102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2435 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2435  iron permease FTR1  100 
 
 		 743 aa  1472    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0468  iron permease FTR1  44.3 
 
 		 820 aa  545  1e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.402804  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0820  iron permease FTR1  45.42 
 
 		 782 aa  527  1e-148  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.594209  hitchhiker  0.0000623566 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4468  iron permease FTR1  43.44 
 
 		 779 aa  512  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.390175  normal  0.0190609 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5728  iron permease FTR1  39.31 
 
 		 846 aa  467  9.999999999999999e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2330  High-affinity Fe2+/Pb2+ permease-like protein  38.85 
 
 		 325 aa  193  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00178906  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2302  iron permease FTR1  31.37 
 
 		 652 aa  113  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1058  iron permease FTR1  27.54 
 
 		 683 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0352795  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0433  fumarate hydratase class II (fumarase C)  28.02 
 
 		 646 aa  109  2e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000013758  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2017  iron permease FTR1  30.31 
 
 		 413 aa  108  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00650927  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0450  FTR1 family iron permease  24.83 
 
 		 679 aa  108  5e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000168197  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1641  iron permease FTR1  26.88 
 
 		 642 aa  102  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5282  iron permease FTR1  26.88 
 
 		 642 aa  102  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0763  superoxide dismutase  27.43 
 
 		 647 aa  101  4e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.745778  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  28.53 
 
 		 653 aa  101  6e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0180  cytochrome c family protein  29.63 
 
 		 636 aa  99  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.558942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1817  iron permease FTR1  26.65 
 
 		 640 aa  99  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.214502 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5350  iron permease FTR1  26.47 
 
 		 640 aa  98.2  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.620494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  28.61 
 
 		 647 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0049  cytochrome c, class I:Iron permease FTR1  29.57 
 
 		 632 aa  95.1  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2353  permease  27.68 
 
 		 653 aa  95.5  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1953  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  28.92 
 
 		 637 aa  94.7  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.002939  normal  0.431592 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2954  iron permease FTR1  26.41 
 
 		 652 aa  94.7  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0141  lead uptake protein, putative  28.91 
 
 		 632 aa  94  9e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69300  hypothetical protein  28.43 
 
 		 633 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5470  cytochrome c, class I  28.65 
 
 		 631 aa  92.4  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  31.48 
 
 		 647 aa  91.7  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2443  iron permease FTR1  32.25 
 
 		 399 aa  90.5  9e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5945  Pb(II)-uptake protein PbrT  26.2 
 
 		 642 aa  89  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5993  hypothetical protein  29.46 
 
 		 652 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0160  iron permease FTR1 family protein  27.34 
 
 		 572 aa  87  0.000000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.31653 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1170  iron permease, FTR1 family  26.01 
 
 		 691 aa  85.1  0.000000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.900718  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1783  iron permease FTR1  28.06 
 
 		 634 aa  81.3  0.00000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.498306  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  29.16 
 
 		 644 aa  80.9  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0723  cytochrome c, class I  32.83 
 
 		 657 aa  80.5  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694021  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1022  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  23.79 
 
 		 556 aa  80.1  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2141  FTR1 family iron permease  26.84 
 
 		 639 aa  79.3  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2132  FTR1 family iron permease  26.84 
 
 		 639 aa  79.3  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0517239 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2252  iron permease FTR1  26.84 
 
 		 639 aa  79.7  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5686  iron permease FTR1  29.57 
 
 		 287 aa  79  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.435606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  28.88 
 
 		 645 aa  78.6  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0292  iron permease FTR1  29.73 
 
 		 629 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0524  FTR1 family iron permease  26.02 
 
 		 637 aa  78.2  0.0000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.210875  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0822  iron permease FTR1  30.99 
 
 		 396 aa  77  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1255  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  29.96 
 
 		 603 aa  77  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2561  iron permease FTR1  28.08 
 
 		 647 aa  76.6  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1649  FTR1 family iron permease  24.93 
 
 		 696 aa  74.7  0.000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2018  FTR1 family iron permease  24.69 
 
 		 696 aa  74.7  0.000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1830  FTR1 family iron permease  24.93 
 
 		 696 aa  74.3  0.000000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  29.56 
 
 		 643 aa  73.6  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3637  iron permease FTR1  27.84 
 
 		 664 aa  72.8  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0393  hypothetical protein  26.03 
 
 		 570 aa  72.8  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0403  hypothetical protein  26.03 
 
 		 570 aa  72.8  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0482  iron permease FTR1  28.61 
 
 		 649 aa  73.2  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1385  iron permease FTR1  25.61 
 
 		 634 aa  73.2  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2809  Iron permease FTR1  25.8 
 
 		 660 aa  71.2  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0188  iron permease FTR1  28.11 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0228999 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1733  iron permease FTR1  30.69 
 
 		 304 aa  67  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.997501  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4287  iron permease FTR1  28.94 
 
 		 290 aa  67  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486354  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0229  iron permease FTR1  28.03 
 
 		 284 aa  66.2  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25520  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  28.75 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0297463  normal  0.133563 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5173  iron permease FTR1  28.92 
 
 		 314 aa  65.1  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000262497 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3143  iron permease FTR1  28.5 
 
 		 281 aa  65.1  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2612  iron permease FTR1  23.35 
 
 		 308 aa  63.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000110205  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2692  iron permease FTR1  25.56 
 
 		 273 aa  62  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.37589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0839  iron permease FTR1  25.35 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3323  iron permease FTR1  29.27 
 
 		 307 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3473  iron permease FTR1  27.47 
 
 		 308 aa  60.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2597  Iron permease FTR1  29 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1510  hypothetical protein  28.47 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000353289  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1811  iron permease FTR1  31.05 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.668278 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4773  iron permease FTR1  25.81 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1789  iron permease FTR1  27.27 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3314  iron permease FTR1  31.16 
 
 		 281 aa  57  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3898  iron permease FTR1  29.11 
 
 		 537 aa  55.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1952  iron permease FTR1  25.21 
 
 		 304 aa  55.5  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495146  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1568  iron permease FTR1  25.32 
 
 		 304 aa  54.7  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1936  iron permease FTR1  30.17 
 
 		 279 aa  54.3  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0480645 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1660  iron permease FTR1  31.5 
 
 		 278 aa  54.3  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2929  iron permease FTR1  29.95 
 
 		 281 aa  53.9  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00359497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1870  iron permease FTR1  27.96 
 
 		 417 aa  53.5  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0433  iron permease FTR1  33.08 
 
 		 278 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287745 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3367  Iron permease FTR1  29.08 
 
 		 284 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1177  iron permease FTR1  29.5 
 
 		 279 aa  51.6  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0971353  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3348  iron permease FTR1  27.83 
 
 		 677 aa  51.6  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4913  iron permease FTR1  25.59 
 
 		 579 aa  51.2  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1763  Iron permease FTR1  25.85 
 
 		 315 aa  50.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3388  iron permease FTR1  27.35 
 
 		 294 aa  49.7  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2872  Iron permease FTR1  30.77 
 
 		 279 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.121627  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3596  hypothetical protein  29.08 
 
 		 284 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1545  FTR1 family protein  28.79 
 
 		 277 aa  48.5  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.884821  normal  0.11427 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4257  iron permease FTR1  29.66 
 
 		 303 aa  47.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4318  iron permease FTR1  29.66 
 
 		 303 aa  47.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000385507  hitchhiker  0.00248903 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3859  iron permease FTR1  33.1 
 
 		 280 aa  47.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.627947  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2602  iron permease FTR1  20.83 
 
 		 239 aa  47  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000455168  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2264  ferrous iron permease EfeU  27.72 
 
 		 282 aa  46.2  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2040  ferrous iron permease EfeU  27.72 
 
 		 285 aa  46.2  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.19312 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2366  iron permease FTR1  27.72 
 
 		 282 aa  46.6  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0450502  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3403  iron permease FTR1  28.76 
 
 		 702 aa  45.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1914  iron permease FTR1  29.17 
 
 		 281 aa  45.4  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.347806 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>