143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0160 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0160  iron permease FTR1 family protein  100 
 
 		 572 aa  1162    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.31653 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1255  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  52.23 
 
 		 603 aa  545  1e-154  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2141  FTR1 family iron permease  30.84 
 
 		 639 aa  233  6e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2132  FTR1 family iron permease  30.84 
 
 		 639 aa  233  6e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0517239 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2252  iron permease FTR1  30.84 
 
 		 639 aa  233  6e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1385  iron permease FTR1  30.71 
 
 		 634 aa  231  3e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1783  iron permease FTR1  29.88 
 
 		 634 aa  225  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.498306  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1510  hypothetical protein  36.25 
 
 		 422 aa  217  4e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000353289  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0450  FTR1 family iron permease  34.47 
 
 		 679 aa  209  1e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000168197  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0763  superoxide dismutase  33.04 
 
 		 647 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.745778  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0433  fumarate hydratase class II (fumarase C)  31.49 
 
 		 646 aa  198  2.0000000000000003e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000013758  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2809  Iron permease FTR1  30.38 
 
 		 660 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0524  FTR1 family iron permease  33.72 
 
 		 637 aa  191  4e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.210875  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0822  iron permease FTR1  41.54 
 
 		 396 aa  179  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1649  FTR1 family iron permease  31.97 
 
 		 696 aa  172  2e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1830  FTR1 family iron permease  31.97 
 
 		 696 aa  171  3e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  30.53 
 
 		 653 aa  167  4e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2018  FTR1 family iron permease  32.34 
 
 		 696 aa  167  4e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1022  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  38.85 
 
 		 556 aa  162  1e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0180  cytochrome c family protein  34.64 
 
 		 636 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.558942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3637  iron permease FTR1  32.53 
 
 		 664 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  34.3 
 
 		 647 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  34.64 
 
 		 647 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1170  iron permease, FTR1 family  31.02 
 
 		 691 aa  157  4e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.900718  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  30.42 
 
 		 645 aa  156  9e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69300  hypothetical protein  31.7 
 
 		 633 aa  153  8e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1817  iron permease FTR1  34.54 
 
 		 640 aa  151  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.214502 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5470  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 631 aa  150  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0049  cytochrome c, class I:Iron permease FTR1  32.96 
 
 		 632 aa  150  8e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0141  lead uptake protein, putative  32.35 
 
 		 632 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5282  iron permease FTR1  31.73 
 
 		 642 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1641  iron permease FTR1  31.73 
 
 		 642 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  34.96 
 
 		 643 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5945  Pb(II)-uptake protein PbrT  35.48 
 
 		 642 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1058  iron permease FTR1  30.11 
 
 		 683 aa  146  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0352795  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2353  permease  33.55 
 
 		 653 aa  146  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2017  iron permease FTR1  29.57 
 
 		 413 aa  146  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00650927  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5993  hypothetical protein  34 
 
 		 652 aa  143  7e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5350  iron permease FTR1  32.19 
 
 		 640 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.620494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2302  iron permease FTR1  36.95 
 
 		 652 aa  142  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0292  iron permease FTR1  30.48 
 
 		 629 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2692  iron permease FTR1  35.34 
 
 		 273 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.37589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0482  iron permease FTR1  32.29 
 
 		 649 aa  134  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2954  iron permease FTR1  31.7 
 
 		 652 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  31.91 
 
 		 644 aa  128  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2561  iron permease FTR1  30.05 
 
 		 647 aa  126  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0723  cytochrome c, class I  33.79 
 
 		 657 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694021  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0393  hypothetical protein  32.53 
 
 		 570 aa  121  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0403  hypothetical protein  32.53 
 
 		 570 aa  121  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1953  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  29.13 
 
 		 637 aa  117  7.999999999999999e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.002939  normal  0.431592 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1936  iron permease FTR1  37 
 
 		 279 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0480645 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2258  iron permease FTR1  36.12 
 
 		 276 aa  93.6  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1981  iron permease FTR1  36.12 
 
 		 276 aa  93.6  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2612  iron permease FTR1  34.17 
 
 		 308 aa  92  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000110205  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2435  iron permease FTR1  27.34 
 
 		 743 aa  87  9e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0839  iron permease FTR1  32.68 
 
 		 308 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3473  iron permease FTR1  34.03 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2443  iron permease FTR1  26.2 
 
 		 399 aa  80.5  0.00000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4287  iron permease FTR1  30.58 
 
 		 290 aa  79.3  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486354  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5728  iron permease FTR1  26.56 
 
 		 846 aa  76.6  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5173  iron permease FTR1  33.17 
 
 		 314 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000262497 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4913  iron permease FTR1  37.86 
 
 		 579 aa  73.9  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0468  iron permease FTR1  27.78 
 
 		 820 aa  73.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.402804  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1870  iron permease FTR1  28.37 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0820  iron permease FTR1  26.04 
 
 		 782 aa  71.2  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.594209  hitchhiker  0.0000623566 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1789  iron permease FTR1  34.84 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5686  iron permease FTR1  29.46 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.435606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3859  iron permease FTR1  36.05 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.627947  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25520  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  31.51 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0297463  normal  0.133563 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3367  Iron permease FTR1  36.49 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0229  iron permease FTR1  29.54 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1177  iron permease FTR1  36.23 
 
 		 279 aa  70.1  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0971353  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3898  iron permease FTR1  33.57 
 
 		 537 aa  69.7  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2929  iron permease FTR1  32.06 
 
 		 281 aa  70.1  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00359497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0188  iron permease FTR1  31.19 
 
 		 283 aa  69.3  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0228999 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3323  iron permease FTR1  37.06 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3596  hypothetical protein  36.67 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1660  iron permease FTR1  34.55 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1733  iron permease FTR1  32.27 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.997501  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3143  iron permease FTR1  29.81 
 
 		 281 aa  67  0.0000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1545  FTR1 family protein  31.58 
 
 		 277 aa  66.6  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.884821  normal  0.11427 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4257  iron permease FTR1  31.75 
 
 		 303 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4318  iron permease FTR1  31.75 
 
 		 303 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000385507  hitchhiker  0.00248903 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1763  Iron permease FTR1  33.64 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1811  iron permease FTR1  33.03 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.668278 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7009  iron permease FTR1  29.39 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  0.35089 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3403  iron permease FTR1  32.71 
 
 		 702 aa  63.5  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1914  iron permease FTR1  29.28 
 
 		 281 aa  62.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2602  iron permease FTR1  33.78 
 
 		 239 aa  62.4  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000455168  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4468  iron permease FTR1  26.88 
 
 		 779 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.390175  normal  0.0190609 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1955  iron permease FTR1  33.33 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0621861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2784  iron permease FTR1  30.95 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2872  Iron permease FTR1  32.04 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.121627  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0433  iron permease FTR1  34.97 
 
 		 278 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287745 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01019  putative membrane protein  29.86 
 
 		 279 aa  59.3  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.348057  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3388  iron permease FTR1  31.84 
 
 		 294 aa  59.3  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1258  iron permease FTR1 family protein  29.86 
 
 		 276 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.20725  normal  0.52486 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1132  iron permease FTR1 family protein  29.86 
 
 		 276 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0198612  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1136  FTR1 family iron permease  29.86 
 
 		 276 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.161686  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2579  FTR1 family protein  29.86 
 
 		 276 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>