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2612  iron permease FTR1  27.97 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000110205  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1936  iron permease FTR1  29.8 
 
 		 279 aa  60.5  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0480645 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1733  iron permease FTR1  27.62 
 
 		 304 aa  59.3  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.997501  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5686  iron permease FTR1  25.23 
 
 		 287 aa  57  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.435606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3143  iron permease FTR1  28.77 
 
 		 281 aa  53.1  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4913  iron permease FTR1  32.87 
 
 		 579 aa  50.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1981  iron permease FTR1  30.42 
 
 		 276 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3367  Iron permease FTR1  30.99 
 
 		 284 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3314  iron permease FTR1  28.44 
 
 		 281 aa  50.1  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2258  iron permease FTR1  30.42 
 
 		 276 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3898  iron permease FTR1  27.85 
 
 		 537 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3596  hypothetical protein  30.28 
 
 		 284 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2929  iron permease FTR1  26.94 
 
 		 281 aa  48.1  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00359497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2597  Iron permease FTR1  26.77 
 
 		 290 aa  47.8  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3348  iron permease FTR1  28.04 
 
 		 677 aa  47.8  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1789  iron permease FTR1  27.23 
 
 		 315 aa  47.8  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3859  iron permease FTR1  30.28 
 
 		 280 aa  47.8  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.627947  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1568  iron permease FTR1  24.17 
 
 		 304 aa  47  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3473  iron permease FTR1  26.67 
 
 		 308 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2602  iron permease FTR1  19.57 
 
 		 239 aa  45.8  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000455168  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1763  Iron permease FTR1  27.18 
 
 		 315 aa  45.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4287  iron permease FTR1  29.15 
 
 		 290 aa  44.7  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486354  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1954  iron permease FTR1  31.21 
 
 		 289 aa  45.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.860822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2366  iron permease FTR1  27.78 
 
 		 282 aa  44.7  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0450502  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2040  ferrous iron permease EfeU  27.27 
 
 		 285 aa  44.3  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.19312 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2264  ferrous iron permease EfeU  27.78 
 
 		 282 aa  44.3  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0229  iron permease FTR1  31.43 
 
 		 284 aa  43.9  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>