136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2809 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2809  Iron permease FTR1  100 
 
 		 660 aa  1310    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1385  iron permease FTR1  45.19 
 
 		 634 aa  534  1e-150  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1783  iron permease FTR1  44.88 
 
 		 634 aa  533  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.498306  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2141  FTR1 family iron permease  44.27 
 
 		 639 aa  507  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2132  FTR1 family iron permease  44.27 
 
 		 639 aa  507  9.999999999999999e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0517239 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2252  iron permease FTR1  44.11 
 
 		 639 aa  506  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0763  superoxide dismutase  39.21 
 
 		 647 aa  411  1e-113  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.745778  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0433  fumarate hydratase class II (fumarase C)  37.01 
 
 		 646 aa  403  1e-111  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000013758  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0450  FTR1 family iron permease  36.29 
 
 		 679 aa  401  9.999999999999999e-111  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000168197  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0524  FTR1 family iron permease  35.86 
 
 		 637 aa  386  1e-106  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.210875  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1830  FTR1 family iron permease  32.14 
 
 		 696 aa  338  9.999999999999999e-92  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1649  FTR1 family iron permease  31.94 
 
 		 696 aa  335  1e-90  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2018  FTR1 family iron permease  33.23 
 
 		 696 aa  332  2e-89  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1170  iron permease, FTR1 family  31.08 
 
 		 691 aa  315  1.9999999999999998e-84  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.900718  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0160  iron permease FTR1 family protein  30.38 
 
 		 572 aa  203  9e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.31653 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0822  iron permease FTR1  34.86 
 
 		 396 aa  201  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1510  hypothetical protein  32.72 
 
 		 422 aa  188  2e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000353289  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  34.82 
 
 		 653 aa  166  9e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1255  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  30.03 
 
 		 603 aa  161  3e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1058  iron permease FTR1  32.52 
 
 		 683 aa  150  8e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0352795  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2954  iron permease FTR1  31.56 
 
 		 652 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  33.43 
 
 		 643 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1953  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  30.87 
 
 		 637 aa  148  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.002939  normal  0.431592 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0482  iron permease FTR1  32.22 
 
 		 649 aa  144  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  29.64 
 
 		 645 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  31.55 
 
 		 644 aa  140  6e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5282  iron permease FTR1  29.27 
 
 		 642 aa  135  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1641  iron permease FTR1  29.27 
 
 		 642 aa  135  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3637  iron permease FTR1  28.3 
 
 		 664 aa  134  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5350  iron permease FTR1  29.7 
 
 		 640 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.620494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2302  iron permease FTR1  31.06 
 
 		 652 aa  132  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1817  iron permease FTR1  30 
 
 		 640 aa  131  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.214502 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5945  Pb(II)-uptake protein PbrT  29.81 
 
 		 642 aa  130  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2353  permease  30.09 
 
 		 653 aa  130  8.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2017  iron permease FTR1  29.66 
 
 		 413 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00650927  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69300  hypothetical protein  31.46 
 
 		 633 aa  125  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0723  cytochrome c, class I  33.64 
 
 		 657 aa  125  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694021  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1022  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  31.71 
 
 		 556 aa  124  4e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0049  cytochrome c, class I:Iron permease FTR1  34.32 
 
 		 632 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  29.87 
 
 		 647 aa  120  9e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0180  cytochrome c family protein  34.35 
 
 		 636 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.558942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  29.87 
 
 		 647 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5993  hypothetical protein  31.46 
 
 		 652 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5470  cytochrome c, class I  31.06 
 
 		 631 aa  117  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2561  iron permease FTR1  31.4 
 
 		 647 aa  117  5e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0141  lead uptake protein, putative  35.42 
 
 		 632 aa  117  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2692  iron permease FTR1  33.33 
 
 		 273 aa  114  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.37589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0292  iron permease FTR1  33.6 
 
 		 629 aa  108  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0468  iron permease FTR1  29.71 
 
 		 820 aa  92  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.402804  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1936  iron permease FTR1  32.41 
 
 		 279 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0480645 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0393  hypothetical protein  23.97 
 
 		 570 aa  89.7  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0403  hypothetical protein  23.97 
 
 		 570 aa  89.7  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1870  iron permease FTR1  32.78 
 
 		 417 aa  86.3  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2443  iron permease FTR1  28.78 
 
 		 399 aa  85.9  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2612  iron permease FTR1  31.65 
 
 		 308 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000110205  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0820  iron permease FTR1  28.8 
 
 		 782 aa  82.4  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.594209  hitchhiker  0.0000623566 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3403  iron permease FTR1  37.32 
 
 		 702 aa  79.7  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0839  iron permease FTR1  31.12 
 
 		 308 aa  79  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2435  iron permease FTR1  25.36 
 
 		 743 aa  75.9  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1981  iron permease FTR1  34.23 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5728  iron permease FTR1  26.64 
 
 		 846 aa  73.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2258  iron permease FTR1  33.56 
 
 		 276 aa  73.2  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7009  iron permease FTR1  32.86 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  0.35089 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4468  iron permease FTR1  29.41 
 
 		 779 aa  70.9  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.390175  normal  0.0190609 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1811  iron permease FTR1  33.99 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.668278 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1733  iron permease FTR1  32.81 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.997501  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1660  iron permease FTR1  35.79 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25520  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  32.13 
 
 		 294 aa  66.6  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0297463  normal  0.133563 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4287  iron permease FTR1  32.6 
 
 		 290 aa  66.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486354  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3367  Iron permease FTR1  34.55 
 
 		 284 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2597  Iron permease FTR1  30.96 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5686  iron permease FTR1  30.92 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.435606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2929  iron permease FTR1  32.45 
 
 		 281 aa  65.1  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00359497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0433  iron permease FTR1  34.04 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287745 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3596  hypothetical protein  33.16 
 
 		 284 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1777  iron permease FTR1  32.7 
 
 		 691 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2872  Iron permease FTR1  29.74 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.121627  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0188  iron permease FTR1  32.98 
 
 		 283 aa  62  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0228999 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3859  iron permease FTR1  27.57 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.627947  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5173  iron permease FTR1  32.47 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000262497 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4913  iron permease FTR1  32.82 
 
 		 579 aa  60.8  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1914  iron permease FTR1  30.67 
 
 		 281 aa  60.1  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1954  iron permease FTR1  30.39 
 
 		 289 aa  60.1  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.860822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1177  iron permease FTR1  34.95 
 
 		 279 aa  60.1  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0971353  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2784  iron permease FTR1  31.35 
 
 		 281 aa  59.7  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1070  iron permease FTR1  27.31 
 
 		 280 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.599025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3143  iron permease FTR1  30.41 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2875  iron permease FTR1  29.18 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1955  iron permease FTR1  26.45 
 
 		 281 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0621861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5535  Iron permease FTR1  26.87 
 
 		 280 aa  55.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2033  FTR1 family iron permease  27.31 
 
 		 280 aa  56.2  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2245  iron permease FTR1  26.87 
 
 		 280 aa  56.2  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.998183  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3348  iron permease FTR1  28.36 
 
 		 677 aa  56.2  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2330  High-affinity Fe2+/Pb2+ permease-like protein  28.12 
 
 		 325 aa  56.2  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00178906  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2124  iron permease FTR1  26.43 
 
 		 280 aa  56.2  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.640841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5870  iron permease FTR1  26.43 
 
 		 280 aa  55.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.647838  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2207  iron permease FTR1  26.43 
 
 		 280 aa  55.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2231  iron permease FTR1  26.43 
 
 		 280 aa  55.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1545  FTR1 family protein  34.04 
 
 		 277 aa  54.3  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.884821  normal  0.11427 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3473  iron permease FTR1  32.81 
 
 		 308 aa  53.9  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.361735 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>