153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3596 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3596  hypothetical protein  100 
 
 
284 aa  558  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3367  Iron permease FTR1  94.72 
 
 
284 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226405  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2872  Iron permease FTR1  83.82 
 
 
279 aa  413  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.121627  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1811  iron permease FTR1  66.29 
 
 
283 aa  346  3e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.668278 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3859  iron permease FTR1  66.67 
 
 
280 aa  339  2.9999999999999998e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.627947  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1733  iron permease FTR1  58.6 
 
 
304 aa  331  8e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.997501  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2597  Iron permease FTR1  59.79 
 
 
290 aa  331  1e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3143  iron permease FTR1  58.61 
 
 
281 aa  315  8e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2929  iron permease FTR1  57.99 
 
 
281 aa  313  1.9999999999999998e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00359497  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1545  FTR1 family protein  58.99 
 
 
277 aa  308  8e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.884821  normal  0.11427 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2366  iron permease FTR1  59.12 
 
 
282 aa  308  8e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0450502  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2264  ferrous iron permease EfeU  59.12 
 
 
282 aa  308  8e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2040  ferrous iron permease EfeU  59.49 
 
 
285 aa  308  8e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.19312 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2784  iron permease FTR1  56.99 
 
 
281 aa  298  6e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3314  iron permease FTR1  61.35 
 
 
281 aa  297  2e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2106  iron permease FTR1 family protein  59.04 
 
 
276 aa  293  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.178558  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1954  iron permease FTR1  58.82 
 
 
289 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.860822  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01026  hypothetical protein  59.04 
 
 
276 aa  292  4e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.377125  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1258  iron permease FTR1 family protein  59.04 
 
 
276 aa  292  4e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.20725  normal  0.52486 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2579  FTR1 family protein  59.04 
 
 
276 aa  292  4e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1132  iron permease FTR1 family protein  59.04 
 
 
276 aa  292  4e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0198612  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1136  FTR1 family iron permease  59.04 
 
 
276 aa  292  4e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.161686  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01019  putative membrane protein  59.04 
 
 
279 aa  292  5e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.348057  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1660  iron permease FTR1  57.41 
 
 
278 aa  275  5e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0433  iron permease FTR1  57.25 
 
 
278 aa  271  6e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00287745 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25520  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  41.61 
 
 
294 aa  186  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0297463  normal  0.133563 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0188  iron permease FTR1  40 
 
 
283 aa  186  5e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0228999 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1914  iron permease FTR1  42.11 
 
 
281 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3898  iron permease FTR1  42.31 
 
 
537 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5686  iron permease FTR1  36.84 
 
 
287 aa  166  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.435606  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0229  iron permease FTR1  37.41 
 
 
284 aa  163  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4287  iron permease FTR1  39.11 
 
 
290 aa  162  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486354  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4913  iron permease FTR1  40.88 
 
 
579 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7009  iron permease FTR1  38.27 
 
 
291 aa  155  9e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  0.35089 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3352  iron permease FTR1  40.28 
 
 
277 aa  150  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.404846  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4773  iron permease FTR1  36.36 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3388  iron permease FTR1  36.33 
 
 
294 aa  137  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3348  iron permease FTR1  37.5 
 
 
677 aa  135  7.000000000000001e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1777  iron permease FTR1  35.23 
 
 
691 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3403  iron permease FTR1  36.12 
 
 
702 aa  125  6e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2612  iron permease FTR1  29.37 
 
 
308 aa  122  8e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000110205  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1177  iron permease FTR1  35.45 
 
 
279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0971353  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2875  iron permease FTR1  34.75 
 
 
280 aa  120  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1789  iron permease FTR1  30.1 
 
 
315 aa  120  3.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5173  iron permease FTR1  33.71 
 
 
314 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000262497 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1952  iron permease FTR1  32.93 
 
 
304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495146  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1568  iron permease FTR1  30.88 
 
 
304 aa  112  7.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4257  iron permease FTR1  29.73 
 
 
303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3323  iron permease FTR1  31.56 
 
 
307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4318  iron permease FTR1  30.07 
 
 
303 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000385507  hitchhiker  0.00248903 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1834  iron permease FTR1  32.37 
 
 
288 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163431  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0839  iron permease FTR1  27.87 
 
 
308 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1763  Iron permease FTR1  28.05 
 
 
315 aa  105  9e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3473  iron permease FTR1  30.74 
 
 
308 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1870  iron permease FTR1  34.12 
 
 
417 aa  98.2  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2421  high-affinity iron transporter  33 
 
 
305 aa  97.4  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.328401  normal  0.0402063 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1070  iron permease FTR1  30.63 
 
 
280 aa  96.7  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.599025  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2124  iron permease FTR1  28.94 
 
 
280 aa  96.3  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.640841  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2245  iron permease FTR1  28.94 
 
 
280 aa  95.9  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.998183  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2231  iron permease FTR1  30.26 
 
 
280 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3631  iron permease FTR1  31.37 
 
 
279 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0110382 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5870  iron permease FTR1  30.26 
 
 
280 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.647838  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2207  iron permease FTR1  30.26 
 
 
280 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5535  Iron permease FTR1  30.26 
 
 
280 aa  93.6  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2033  FTR1 family iron permease  29.69 
 
 
280 aa  88.2  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0304  hypothetical protein  31.65 
 
 
276 aa  88.6  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.190446 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1955  iron permease FTR1  28.62 
 
 
281 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0621861  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0883  FTR1 family iron permease  28.91 
 
 
280 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1923  FTR1 family iron permease  28.91 
 
 
280 aa  87  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1742  OFeT family iron transporter  28.91 
 
 
280 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0322131  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0012  OFeT family iron transporter  28.91 
 
 
280 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0608  OFeT family iron transporter  28.91 
 
 
280 aa  87  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.189417  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0510  OFeT family iron transporter  28.91 
 
 
280 aa  87  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0912  OFeT family iron transporter  28.91 
 
 
280 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.29643  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3150  oxidase-dependent Fe2+ transporter, (OFeT)family, FTR1-like  30.58 
 
 
281 aa  86.7  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.92636  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1399  iron permease FTR1  30.59 
 
 
281 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0193139  normal  0.052775 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2353  permease  32.69 
 
 
653 aa  83.6  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0383  FTR1 family iron permease  30.66 
 
 
278 aa  81.3  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.978993  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3854  iron permease FTR1  31.71 
 
 
277 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0331  FTR1 family iron permease  30.66 
 
 
276 aa  81.3  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  35.71 
 
 
653 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3306  iron permease FTR1  29.24 
 
 
273 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.223999  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64944  plasma membrane iron permease  23.7 
 
 
379 aa  76.6  0.0000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2302  iron permease FTR1  31.16 
 
 
652 aa  75.9  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3198  iron permease FTR1  28.67 
 
 
280 aa  75.9  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.521431  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3605  iron permease FTR1  29.1 
 
 
276 aa  73.9  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80129  normal  0.423145 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1170  iron permease, FTR1 family  35.9 
 
 
691 aa  73.6  0.000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.900718  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6336  Iron permease FTR1  31.34 
 
 
278 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0433  fumarate hydratase class II (fumarase C)  31.94 
 
 
646 aa  72.4  0.000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000013758  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0107  iron permease FTR1  31.66 
 
 
277 aa  71.6  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0744314 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2103  Iron permease FTR1  29.23 
 
 
277 aa  71.2  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0822  iron permease FTR1  29.74 
 
 
396 aa  70.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2018  FTR1 family iron permease  37.06 
 
 
696 aa  69.7  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1830  FTR1 family iron permease  36.24 
 
 
696 aa  68.6  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0141  lead uptake protein, putative  31.46 
 
 
632 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1649  FTR1 family iron permease  36.24 
 
 
696 aa  67.8  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  32.42 
 
 
647 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5470  cytochrome c, class I  30.36 
 
 
631 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  31.31 
 
 
645 aa  67  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1783  iron permease FTR1  31.66 
 
 
634 aa  67  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.498306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>